如何安裝Github上特定版本號(每次提交的唯一標(biāo)識)的R包?

本文的絕大部分都為解決問題的思路,如果只想知道如何安裝特定版本號(每次提交的唯一標(biāo)識)棘伴,可以直接翻到文末寞埠。

事情的起因是一位讀者在使用RNAseqStat時遇到了bug,對象“deg_data_g”找不到排嫌。

結(jié)合results文件和報錯畸裳,我們可以推測出是火山圖繪制時出現(xiàn)了問題

起初我以為是讀者的數(shù)據(jù)格式有問題淳地,于是我用GSE179367數(shù)據(jù)集嘗試運行怖糊,可以正常跑通。但查看他的代碼颇象,發(fā)現(xiàn)用的居然是示例數(shù)據(jù)伍伤。

結(jié)合該讀者是最近才裝的RNAseqStat,這就很有可能是永和在對包進(jìn)行調(diào)整的時候出了問題遣钳,我們前往永和RNAseqStat[1]的界面扰魂,進(jìn)入R,找到代碼更新歷史蕴茴,發(fā)現(xiàn)在一個多月前劝评,該部分代碼(enhance_volcano.R)有一定更新。

因為RNAseqStat沒有發(fā)布不同的release倦淀,我以為只能等永和更新了蒋畜,但永和提到了一種安裝以前版本R包的方法。

由于github上每一次包的更新都會有所記錄撞叽,我們便可以通過每次提交的唯一標(biāo)識下載以前更新的包姻成。

我們可以通過以下命令查看我安裝的是哪一版的RNAseqStat。

>?devtools::package_info("RNAseqStat",dependencies?=?F)
?package????*?version?date?(UTC)?lib?source
?RNAseqStat???0.1.0???2021-12-25?[1]?Github?(xiayh17/RNAseqStat@c374ed0)

?[1]?D:/Documents/R/win-library/4.1
?[2]?D:/Program?Files/R/R-4.1.2/library

可以發(fā)現(xiàn)是c374ed0愿棋;接下來安裝該版本科展。

devtools::install_github("xiayh17/RNAseqStat@c374ed0")

貼心的永和還添加了Verified標(biāo)識,只要是帶有該標(biāo)識的版本糠雨,應(yīng)該是不會存在問題的~

另外才睹,該bug已于昨天連夜被永和修復(fù),大家可以放心安裝新版本甘邀。

參考資料

[1]RNAseqStat: https://github.com/xiayh17/RNAseqStat

?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請聯(lián)系作者
  • 序言:七十年代末砂竖,一起剝皮案震驚了整個濱河市,隨后出現(xiàn)的幾起案子鹃答,更是在濱河造成了極大的恐慌乎澄,老刑警劉巖,帶你破解...
    沈念sama閱讀 206,968評論 6 482
  • 序言:濱河連續(xù)發(fā)生了三起死亡事件,死亡現(xiàn)場離奇詭異,居然都是意外死亡,警方通過查閱死者的電腦和手機挂捅,發(fā)現(xiàn)死者居然都...
    沈念sama閱讀 88,601評論 2 382
  • 文/潘曉璐 我一進(jìn)店門浙于,熙熙樓的掌柜王于貴愁眉苦臉地迎上來护盈,“玉大人,你說我怎么就攤上這事羞酗「危” “怎么了?”我有些...
    開封第一講書人閱讀 153,220評論 0 344
  • 文/不壞的土叔 我叫張陵檀轨,是天一觀的道長胸竞。 經(jīng)常有香客問我,道長参萄,這世上最難降的妖魔是什么卫枝? 我笑而不...
    開封第一講書人閱讀 55,416評論 1 279
  • 正文 為了忘掉前任,我火速辦了婚禮讹挎,結(jié)果婚禮上校赤,老公的妹妹穿的比我還像新娘。我一直安慰自己筒溃,他們只是感情好马篮,可當(dāng)我...
    茶點故事閱讀 64,425評論 5 374
  • 文/花漫 我一把揭開白布。 她就那樣靜靜地躺著怜奖,像睡著了一般浑测。 火紅的嫁衣襯著肌膚如雪。 梳的紋絲不亂的頭發(fā)上烦周,一...
    開封第一講書人閱讀 49,144評論 1 285
  • 那天,我揣著相機與錄音怎顾,去河邊找鬼读慎。 笑死,一個胖子當(dāng)著我的面吹牛槐雾,可吹牛的內(nèi)容都是我干的夭委。 我是一名探鬼主播,決...
    沈念sama閱讀 38,432評論 3 401
  • 文/蒼蘭香墨 我猛地睜開眼募强,長吁一口氣:“原來是場噩夢啊……” “哼株灸!你這毒婦竟也來了?” 一聲冷哼從身側(cè)響起擎值,我...
    開封第一講書人閱讀 37,088評論 0 261
  • 序言:老撾萬榮一對情侶失蹤慌烧,失蹤者是張志新(化名)和其女友劉穎,沒想到半個月后鸠儿,有當(dāng)?shù)厝嗽跇淞掷锇l(fā)現(xiàn)了一具尸體屹蚊,經(jīng)...
    沈念sama閱讀 43,586評論 1 300
  • 正文 獨居荒郊野嶺守林人離奇死亡厕氨,尸身上長有42處帶血的膿包…… 初始之章·張勛 以下內(nèi)容為張勛視角 年9月15日...
    茶點故事閱讀 36,028評論 2 325
  • 正文 我和宋清朗相戀三年,在試婚紗的時候發(fā)現(xiàn)自己被綠了汹粤。 大學(xué)時的朋友給我發(fā)了我未婚夫和他白月光在一起吃飯的照片命斧。...
    茶點故事閱讀 38,137評論 1 334
  • 序言:一個原本活蹦亂跳的男人離奇死亡,死狀恐怖嘱兼,靈堂內(nèi)的尸體忽然破棺而出国葬,到底是詐尸還是另有隱情,我是刑警寧澤芹壕,帶...
    沈念sama閱讀 33,783評論 4 324
  • 正文 年R本政府宣布汇四,位于F島的核電站,受9級特大地震影響哪雕,放射性物質(zhì)發(fā)生泄漏船殉。R本人自食惡果不足惜,卻給世界環(huán)境...
    茶點故事閱讀 39,343評論 3 307
  • 文/蒙蒙 一斯嚎、第九天 我趴在偏房一處隱蔽的房頂上張望利虫。 院中可真熱鬧,春花似錦堡僻、人聲如沸糠惫。這莊子的主人今日做“春日...
    開封第一講書人閱讀 30,333評論 0 19
  • 文/蒼蘭香墨 我抬頭看了看天上的太陽硼讽。三九已至,卻和暖如春牲阁,著一層夾襖步出監(jiān)牢的瞬間固阁,已是汗流浹背。 一陣腳步聲響...
    開封第一講書人閱讀 31,559評論 1 262
  • 我被黑心中介騙來泰國打工城菊, 沒想到剛下飛機就差點兒被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留备燃,地道東北人。 一個月前我還...
    沈念sama閱讀 45,595評論 2 355
  • 正文 我出身青樓凌唬,卻偏偏與公主長得像并齐,于是被迫代替她去往敵國和親。 傳聞我的和親對象是個殘疾皇子客税,可洞房花燭夜當(dāng)晚...
    茶點故事閱讀 42,901評論 2 345

推薦閱讀更多精彩內(nèi)容