強(qiáng)調(diào)<艟觥灵汪! all of all都是個(gè)人觀點(diǎn)~
? ? 首先,入這個(gè)坑是因?yàn)殛幉铌栧e(cuò)(這里就不展開了)柑潦。
? ? 至于沒有脫坑享言,是因?yàn)閬砣プ杂桑挥米鰧?shí)驗(yàn)渗鬼,方便劃水(bushi)览露。
? 一開始以為的做生信就是分析數(shù)據(jù),裝b地說是實(shí)驗(yàn)結(jié)果和數(shù)據(jù)的賦予者譬胎,聽起來很偉大差牛,但在做濕實(shí)驗(yàn)同門眼里應(yīng)該是閑人一個(gè)…
? ? 本科前幾年接觸的生信皆是分子進(jìn)化云云,自我感覺進(jìn)化的故事除非是做大银择,大到cns多糠,大到諾獎(jiǎng),否則總是虛無縹緲的感覺浩考。當(dāng)然既然現(xiàn)在諾獎(jiǎng)已出夹孔,以后被關(guān)注甚至趨勢(shì)大好也不是不可能。
? 閑的空虛+升學(xué)需要,大四的時(shí)候開始自學(xué)了一些組學(xué)分析搭伤,不過都是皮毛只怎,潤(rùn)一潤(rùn)別人寫好的pipeline。即便是自己本地跑怜俐,基本的從測(cè)序數(shù)據(jù)到heatmap等只要入門了都是大同小異身堡。
? 最近研一剛開學(xué),和導(dǎo)師幾經(jīng)交流拍鲤,發(fā)現(xiàn)生信分析需求大增(畫餅)贴谎,但我這點(diǎn)三腳貓功夫怎么對(duì)付呢?anyway我還得多多學(xué)習(xí)<疚取I谜狻!這也是開這個(gè)賬號(hào)的原因景鼠,我跟學(xué)的簡(jiǎn)書教程都是大佬寫的仲翎,雖然教程簡(jiǎn)潔明了一氣呵成,但是我在跟學(xué)過程中可謂是磕磕絆絆(看吧铛漓,大佬根本不會(huì)知道菜鳥會(huì)在哪里跌倒然后就爬不起來然后就半途而廢.·′ˉ`(>▂<)′ˉ`·.)溯香。
? ? 想必這種時(shí)候需要我這樣一個(gè)從零開始摸爬滾打的小白,在實(shí)踐中無限犯錯(cuò)浓恶,記錄下自己的學(xué)習(xí)歷程和踩過的坑玫坛,希望能給和我一樣的朋友避避雷~
? ? 回歸正題…生信是什么
? ? 和學(xué)校一位生信大牛的導(dǎo)師聊天的結(jié)論:
? ? 我認(rèn)為生物信息學(xué)涉及的領(lǐng)域還是很廣的,真正隔行如隔山问顷。因?yàn)槭菙?shù)據(jù)科學(xué)的一個(gè)衍生物昂秃,所以利用數(shù)學(xué)、信息學(xué)杜窄、統(tǒng)計(jì)學(xué)和計(jì)算機(jī)科學(xué)的方法研究生物學(xué)問題的都叫生物信息學(xué)肠骆。同是做生信的,互相對(duì)牛彈琴不在少數(shù)塞耕。
? ? 但總的來說蚀腿,生信為兩塊,一塊是應(yīng)用層面的扫外,比如常見的基因組學(xué)莉钙、蛋白質(zhì)組學(xué)、翻譯組筛谚、轉(zhuǎn)錄組磁玉、單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)的分析……另一塊是開發(fā),主要包括算法驾讲、數(shù)據(jù)庫(kù)蚊伞、軟件席赂、工具包等的開發(fā),這就需要比較硬核的數(shù)學(xué)和計(jì)算機(jī)背景时迫。要注意的是颅停,應(yīng)用層面的工作基本都是基于開發(fā)的,應(yīng)用已經(jīng)開發(fā)的數(shù)據(jù)庫(kù)掠拳、算法癞揉、軟件、r包等對(duì)拿到手的raw data完成相應(yīng)的分析工作溺欧,目標(biāo)是發(fā)現(xiàn)某些生物現(xiàn)象喊熟、規(guī)律。要不說學(xué)物理姐刁、數(shù)學(xué)逊移、計(jì)算機(jī)的轉(zhuǎn)到生物是降維打擊呢……
? ? 但是!龙填!要做一個(gè)優(yōu)秀的生物信息學(xué)工作者怎么能沒有生物學(xué)基礎(chǔ)呢!拐叉!借用上課的時(shí)候一位老師說的:找專門學(xué)計(jì)算機(jī)的人合作生信岩遗,他們的一根筋能讓你氣炸!所以一個(gè)課題組里有一個(gè)自己的生信傳統(tǒng)還是很必要滴~這樣才能有效地將big data有效轉(zhuǎn)化成生物學(xué)思想~