多組學(xué)文章思路解析4-突變,轉(zhuǎn)錄荞下,蛋白三組學(xué)聯(lián)合分析

關(guān)于多組學(xué)數(shù)據(jù)挖掘分析伶选, 我們之前討論了,蛋白組與糖基化組學(xué)分析尖昏,蛋白組與DNA突變的聯(lián)合分析仰税,蛋白組與轉(zhuǎn)錄組的聯(lián)合分析。好像作者都會(huì)做蛋白組學(xué)抽诉,估計(jì)是因?yàn)槠渌M學(xué)很久以前一般做過了陨簇,蛋白組比較新穎。?

??? 多組學(xué)分析思路通常是各個(gè)組學(xué)分開分析迹淌,分開描述討論河绽,而文獻(xiàn)中通常以某個(gè)組學(xué)作為主要線索,其他組學(xué)穿插滲透唉窃,那么如何滲透呢耙饰,滲透的目的是為了更好回答科學(xué)問題。腫瘤中大樣本量必然討論分型的問題纹份,各組學(xué)的分型結(jié)果是否一致苟跪,為什么有差異廷痘。作者的數(shù)據(jù)分型結(jié)果是否與比較公認(rèn)的臨床分型,或者其他人研究隊(duì)列是否一致件已,為什么笋额?

??? DNA突變與轉(zhuǎn)錄組、蛋白組篷扩,我們常會(huì)討論DNA突變是如何影響基因表達(dá)量變化的兄猩,如果沒有影響,又是影響哪些別的基因鉴未?修飾類組學(xué)厦滤,我們常討論蛋白修飾對(duì)蛋白表達(dá)量的影響,修飾組與純表達(dá)量是否一致歼狼。轉(zhuǎn)錄組與蛋白組比較尷尬,有一定的上下游關(guān)系享怀,但不是調(diào)控關(guān)系羽峰。我們?cè)谏弦黄谥辈ブ锌吹搅宿D(zhuǎn)錄組與蛋白組的相關(guān)性竟然跟生存預(yù)后相關(guān),可以作為診斷指標(biāo)添瓷,將相關(guān)性運(yùn)用到了極致梅屉。

從本期開始,我們討論3個(gè)及以上組學(xué)的分析思路鳞贷。3個(gè)組學(xué)怎么兼顧坯汤,哪個(gè)是主線,哪些是輔助搀愧,3個(gè)組學(xué)可以回答什么樣的科學(xué)問題呢惰聂?解決問題不難,難的是不知道問題是什么咱筛?


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