昨天送樣的sanger測(cè)序結(jié)果返回來(lái)了刀脏,可是看著ab1文件和seq文件我就有點(diǎn)頭疼,一個(gè)一個(gè)來(lái)處理肯定是不適合我這個(gè)懶人的超凳,一定要來(lái)批量處理的愈污,于是乎找到了autoSeqMan這個(gè)軟件。
相關(guān)論文:https://doi.org/10.24272/j.issn.2095-8137.2018.027
要使用這個(gè)軟件轮傍,需要安裝DNASTAR 7以上的版本還有這個(gè)軟件本身暂雹。
打開軟件:
點(diǎn)擊Rename
在左邊找到ab1所在文件夾,在Delimiter一格輸入分隔符创夜,如我這次的是“_"杭跪,F(xiàn)irst index指的是,在分隔符分開后第幾個(gè)元素是你的樣品名字驰吓,我這里的A-3/B-3都是第二個(gè)涧尿,所以填2。點(diǎn)擊下方rename后進(jìn)入下一步檬贰。
點(diǎn)擊Classification
在Delimiter一格輸入分隔樣品名的分隔符后现斋,在subfolder一格會(huì)顯示對(duì)應(yīng)的樣品名,如果沒(méi)錯(cuò)點(diǎn)擊Classification就會(huì)把各自的ab1文件分別放入對(duì)應(yīng)樣品名的文件夾中偎蘸。
再次在上方選擇Assembly,確認(rèn)好DNASTAR路徑和輸出文件格式后瞬内,直接點(diǎn)擊Assemble即可迷雪,軟件會(huì)自動(dòng)打開相應(yīng)的模塊并且完成組裝。
在rename_classOut文件夾中就可以找到組裝好的序列文件了虫蝶。