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GSEA分析數(shù)據(jù)準備如果使用在線的Gene sets database椭懊，則只需要準備Expression dataset文件(.txt)桌粉，Expressio...
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第五章 探索性數(shù)據(jù)分析簡介探索性數(shù)據(jù)分析（exploratory data analysis行贪， EDA）：使用可視化方法和數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換來系統(tǒng)化地探索數(shù)據(jù)丝格。EDA 是一個可...
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第三章 使用dplyr進行數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換加載 tidyverse 時逗嫡，仔細查看輸出的沖突信息锦茁，它會告訴你 dplyr 覆蓋了基礎 R 包中的哪些函數(shù)炫隶。如果想要在加載 dplyr 后使用...
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ggplot2作圖設置坐標軸的起始位置當使用ggplot2作圖的時候有限制坐標軸的范圍的需求時可以使用的設置函數(shù)有3個：xlim( ) or ylim( )scale_x_conti...
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第一章 使用ggplot2進行數(shù)據(jù)可視化騰訊云鏡像：options("repos" = c(CRAN="http://mirrors.cloud.tencent.com/CRAN/[h...
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ggplot2圖例設置ggplot2對圖例的設置主要為guides()功能下的guide_colorbar()和guide_legend()兩個函數(shù)： guide_c...
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SRA數(shù)據(jù)(2)------SRA數(shù)據(jù)處理
上次分享我們通過兩種方式下載得到了SRA數(shù)據(jù)存璃，今天就開始對SRA進行處理（以SRR5489805為例）仑荐。SRA（Sequence ReadArc...
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SRA數(shù)據(jù)(1)------SRA數(shù)據(jù)下載一.prefetch下載： 安裝SRA Toolkit： 1.下載Toolkit：進入下面的網(wǎng)址，選擇適合自己電腦的版本下載纵东，網(wǎng)速不好的推薦掛后...
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測序技術眾所周知粘招，DNA序列就是有TCGA四種堿基按照一定的排列順序排列而成，但是如何才能將每一個位置上的堿基識別出來卻是一個很難解決的問題偎球，正是因為這...