文獻(xiàn)學(xué)習(xí)015--[sc]心臟原位巨噬細(xì)胞抑制纖維化和刺激血管生成

這一篇是今年剛剛發(fā)表在Circulation Research上的文章,對(duì)Sham組和TAC 1w 4w小鼠心臟的免疫細(xì)胞做了質(zhì)譜流式CyTOF姻乓,又對(duì)Sham和TAC 1w小鼠心臟組織測(cè)了CITE-seq晰搀,發(fā)現(xiàn)組織原位巨噬細(xì)胞起了比較重要抑制纖維化和促進(jìn)血管生成的作用五辽,而MOMFs則具有強(qiáng)促纖維化作用

此外厕隧,去年發(fā)表的一篇circulation 單細(xì)胞軌跡重建揭示病理性心肌肥厚干預(yù)原則對(duì)Sham和TAC 2 5 8 11w的小鼠心臟心肌和非心肌進(jìn)行了單細(xì)胞測(cè)序奔脐,發(fā)現(xiàn)了巨噬在TAC 2-5w 心臟從EF正常到異常的過(guò)程中起到了重要的調(diào)控作用。

此前關(guān)于心肌肥厚和心衰的研究主要集中在心肌細(xì)胞特異性的通路上吁讨。

1. Pressure Overload–Induced Cardiac Remodeling Profoundly Alters the Cardiac Immune Cell Composition

對(duì)sham髓迎,1w和4wTAC小鼠心臟的測(cè)了CyTOF

Fig 1A:質(zhì)譜流式的結(jié)果顯示,和sham組相比建丧,1w TAC小鼠心臟CD45+免疫細(xì)胞的比例和絕對(duì)值都明顯增加排龄,而4w TAC小鼠心臟CD45+免疫細(xì)胞的比例和絕對(duì)值又出現(xiàn)了下降。
Fig 1B:使用ViSNE (Visualized stochastic neighbor embedding) 分析CyTOF的結(jié)果翎朱,做了細(xì)胞群注釋橄维。結(jié)果提示TAC之后CD64+F4/80+巨噬細(xì)胞出現(xiàn)了明顯增加。
Fig 1C:作者隨后分析了心臟免疫細(xì)胞的巨噬marker表達(dá)拴曲,發(fā)現(xiàn)CD11b+CD64+巨噬細(xì)胞表達(dá)不同水平的CX3CR1, CD206, MHC-II, CCR2和Lyve1争舞。
Fig 1D:隨后作者將CD11b+CD64+巨噬細(xì)胞圈出,并查看了TIMD4, CX3CR1和CCR2的表達(dá)澈灼。組織原位巨噬細(xì)胞和單核起源的巨噬細(xì)胞monocyte-derived macrophages (MoMF)在TAC后1w都出現(xiàn)了增加竞川。然而在TAC后4w時(shí)大部分都恢復(fù)到了sham水平店溢。
Fig 1E:為了驗(yàn)證Fig 1D的結(jié)果,作者換了一種圈門(mén)策略委乌。根據(jù)CCR2和MHC-II的表達(dá)來(lái)區(qū)分組織原位巨噬和MoMF床牧。同樣的,發(fā)現(xiàn)TAC 1w后所有巨噬細(xì)胞都出現(xiàn)增加遭贸,同時(shí)CCR2-巨噬增加最為顯著戈咳。

小結(jié):這些結(jié)果提示巨噬細(xì)胞尤其是組織原位巨噬細(xì)胞在早期肥厚過(guò)程中可能起了重要作用。

2. Single-Cell RNA Sequencing Identifies 12 Different Monocyte/Macrophage Clusters

為了更近一步探究心臟巨噬細(xì)胞的作用壕吹,作者對(duì)4只sham小鼠和6只TAC 1w小鼠心臟的免疫細(xì)胞進(jìn)行了CITE-seq(這里用的是droplet-based scRNA-seq)著蛙。

Fig 2A:送樣流程。是先把每個(gè)樣本和帶有DNA標(biāo)簽的抗體孵育算利,然后混樣(測(cè)序前混樣册踩,抗體上的DNA標(biāo)簽應(yīng)該除了抗體的barcode以外還有樣品的barcode。)
Fig 2B:測(cè)到了60981個(gè)細(xì)胞效拭,做了質(zhì)控和barcode去卷積暂吉。
Fig 2C:得到33566個(gè)帶有單一barcode的細(xì)胞。其中5854個(gè)來(lái)自sham組缎患,27712來(lái)自TAC組慕的。
Fig 2D:對(duì)所有細(xì)胞進(jìn)行降維聚類,得到25個(gè)cluster挤渔。包括12個(gè)單核巨噬群肮街,5個(gè)T細(xì)胞群,3個(gè)B細(xì)胞群判导,1個(gè)DC群嫉父,1個(gè)PMN群和1個(gè)NK群。單核巨噬細(xì)胞明顯占比最高眼刃。
Fig 2E:25個(gè)群的marker基因熱圖
Fig 2F:25個(gè)群的在Sham和TAC組的比例變化绕辖。在數(shù)量最多的單核巨噬細(xì)胞中,有8個(gè)群發(fā)生了有意義的比例變化擂红,提示可能發(fā)揮了重要作用仪际。

