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2020-10-20 校正單細胞數據的批次效應及原理
推薦一篇博文:https://towardsdatascience.com/how-to-batch-correct-single-cell-7...
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2020-10-01 jupyter lab 報 kernel error錯誤的解決辦法描述： 進入jupyter-lab后提示kernel不存在竿裂，同時自己想要選擇的kernel沒有 原因： "scenic protocol"這個環(huán)...
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2020-09-29 使用Alevin實現【輸入】fastq→【輸出】umi count matrix首先要知道alevin屬于salmon的一個工具轴脐，用于定量單細胞轉錄本开瞭，使用的比對方式是類似于kallisto的pseudo align灸蟆，即不將...
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2020-08-29 單細胞注釋用到的基因標志物傳統(tǒng)的方法是無監(jiān)督聚類+群標志物分類暂论；或者根據已有單細胞數據集作為參考CellAssign工具提出了一種根據已知gene marker set+...
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2020-08-28 SingleR v1.2.4單細胞自動注釋軟件首先SingleR屬于不基于Prior Knowledge的注釋方法阵子；相對應的還有基于Prior Knowledge的方法亿蒸，比如CellAssi...
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2020-08-25 r7000 2020 4800H配置Ubuntu20.04路徑
安裝過程參考：https://www.bilibili.com/video/BV11k4y1k7Li?from=search&seid=4172...
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2020-08-19 發(fā)表在Cell的單細胞文章如何預處理10X和SmartSeq2數據方法部分還是很有參考價值的 測序至獲取細胞 10X測序技術 比對至GRCH38 R包dropletUtils的 函數將真實的細胞同背景RNA表達...
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2020-07-16 解決samtools報錯：error while loading shared libraries: libcrypto.so.1.0.0
今天想使用samtools時突然報錯： samtools: error while loading shared libraries: libc...
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2020-07-14 通過簡單的內聯重定向和變量調用實現gatk json文件的批量生成
直接上代碼： 使用內聯重定向符號<<和首尾標記示辈，可以將多行文本寫入json文件首尾標記可以是任意選擇寥茫，我這里用EOF(像haha，hehe等也是...