1. 聚類算法簡介
聚類的目標是使同一類對象的相似度盡可能地大楼雹;不同類對象之間的相似度盡可能地小脐雪。目前聚類的方法很多详幽,根據(jù)基本思想的不同筛欢,大致可以將聚類算法分為五大類:層次聚類算法、分割聚類算法唇聘、基于約束的聚類算法版姑、機器學(xué)習(xí)中的聚類算法和用于高維度的聚類算法。
以下實現(xiàn)主要選取了基于劃分的Kmeans算法和基于密度的DBSCAN算法來處理
1.1 基于劃分的Kmeans算法
一種典型的劃分聚類算法迟郎,它用一個聚類的中心來代表一個簇剥险,即在迭代過程中選擇的聚點不一定是聚類中的一個點。其目的是使各個簇(共k個)中的數(shù)據(jù)點與所在簇質(zhì)心的誤差平方和SSE(Sum of Squared Error)達到最小宪肖,這也是評價K-means算法最后聚類效果的評價標準表制。
算法的詳細原理可自行Google或Wiki。
1.2 基于密度的DBSCAN算法
一種典型的基于密度的聚類算法控乾,該算法采用空間索引技術(shù)來搜索對象的鄰域么介,引入了“核心對象”和“密度可達”等概念,從核心對象出發(fā)阱持,把所有密度可達的對象組成一個簇。簡單的說就是根據(jù)一個根據(jù)對象的密度不斷擴展的過程的算法魔熏。一個對象O的密度可以用靠近O的對象數(shù)來判斷衷咽。
在DBSCAN算法中將數(shù)據(jù)點分為一下三類:
核心點:在半徑Eps內(nèi)含有超過MinPts數(shù)目的點
邊界點:在半徑Eps內(nèi)點的數(shù)量小于MinPts,但是落在核心點的鄰域內(nèi)
噪音點:既不是核心點也不是邊界點的點
這里有兩個量蒜绽,一個是半徑Eps镶骗,另一個是指定的數(shù)目MinPts。
2. 用戶地理位置信息的的聚類實現(xiàn)
本實驗用Python實現(xiàn)躲雅,依賴numpy, pandas, sklearn, scipy等科學(xué)計算library鼎姊。
數(shù)據(jù)來自收集得到的用戶的地理位置信息,即經(jīng)緯度數(shù)據(jù)的序列集。
xy = numpy.array([[116.455788, 39.920767], [116.456065, 39.920965], [116.452312, 39.92304], [116.421385, 39.989539],
[116.455685, 39.92069], [116.455876, 39.920845], [116.455973, 39.920902], [116.455645, 39.920657],
[116.456022, 39.920934], [116.455685, 39.920691], [116.456023, 39.920671], [116.45596, 39.920864],
[116.455522, 39.920856], [116.455276, 39.920407], [116.455799, 39.920867],
[116.455349, 39.920425], [116.45511, 39.920377], [116.455318, 39.920442], [116.455298, 39.920474],
[116.455839, 39.920636], [116.455979, 39.921168], [116.454281, 39.920006], [116.45598, 39.920612],
[116.45388, 39.919584], [116.455474, 39.920737], [116.456009, 39.920641], [116.455439, 39.920574],
[116.455759, 39.920841], [116.455838, 39.920644], [116.455983, 39.920847],
[116.459803, 39.922041], [116.456029, 39.92088], [116.455539, 39.920603], [116.455989, 39.920851],
[116.455719, 39.920789], [116.45601, 39.92082], [116.456229, 39.920564], [116.455906, 39.920771],
[116.456248, 39.920868], [116.455805, 39.920544], [116.455896, 39.920758], [116.43692, 39.926767],
[116.454672, 39.92024], [116.454813, 39.917848], [116.381415, 40.00875], [116.422925, 39.980757],
[116.422849, 39.9808], [116.38107, 40.009217], [116.456078, 39.920747], [116.455242, 39.919515],
[116.455615, 39.920533], [116.422092, 39.991104], [116.454847, 39.917724],
[116.456686, 39.924316], [116.45575, 39.920642], [116.456713, 39.924413], [116.455846, 39.920828],
[116.422108, 39.991098], [116.422075, 39.991139], [118.775572, 31.97337], [118.776968, 31.97392],
[118.778187, 31.973121], [118.775695, 31.973254], [118.775302, 31.973807],
[118.776303, 31.973692], [118.777541, 31.973439], [118.776196, 31.973489],