3. Gene Expression Analysis Distinguishes Resident and Monocyte-Derived Macrophages

接下來(lái),作者對(duì)12個(gè)巨噬細(xì)胞群做了更精細(xì)的注釋(主要是區(qū)分了組織原位巨噬細(xì)胞和MoMF)昵骤。
Fig 3A:首先根據(jù)Ccr2和Timd4來(lái)區(qū)分了TIMD4+CCR2-原位巨噬細(xì)胞和CCR2+招募來(lái)的巨噬树碱。組織原位巨噬特異性高表達(dá)Lyve1, Cd163Ccl24,招募來(lái)的巨噬高表達(dá)抗原呈遞基因(MHC-II genes: H2- Aa, H2-Ab1, H2-Eb1, H2-DMa, H2-DMb1, and Cd74)变秦,單核細(xì)胞高表達(dá)Ly6c2Plac8成榜。
Supplemental Fig 3A:為了更好的比較組織原位巨噬和招募來(lái)的巨噬之間的基因表達(dá)差異,作者將組織原位巨噬細(xì)胞和MoMF單獨(dú)注釋蹦玫。組織原位巨噬細(xì)胞包含1赎婚,3雨饺,4,11群惑淳,MoMF包含0,5饺窿,10歧焦,14群。
Fig 3B:隨后作者比較了組織原位巨噬細(xì)胞和MoMF的轉(zhuǎn)錄差異肚医,發(fā)現(xiàn)組織原位巨噬細(xì)胞高表達(dá)Lyve1, Cd163, Timd4, Ccl2, 6, 7, 8, 9,24, Mrc1和Lgals1绢馍。MoMFs高表達(dá)Ccr2, 各種MHC-II genes (H2-DMa, H2-DMb1, H2- Ab), Lgals3, Ccl5, Cxcl10和16, Ifit, Il1b和纖維化調(diào)節(jié)基因Spp1, Thbs1和Fn1 (fibronectin 1)。
Fig 3C:兩類巨噬細(xì)胞marker基因的DimPlot
Supplemental Fig 3B:IPA富集分析顯示和MoMFs相比肠套,Resident MP富集到了心臟肥厚信號(hào) 通路舰涌。
Fig 3D:IPA轉(zhuǎn)錄因子預(yù)測(cè)提示和MoMFs相比,Resident MP出現(xiàn)上游regulators IL10RA, IL4, STAT3, IRF2的激活你稚,IFNG, IRF3,IRF7出現(xiàn)抑制瓷耙。
Supplemental Fig 3C:是對(duì)Fig 3D的分cluster分析驗(yàn)證。Fig 3D是把兩種細(xì)胞的各四個(gè)cluster合在一起分析刁赖,Supplemental Fig 3C是每個(gè)cluster分開(kāi)分析搁痛,提示每個(gè)巨噬細(xì)胞都有獨(dú)特的活化方式。
Fig 3E F:前面是組織原位巨噬和MoMF的對(duì)比分析宇弛,這里作者也做了Sham和TAC巨噬對(duì)比的差異基因和轉(zhuǎn)錄因子預(yù)測(cè)鸡典。

Fig 3
Supplemental Fig 3

小結(jié): These results highlight key changes that occur within resident macrophages and MoMFs as the heart transitions from an adaptive hypertrophic state towards HF.

4. α-CD115–Mediated Macrophage Depletion Preferentially Affects Resident mφs

為了探究巨噬細(xì)胞是否在早期心臟應(yīng)對(duì)壓力負(fù)荷時(shí)出現(xiàn)的獲得性肥厚反應(yīng)中起到重要的作用,作者使用了monoclonal α-CD115 antibody清除了巨噬細(xì)胞枪芒。

??????monoclonal α-CD115 antibody可以block CSF-1和表達(dá)CD115的細(xì)胞結(jié)合彻况,引起髓系細(xì)胞清除。

