autoSeqMan:批量Sanger測(cè)序結(jié)果處理殉农、拼接

昨天送樣的sanger測(cè)序結(jié)果返回來(lái)了刀脏,可是看著ab1文件和seq文件我就有點(diǎn)頭疼,一個(gè)一個(gè)來(lái)處理肯定是不適合我這個(gè)懶人的超凳,一定要來(lái)批量處理的愈污,于是乎找到了autoSeqMan這個(gè)軟件。
相關(guān)論文:https://doi.org/10.24272/j.issn.2095-8137.2018.027
要使用這個(gè)軟件轮傍,需要安裝DNASTAR 7以上的版本還有這個(gè)軟件本身暂雹。
打開軟件:

軟件首頁(yè)界面

點(diǎn)擊Rename
rename

在左邊找到ab1所在文件夾,在Delimiter一格輸入分隔符创夜,如我這次的是“_"杭跪,F(xiàn)irst index指的是,在分隔符分開后第幾個(gè)元素是你的樣品名字驰吓,我這里的A-3/B-3都是第二個(gè)涧尿,所以填2。點(diǎn)擊下方rename后進(jìn)入下一步檬贰。
點(diǎn)擊Classification
Classification

在Delimiter一格輸入分隔樣品名的分隔符后现斋,在subfolder一格會(huì)顯示對(duì)應(yīng)的樣品名,如果沒(méi)錯(cuò)點(diǎn)擊Classification就會(huì)把各自的ab1文件分別放入對(duì)應(yīng)樣品名的文件夾中偎蘸。

歸類后

再次在上方選擇Assembly,確認(rèn)好DNASTAR路徑和輸出文件格式后瞬内,直接點(diǎn)擊Assemble即可迷雪,軟件會(huì)自動(dòng)打開相應(yīng)的模塊并且完成組裝。
組裝

在rename_classOut文件夾中就可以找到組裝好的序列文件了虫蝶。

?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請(qǐng)聯(lián)系作者
  • 序言:七十年代末章咧,一起剝皮案震驚了整個(gè)濱河市,隨后出現(xiàn)的幾起案子能真,更是在濱河造成了極大的恐慌赁严,老刑警劉巖扰柠,帶你破解...
    沈念sama閱讀 206,214評(píng)論 6 481
  • 序言:濱河連續(xù)發(fā)生了三起死亡事件,死亡現(xiàn)場(chǎng)離奇詭異疼约,居然都是意外死亡卤档,警方通過(guò)查閱死者的電腦和手機(jī),發(fā)現(xiàn)死者居然都...
    沈念sama閱讀 88,307評(píng)論 2 382
  • 文/潘曉璐 我一進(jìn)店門程剥,熙熙樓的掌柜王于貴愁眉苦臉地迎上來(lái)劝枣,“玉大人,你說(shuō)我怎么就攤上這事织鲸√蛱冢” “怎么了?”我有些...
    開封第一講書人閱讀 152,543評(píng)論 0 341
  • 文/不壞的土叔 我叫張陵搂擦,是天一觀的道長(zhǎng)稳诚。 經(jīng)常有香客問(wèn)我,道長(zhǎng)瀑踢,這世上最難降的妖魔是什么扳还? 我笑而不...
    開封第一講書人閱讀 55,221評(píng)論 1 279
  • 正文 為了忘掉前任,我火速辦了婚禮丘损,結(jié)果婚禮上普办,老公的妹妹穿的比我還像新娘。我一直安慰自己徘钥,他們只是感情好衔蹲,可當(dāng)我...
    茶點(diǎn)故事閱讀 64,224評(píng)論 5 371
  • 文/花漫 我一把揭開白布。 她就那樣靜靜地躺著呈础,像睡著了一般舆驶。 火紅的嫁衣襯著肌膚如雪。 梳的紋絲不亂的頭發(fā)上而钞,一...
    開封第一講書人閱讀 49,007評(píng)論 1 284
  • 那天沙廉,我揣著相機(jī)與錄音,去河邊找鬼臼节。 笑死撬陵,一個(gè)胖子當(dāng)著我的面吹牛,可吹牛的內(nèi)容都是我干的网缝。 我是一名探鬼主播巨税,決...
    沈念sama閱讀 38,313評(píng)論 3 399
  • 文/蒼蘭香墨 我猛地睜開眼,長(zhǎng)吁一口氣:“原來(lái)是場(chǎng)噩夢(mèng)啊……” “哼粉臊!你這毒婦竟也來(lái)了草添?” 一聲冷哼從身側(cè)響起,我...
    開封第一講書人閱讀 36,956評(píng)論 0 259
  • 序言:老撾萬(wàn)榮一對(duì)情侶失蹤扼仲,失蹤者是張志新(化名)和其女友劉穎远寸,沒(méi)想到半個(gè)月后抄淑,有當(dāng)?shù)厝嗽跇淞掷锇l(fā)現(xiàn)了一具尸體,經(jīng)...
    沈念sama閱讀 43,441評(píng)論 1 300
  • 正文 獨(dú)居荒郊野嶺守林人離奇死亡驰后,尸身上長(zhǎng)有42處帶血的膿包…… 初始之章·張勛 以下內(nèi)容為張勛視角 年9月15日...
    茶點(diǎn)故事閱讀 35,925評(píng)論 2 323
  • 正文 我和宋清朗相戀三年肆资,在試婚紗的時(shí)候發(fā)現(xiàn)自己被綠了乳规。 大學(xué)時(shí)的朋友給我發(fā)了我未婚夫和他白月光在一起吃飯的照片映九。...
    茶點(diǎn)故事閱讀 38,018評(píng)論 1 333
  • 序言:一個(gè)原本活蹦亂跳的男人離奇死亡,死狀恐怖冤馏,靈堂內(nèi)的尸體忽然破棺而出监署,到底是詐尸還是另有隱情颤专,我是刑警寧澤,帶...
    沈念sama閱讀 33,685評(píng)論 4 322
  • 正文 年R本政府宣布钠乏,位于F島的核電站栖秕,受9級(jí)特大地震影響,放射性物質(zhì)發(fā)生泄漏晓避。R本人自食惡果不足惜簇捍,卻給世界環(huán)境...
    茶點(diǎn)故事閱讀 39,234評(píng)論 3 307
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一處隱蔽的房頂上張望俏拱。 院中可真熱鬧暑塑,春花似錦、人聲如沸锅必。這莊子的主人今日做“春日...
    開封第一講書人閱讀 30,240評(píng)論 0 19
  • 文/蒼蘭香墨 我抬頭看了看天上的太陽(yáng)搞隐。三九已至驹愚,卻和暖如春,著一層夾襖步出監(jiān)牢的瞬間劣纲,已是汗流浹背逢捺。 一陣腳步聲響...
    開封第一講書人閱讀 31,464評(píng)論 1 261
  • 我被黑心中介騙來(lái)泰國(guó)打工, 沒(méi)想到剛下飛機(jī)就差點(diǎn)兒被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留癞季,地道東北人劫瞳。 一個(gè)月前我還...
    沈念sama閱讀 45,467評(píng)論 2 352
  • 正文 我出身青樓,卻偏偏與公主長(zhǎng)得像绷柒,于是被迫代替她去往敵國(guó)和親柠新。 傳聞我的和親對(duì)象是個(gè)殘疾皇子,可洞房花燭夜當(dāng)晚...
    茶點(diǎn)故事閱讀 42,762評(píng)論 2 345

推薦閱讀更多精彩內(nèi)容