[116.448944, 39.926799], [116.45487, 39.917804], [116.455762, 39.920645], [116.456146, 39.920441],
[116.455857, 39.920043], [116.455458, 39.920826], [116.455533, 39.920791],
[116.455426, 39.920896], [116.45566, 39.920811], [116.455696, 39.920621], [116.453667, 39.9259],
[116.466606, 39.886322], [116.455917, 39.92062]])
2.1 基于Kmeans的聚類實現(xiàn)
假設(shè)用戶的地理位置信息通常是工作地點和家相寇,因此選取k值為2慰于,代碼如下
res, idx = kmeans2(numpy.array(zip(xy[:, 0], xy[:, 1], z)), 2, iter=20, minit='points')
實現(xiàn)輸出結(jié)果
但是實際上用戶并未在河北出現(xiàn)過,用戶經(jīng)常出現(xiàn)的地方除了北京的工作地方和家唤衫,還曾經(jīng)在南京出差一段時間婆赠。所以將K值設(shè)定為3,再次運行
res, idx = kmeans2(numpy.array(zip(xy[:, 0], xy[:, 1], z)), 3, iter=20, minit='points')
輸出結(jié)果
這樣就將南京的地理位置區(qū)分出來了佳励。工作地方和出差地方已經(jīng)非常貼合了休里,但是家的地方離實際距離還是差了不少距離。
其實已經(jīng)可以看出來赃承,由于用戶的出現(xiàn)地點不可預(yù)知妙黍,因此很難確定K值。并且Kmeans聚合得到的結(jié)果取得是聚合簇的質(zhì)心位置瞧剖,并不是用戶的實際地理位置拭嫁,而且我選取的是相似度量是歐式距離,而不是經(jīng)緯度計算的球面距離筒繁。因此得到的結(jié)果并不理想噩凹。
2.2 基于DBSCAN的聚類實現(xiàn)
DBSCAN算法的重點是選取的聚合半徑參數(shù)和聚合所需指定的MinPts數(shù)目。
在此使用球面距離來衡量地理位置的距離毡咏,來作為聚合的半徑參數(shù)驮宴。
如下實驗,選取2公里作為密度聚合的半徑參數(shù)呕缭,MinPts個數(shù)為5.
def haversine(lonlat1, lonlat2):
lat1, lon1 = lonlat1
lat2, lon2 = lonlat2
lon1, lat1, lon2, lat2 = map(radians, [lon1, lat1, lon2, lat2])
dlon = lon2 - lon1
dlat = lat2 - lat1
a = sin(dlat / 2) ** 2 + cos(lat1) * cos(lat2) * sin(dlon / 2) ** 2
c = 2 * asin(sqrt(a))
r = 6371? # Radius of earth in kilometers. Use 3956 for miles
return c * r
def clustering_by_dbscan():
......
distance_matrix = squareform(pdist(X, (lambda u, v: haversine(u, v))))
db = DBSCAN(eps=2, min_samples=5, metric='precomputed')
y_db = db.fit_predict(distance_matrix)
X['cluster'] = y_db
......
plt.scatter(X['lat'], X['lng'], c=X['cluster'])
plt.show()
輸出如下
結(jié)果顯示該用戶的地理位置信息聚合簇為4塊堵泽,在結(jié)果中分別用0.0,1.0,2.0恢总,-1.0來標記迎罗。可以看出DBSCAN算法可以根據(jù)用戶的活動半徑片仿,也就是設(shè)定的最小半徑參數(shù)2公里纹安,將用戶的活動地理位置數(shù)據(jù)集合分為了4簇,而且每一簇在空間上都是任意形狀的砂豌,分類聚合的效果是不錯的厢岂,但是得到的結(jié)果是一個個的簇,也就是一個個的地理點的集合阳距,并不是一個“中心”塔粒。并且存在的噪聲點無法區(qū)分。
3.基于DBSCAN和Kmeans的混合算法實現(xiàn)
從上面的實驗結(jié)果筐摘,Kmeans算法的關(guān)鍵的是 K值的選取卒茬,而我無法確定用戶地理信息聚類的簇的個數(shù)船老,如果實際上的地理位置的分布過于分散,按照固定K值聚合圃酵,得到的質(zhì)心的位置可能和實際位置相差甚遠柳畔。而DBSCAN的算法,聚類結(jié)果不錯辜昵,因為是按照設(shè)定的人的活動半徑的密度可達來聚合的荸镊,但其結(jié)果是將數(shù)據(jù)集合分類,并不求出中心點堪置。
因此我設(shè)計了一種基于DBSCAN和Kmeans的混合算法:先利用DBSCAN算法的密度可達特性將用戶的地理位置數(shù)據(jù)集按照活動半徑聚合成若干個簇躬存,并且將每一簇的數(shù)據(jù)集作為新的輸入,再利用Kmeans算法的迭代聚合求出質(zhì)心的位置舀锨,設(shè)定K值為1岭洲。
代碼如下
def clustering_by_dbscan_and_kmeans2():
X = pd.DataFrame(
{"lat": [39.920767, 39.920965, 39.92304, 39.989539, 39.92069, 39.920845, 39.920902, 39.920657, 39.920934,
