在線繪制聚類熱圖

聚類熱圖是轉(zhuǎn)錄組測序類文章中常見的一種分析內(nèi)容。今天小編就給大家講解一個在線繪制聚類熱圖的方法茧痒。

我們使用的在線工具網(wǎng)址:

http://www.heatmapper.ca/expression/

打開后的頁面是如下所示:

該在線工具有幾個優(yōu)點:

1、支持不同的顏色配置;

2、支持樣品和基因的雙聚類辟汰;

3、支持基因名稱的顯示阱佛;

4帖汞、支持多種格式圖片的下載。

繪圖之前凑术,需要準(zhǔn)備相應(yīng)的數(shù)據(jù)文件翩蘸。在這里小編使用的是基因的表達(dá)量數(shù)據(jù)來繪制聚類熱圖。

數(shù)據(jù)文件準(zhǔn)備好之后淮逊,需要把該文件上傳催首,上傳完成之后需要稍等片刻(在線工具有延時),右側(cè)圖形展示區(qū)域就會顯示聚類熱圖泄鹏。再根據(jù)右側(cè)參數(shù)進(jìn)行相應(yīng)設(shè)置即可完成聚類熱圖的繪制郎任。

如果基因數(shù)目比較多,基因名稱顯示會不清晰备籽,我們可以將圖片下載下來舶治,然后再使用其他軟件進(jìn)行修改,比如使用AI進(jìn)行修改车猬。

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