測(cè)序正負(fù)鏈和轉(zhuǎn)錄翻譯正負(fù)鏈概念
測(cè)序中的正負(fù)鏈
測(cè)序之前为障，要先將序列打斷长捧，進(jìn)行建庫嚣鄙。在建庫的時(shí)候是不區(qū)分正負(fù)鏈的，所以在后續(xù)測(cè)序過程中產(chǎn)生序列也不包含正負(fù)鏈信息串结。
但是哑子，測(cè)的read要往參考基因組上比對(duì)，以便知道read在基因組中的位置肌割。參考基因組中每條染色體只有一條序列卧蜓，這條序列表示的序列即為正鏈序列，常用‘+’表示把敞，與正鏈互補(bǔ)的序列為負(fù)鏈烦却，用‘-’表示。
對(duì)一條染色體而言先巴，只有一條正鏈序列，互補(bǔ)的即為負(fù)鏈冒冬。
文獻(xiàn)或者數(shù)據(jù)庫中提到的基因所在strand伸蚯，即為這里所提的正負(fù)鏈。
轉(zhuǎn)錄翻譯中的正負(fù)鏈
根據(jù)中心法則,DNA轉(zhuǎn)錄成mRNA,mRNA翻譯成蛋白質(zhì)简烤。
其中mRNA只能從一條DNA鏈,根據(jù)堿基互補(bǔ)配對(duì)轉(zhuǎn)錄形成一條RNA鏈,這條鏈叫anti-sense strand無義鏈或者叫template strand模板鏈.因?yàn)樗cmRNA序列互補(bǔ)剂邮。
mRNA與另一條鏈序列相同,除了T被U取代，簡單說横侦，在轉(zhuǎn)錄中挥萌，正鏈就是與RNA序列相同的那一個(gè)dna單鏈；復(fù)制中枉侧，正鏈就是與新鏈序列相同的原單鏈引瀑，非模板鏈。對(duì)應(yīng)的鏈就是負(fù)鏈了榨馁。
即互補(bǔ)的鏈為模板鏈憨栽，負(fù)鏈。相同序列的鏈為正鏈。
