????? 多組學分析是指兩個及以上組學炉峰,同時做數(shù)據(jù)分析。通常是同一批樣本的多組學分析脉执,常見有基因組疼阔、外顯子、轉錄組(含非編碼)适瓦、蛋白組竿开、磷酸化組谱仪、代謝組等,也包含各類修飾組學否彩,如DNA甲基化疯攒、m6A、蛋白的各類修飾列荔。?
?????? 近兩年的高分組學文章以多組學為主敬尺,比如“21分組學文章解析公開課”(B站鏈接:https://www.bilibili.com/video/BV1dC4y147xu)提到的糖尿病研究,基于蛋白組學和蛋白磷酸化組學的數(shù)據(jù)關聯(lián)挖掘分析挖掘胰島素分泌障礙相關的潛在分子機制贴浙;Cancer cell結直腸癌多組學文章解讀(B站鏈接:https://www.bilibili.com/video/BV1bf4y1X7qJ)使用外顯子測序砂吞、蛋白組學、蛋白磷酸化組學對轉移與非轉移的結直腸進行比較崎溃,尋找差異蜻直。
???? 那么多組學數(shù)據(jù)應該如何分析呢?多組學文章的一般框架是什么袁串?組學數(shù)據(jù)如何與臨床信息關聯(lián)概而,如何相互滲透,如何深入的反應分子之間調(diào)控關系囱修。如果給你一批相似的數(shù)據(jù)赎瑰,你能否寫出20分+的文章?有太多的問題需要思考回答破镰,從本期開始餐曼,我們詳細交流討論多組學數(shù)據(jù)分析挖掘的問題。?
本周我們先看蛋白組學與蛋白糖基化的聯(lián)合分析的文獻鲜漩。
主要討論內(nèi)容:
多組學發(fā)高水平文章的基本思路是什么 源譬? 如何做關聯(lián)分析 ?
(1)蛋白質(zhì)糖基化修飾分析思路宇整,說明什么生物學問題 瓶佳?
(2)如何在臨床數(shù)據(jù)芋膘、蛋白表達定量和糖基化修飾水平之間建立關聯(lián) 鳞青?
(3)糖基化修飾分析如何揭示分子機制,揭示調(diào)控網(wǎng)絡 为朋?
(4)本篇文章該怎么分析臂拓,可以讓影響因子提高一個水平?
以下是視頻錄屏鏈接习寸,有需要的老師可以觀看胶惰。
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