Fig 4A:巨噬清除流程圖
Fig 4B:作者首先檢測(cè)了一下清除效率(day 0)舅踪。在注射了α-CD115或isotype control antibodies 7天之后(做TAC的時(shí)候)纽甘,使用流式檢測(cè)了組織原位巨噬和和MoMF。α-CD115抗體對(duì)組織原位巨噬的有一個(gè)優(yōu)先的清除效果硫朦,也清除掉了部分的MoMF贷腕。盡管和未給抗體組相比,給了抗體之后TAC引起的MoMF增加在TAC day3的時(shí)候還比較少咬展,但在TAC后day7的時(shí)候泽裳,給抗體組的MoMF已經(jīng)恢復(fù)到和未給抗體組差不多的水平。但是組織原位巨噬細(xì)胞被持續(xù)清除破婆。
外周血中的單核在第二次給抗體后4天就恢復(fù)了(附件)涮总,提示心臟中MoMFs的恢復(fù)依賴于外周血循環(huán)的quick replenishment。
Fig 4C:在驗(yàn)證了抗體對(duì)組織原位巨噬細(xì)胞的清除效果之后祷舀,作者對(duì)注射了α-CD115或isotype control antibodies的小鼠進(jìn)行了TAC瀑梗,并取TAC后7天的心臟進(jìn)行了CyTOF檢測(cè)烹笔。和isotype組相比,TAC組小鼠心臟巨噬出現(xiàn)了非常明顯的下降抛丽。
Fig 4D:隨后作者使用免疫熒光檢測(cè)了組織原位巨噬細(xì)胞marker CD163的表達(dá)谤职,結(jié)果提示TAC后小鼠心臟中組織原位巨噬細(xì)胞出現(xiàn)明顯增加,在α-CD115抗體清楚后出現(xiàn)顯著下降亿鲜。
Fig 4E:盡管成功清除了心臟組織原位巨噬細(xì)胞允蜈,TAC后七天小鼠沒(méi)有檢測(cè)到明顯的心肌肥厚,也沒(méi)有出現(xiàn)明顯的EF蒿柳,F(xiàn)S的改變饶套。

這些結(jié)果提示α-CD115抗體可以有效清除組織原位巨噬細(xì)胞,而MoMFs則不受影響垒探。

小結(jié):清除組織原位巨噬細(xì)胞不影響1w TAC鼠的心臟肥厚和心功能妓蛮,但不排除清除組織原位巨噬細(xì)胞仍然可能參與壓力負(fù)荷下晚期心功能失代償。

5. Resident Macrophages Inhibit Fibrosis

盡管組織原位巨噬細(xì)胞似乎在心臟應(yīng)對(duì)壓力負(fù)荷的早期肥厚過(guò)程中可有可無(wú)圾叼,但已有文獻(xiàn)顯示它們?nèi)匀豢赡茉谠黾游⒀苊芏群屠w維化過(guò)程中起到重要作用蛤克。所以接下來(lái)作者探究了心臟巨噬細(xì)胞對(duì)血管生成和纖維化的調(diào)控作用。

Fig 5A:作者分離了Sham和TAC小鼠的心臟巨噬細(xì)胞褐奥,使用流式檢測(cè)了它們促炎細(xì)胞因子TNF-α, IL6和IL10的表達(dá)咖耘。TAC小鼠心臟巨噬細(xì)胞出現(xiàn)了IL-6和IL-10的高表達(dá),提示總體的炎癥激活撬码。
Fig 5B:TAC小鼠心臟巨噬細(xì)胞促纖維化指標(biāo)Tgfb1的表達(dá)也增加
Fig 5C D:隨后作者檢測(cè)了是否清除組織原位巨噬細(xì)胞可以影響TAC后纖維化的發(fā)生儿倒。結(jié)果顯示TAC鼠心臟和Sham相比出現(xiàn)明顯纖維化,但清除心臟組織原位巨噬之后心臟纖維化加重呜笑。
Fig 5E:為了探究是TAC后的巨噬釋放了哪些因子促進(jìn)了纖維化的發(fā)生夫否,作者分離了巨噬細(xì)胞使用bead-based immunoassay檢測(cè)了十個(gè)分子的表達(dá)。結(jié)果提示和Sham鼠相比叫胁,TAC鼠心臟巨噬細(xì)胞多種細(xì)胞因子表達(dá)都出現(xiàn)了增加凰慈,包括TGFβ1和IL10這兩種既往報(bào)道和纖維化相關(guān)的分子。
Fig 5F:TGFβ1和IL10這兩種細(xì)胞因子都可以刺激myofibroblast分化驼鹅,成熟和纖維產(chǎn)生微谓,而且是劑量依賴性的。

小結(jié):Together, these results show that cardiac macrophages play a critical role in ameliorating fibrosis in response to pressure overload.

