Linux實操（從入門到入墳）
1.miniconda上Linux
這里要用wget奸披，使用提供的服務(wù)器的話網(wǎng)址是https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh,注意這里裝錯了的話下一步執(zhí)行不了。如果順利慨代，現(xiàn)在這個文件就到了你的服務(wù)器里更哄。
下一步使用bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh來安裝它芋齿，一路回車加yes
記得激活source ~/.bashrc
2.上鏡像（用于加速下載）
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes
3.使用conda
conda list查看當前服務(wù)器上安裝的所有軟件列表
conda install fastqc -y安裝軟件
conda install fastqc=0.11.7 -y安裝指定版本軟件
fastqc --help調(diào)用幫助文檔，可以建議軟件是否順利安裝
conda remove fastqc -y卸載軟件
此處必修結(jié)束
4.conda環(huán)境的創(chuàng)建
conda info --envs查看當前conda有哪些環(huán)境
conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y如處理轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)時成翩，我們創(chuàng)建了一個python3的conda環(huán)境
conda activate rna-seq激活這一環(huán)境（不激活依然在默認環(huán)境下）
如何退出觅捆？conda deactivate
