安裝和加載R包
1、設(shè)置鏡像
打開RStudio洒敏,輸入options()$repos
查看默認(rèn)鏡像源情況
> options()$repos
CRAN
"https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"
attr(,"RStudio")
[1] TRUE
>
> options()$BioC_mirror
[1] "https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/"
Rstudio中設(shè)置下面兩行代碼欧啤,來自定義CRAN和Bioconductor的下載鏡像博个。
# options函數(shù)就是設(shè)置R運行過程中的一些選項設(shè)置
>options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) #對應(yīng)清華源
>options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") #對應(yīng)中科大源
# 也可以換成其他地區(qū)的鏡像
-----------分界線----------
一勞永逸設(shè)置下載鏡像~
>file.edit('~/.Rprofile') #編輯配置文件
2、安裝R包
>install.packages(“包”) #要安裝的包在CRAN網(wǎng)站
>BiocManager::install(“包”) #要安裝的包在Biocductor
#包存在哪绽慈,自行百度
3恨旱、加載
#任一都可以
>library(包)
>require(包)
示例:
> options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))
> options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")
# 安裝包
> install.packages("dplyr")
# 載入包
> library(dplyr)
# 示例數(shù)據(jù)使用內(nèi)置數(shù)據(jù)集iris的簡化版
> test <- iris[c(1:2,51:52,101:102),]
dplyr基礎(chǔ)函數(shù)
記錄:
一個好習(xí)慣,做新項目時記得清空之前的變量坝疼,使用rm(list = ls())
(以上學(xué)習(xí)內(nèi)容來自微信公眾號——生信星球)