6. Resident Macrophages Stimulate Angiogenesis

探究心臟巨噬細(xì)胞是否影響血管生成
Fig 6A:TAC鼠心臟巨噬細(xì)胞Vegfa表達(dá)增加
Fig 6B:TAC鼠血管生成增加输钩,清除組織原位巨噬后血管生成減少
Fig 6C:為了驗(yàn)證巨噬細(xì)胞對(duì)血管生成的直接作用豺型,作者分離了TAC鼠心臟巨噬細(xì)胞和HUVECs(人臍靜脈內(nèi)皮細(xì)胞)共培養(yǎng)。結(jié)果顯示macrophages stimulated tube formation with increases in mesh area, and number of nodes, junctions, and meshes compared with the negative control买乃,而且這個(gè)效應(yīng)也是劑量依賴性的姻氨。


小結(jié):These results show that cardiac macrophages promote vascular growth in pressure-overloaded hearts.

7. Recruited Monocyte-Derived Macrophages Stimulate Fibrosis

前面觀察到α-CD115抗體主要清除組織原位巨噬細(xì)胞而且α-CD115抗體treated TAC小鼠出現(xiàn)纖維化加重的表現(xiàn)。但α-CD115也可以部分清除MoMF剪验,因此作者推測(cè)MoMF可能也參與了TAC后纖維化的發(fā)生肴焊。

Fig 7A:實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)前联。
Fig 7B:流式檢測(cè)注射了α-CD115或isotype control antibodies的C57和CCR2 KO的TAC鼠心臟。CCR2KO鼠心臟的MoMF明顯缺陷娶眷。
Fig 7C:早期清除組織原位巨噬細(xì)胞對(duì)心臟早期肥厚和心功能影響不大似嗤,和前面的結(jié)論一致。
Fig 7D:給了α-CD115的c57鼠纖維化增加届宠,和前面結(jié)論一致双谆。但α-CD115–treated CCR2KO 鼠(缺乏組織原位巨噬和MoMF)纖維化水平反而出現(xiàn)了下降。

小結(jié):These findings indicate that recruited MoMFs are strong promoters of cardiac fibrosis in a process that ultimately depends on the counteracting role of resident macrophages.

8. Depletion of Resident Macrophages Leads to Accelerated HF Development

前面做的都是清除巨噬的短期效果席揽,這里作者也對(duì)長(zhǎng)期效應(yīng)(TAC 6w)做了檢測(cè)。
Fig 8A:對(duì)注射了α-CD115或isotype control antibodies的TAC 6w心臟進(jìn)行了質(zhì)譜流式檢測(cè)谓厘,各類細(xì)胞數(shù)目已經(jīng)沒(méi)有明顯差別幌羞。
Fig 8B:各類巨噬亞群的比例也沒(méi)有差別
Fig 8C:但是和給了isotype control的TAC鼠相比,給了α-CD115抗體的TAC在6w時(shí)出現(xiàn)了EF和FS的進(jìn)一步惡化竟稳,但心臟肥厚沒(méi)有加重属桦。
Fig 8D:盡管整體肥厚沒(méi)有加重,給了抗體的TAC鼠心肌面積更大
Fig 8E F:給了α-CD115抗體的TAC鼠心臟纖維化更重

該研究中他爸,研究人員結(jié)合了CyTOF和scRNA測(cè)序研究了心臟負(fù)荷早期免疫細(xì)胞的重構(gòu)聂宾。研究鑒定了不同的巨噬亞群,分析了其在心臟負(fù)荷早期的亞群豐度變化及基因表達(dá)差異诊笤,確定了Res MPs和MoMFs在心臟負(fù)荷早期調(diào)節(jié)中的重要作用系谐。隨后研究人員通過(guò)a-CD115抗體清除Res MPs,發(fā)現(xiàn)Res MPs耗竭會(huì)導(dǎo)致心臟中血管的生成反應(yīng)減弱讨跟,心臟的纖維化程度會(huì)增加纪他。盡管后續(xù)巨噬細(xì)胞得以恢復(fù),但是早期耗盡巨噬細(xì)胞的心臟依舊出現(xiàn)了心臟功能的降低和纖維化晾匠,說(shuō)明心臟中的Res MPs在早期抑制纖維化和預(yù)防心力衰竭中就有著重要的作用茶袒。而使用a-CD115抗體干預(yù)CCL2敲除鼠同時(shí)清除Res MPs和MoMFs則心臟纖維化程度減輕,揭示了MoMFs的強(qiáng)促纖維化作用凉馆。該研究為更好地理解心臟巨噬細(xì)胞刺激和補(bǔ)償調(diào)節(jié)機(jī)制以及心衰的靶向治療提供了參考薪寓。

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