39.920691, 39.920671, 39.920864, 39.920856, 39.920407, 39.920867, 39.920425, 39.920377, 39.920442,
39.920474, 39.920636, 39.921168, 39.920006, 39.920612, 39.919584, 39.920737, 39.920641, 39.920574,
39.920841, 39.920644, 39.920847, 39.922041, 39.92088, 39.920603, 39.920851, 39.920789, 39.92082,
39.920564, 39.920771, 39.920868, 39.920544, 39.920758, 39.926767, 39.92024, 39.917848, 40.00875,
39.980757, 39.9808, 40.009217, 39.920747, 39.919515, 39.920533, 39.991104, 39.917724, 39.924316,
39.920642, 39.924413, 39.920828, 39.991098, 39.991139, 31.97337, 31.97392, 31.973121, 31.973254,
31.973807, 31.973692, 31.973439, 31.973489, 39.926799, 39.917804, 39.920645, 39.920441, 39.920043,
39.920826, 39.920791, 39.920896, 39.920811, 39.920621, 39.9259, 39.886322, 39.92062],
"lng": [116.455788, 116.456065, 116.452312, 116.421385, 116.455685, 116.455876, 116.455973, 116.455645,
116.456022, 116.455685, 116.456023, 116.45596, 116.455522, 116.455276, 116.455799, 116.455349,
116.45511, 116.455318, 116.455298, 116.455839, 116.455979, 116.454281, 116.45598, 116.45388,
116.455474, 116.456009, 116.455439, 116.455759, 116.455838, 116.455983, 116.459803, 116.456029,
116.455539, 116.455989, 116.455719, 116.45601, 116.456229, 116.455906, 116.456248, 116.455805,
116.455896, 116.43692, 116.454672, 116.454813, 116.381415, 116.422925, 116.422849, 116.38107,
116.456078, 116.455242, 116.455615, 116.422092, 116.454847, 116.456686, 116.45575, 116.456713,
116.455846, 116.422108, 116.422075, 118.775572, 118.776968, 118.778187, 118.775695, 118.775302,
118.776303, 118.777541, 118.776196, 116.448944, 116.45487, 116.455762, 116.456146, 116.455857,
116.455458, 116.455533, 116.455426, 116.45566, 116.455696, 116.453667, 116.466606, 116.455917]
})
distance_matrix = squareform(pdist(X, (lambda u, v: haversine(u, v))))
db = DBSCAN(eps=2, min_samples=5, metric='precomputed')
y_db = db.fit_predict(distance_matrix)
X['cluster'] = y_db
results = {}
for i in X.values:
if i[2] not in results.keys():
results[i[2]] = [[i[1], i[0]]]
else:
if results[i[2]]:
results[i[2]].append([i[1], i[0]])
else:
results[i[2]] = [[i[1], i[0]]]
print "DBSCAN output: ", len(results), results.keys()
print "KMeans calc center as below: "
for k in results.keys():
xy = numpy.array(results[k])
z = numpy.sin(xy[:, 1] - 0.2 * xy[:, 1])
z = whiten(z)
res, idx = kmeans2(numpy.array(zip(xy[:, 0], xy[:, 1], z)), 1, iter=20, minit='points')
address_text = my_get_address_text_by_location(res[0][1], res[0][0])
print res, address_text
輸出如下
其中”家“,”公司“坎匿,”出差“的位置信息已經(jīng)非常貼合用戶的實際信息了盾剩。
但是仍然存在的噪聲點的信息。這個暫時還沒找到解決方案替蔬,下一步的思路是帶入用戶地理位置信息收集時候得到的附屬信息如時間來輔助分析告私,希望可以有更好的結(jié)果。