Anaconda的安裝和使用(Linux系統(tǒng))

1 安裝Miniconda

#下載安裝包

wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh --no-check-certificate

#安裝miniconda

sh Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

注意:

1) 使用“Enter”查看license agreement;

2)查看完license agreement后缘揪,需要輸入“yes”表示接受才能繼續(xù);

3) 需要確認(rèn)安裝路徑蹈垢,可以使用”Enter鍵”確認(rèn)安裝在根目錄(建議不更改)袖裕;

4)經(jīng)過1-2分鐘安裝完成后,需要同意安裝器是否初始化miniconda急鳄,需要輸入“yes”同意后疾宏,miniconda的“PATH”才能加入到~/.bashrc 。

#讓添加miniconda路徑可執(zhí)行

source ~/.bashrc

2 設(shè)置國內(nèi)鏡像

conda默認(rèn)使用的國外鏡像源速度相對較慢为牍,通常為了正常運(yùn)行岩馍,會(huì)使用清華的鏡像。

如果不設(shè)置的話經(jīng)常會(huì)出現(xiàn)這樣的報(bào)錯(cuò):CondaHTTPError: HTTP 000CONNECTION FAILED for url

#恢復(fù)conda的源為默認(rèn)

conda config --remove-key channels

#添加國內(nèi)鏡像

conda config --add channels http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/linux-64

conda config --add channels http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/linux-64

conda config --add channels http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/linux-64

#顯示channel地址

conda config --set show_channel_urls yes

#設(shè)置channel的優(yōu)先級別為彈性的

conda config --set channel_priority flexible

命令執(zhí)行完成后會(huì)形成:.condarc文件

#編輯.condarc文件

vim ~/.condarc

點(diǎn)擊insert進(jìn)入編輯模式

刪除底部的-default疫铜,

點(diǎn)擊esc块攒,退出編輯模式佃乘,然后輸入“:wq”退出

#查看源

conda config --show-sources

#清除索引緩存,保證使用的是鏡像站提供的索引

conda clean -i

3 安裝軟件包

#測試一下

conda search packagename

如果能正常顯示趣避,應(yīng)該可以正常安裝程帕,安裝軟件包的命令可以去下面這個(gè)網(wǎng)站查看:

https://anaconda.org/anaconda/repo

如果安裝的時(shí)候出現(xiàn)問題,可以試試指定channel安裝軟件包:

conda install $package_name --channel http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/linux-64

最后編輯于
?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請聯(lián)系作者
  • 序言:七十年代末讲逛,一起剝皮案震驚了整個(gè)濱河市盏混,隨后出現(xiàn)的幾起案子,更是在濱河造成了極大的恐慌许赃,老刑警劉巖,帶你破解...
    沈念sama閱讀 206,214評論 6 481
  • 序言:濱河連續(xù)發(fā)生了三起死亡事件,死亡現(xiàn)場離奇詭異句喜,居然都是意外死亡,警方通過查閱死者的電腦和手機(jī)鳖粟,發(fā)現(xiàn)死者居然都...
    沈念sama閱讀 88,307評論 2 382
  • 文/潘曉璐 我一進(jìn)店門向图,熙熙樓的掌柜王于貴愁眉苦臉地迎上來标沪,“玉大人,你說我怎么就攤上這事檩赢∥ツ” “怎么了?”我有些...
    開封第一講書人閱讀 152,543評論 0 341
  • 文/不壞的土叔 我叫張陵军浆,是天一觀的道長挡闰。 經(jīng)常有香客問我摄悯,道長,這世上最難降的妖魔是什么奢驯? 我笑而不...
    開封第一講書人閱讀 55,221評論 1 279
  • 正文 為了忘掉前任瘪阁,我火速辦了婚禮断盛,結(jié)果婚禮上愉舔,老公的妹妹穿的比我還像新娘轩缤。我一直安慰自己贩绕,他們只是感情好,可當(dāng)我...
    茶點(diǎn)故事閱讀 64,224評論 5 371
  • 文/花漫 我一把揭開白布馏鹤。 她就那樣靜靜地躺著娇哆,像睡著了一般。 火紅的嫁衣襯著肌膚如雪治力。 梳的紋絲不亂的頭發(fā)上勃黍,一...
    開封第一講書人閱讀 49,007評論 1 284
  • 那天覆获,我揣著相機(jī)與錄音,去河邊找鬼弄息。 笑死,一個(gè)胖子當(dāng)著我的面吹牛辩块,可吹牛的內(nèi)容都是我干的荆永。 我是一名探鬼主播,決...
    沈念sama閱讀 38,313評論 3 399
  • 文/蒼蘭香墨 我猛地睜開眼,長吁一口氣:“原來是場噩夢啊……” “哼骂删!你這毒婦竟也來了四啰?” 一聲冷哼從身側(cè)響起柑晒,我...
    開封第一講書人閱讀 36,956評論 0 259
  • 序言:老撾萬榮一對情侶失蹤眷射,失蹤者是張志新(化名)和其女友劉穎,沒想到半個(gè)月后妖碉,有當(dāng)?shù)厝嗽跇淞掷锇l(fā)現(xiàn)了一具尸體涌庭,經(jīng)...
    沈念sama閱讀 43,441評論 1 300
  • 正文 獨(dú)居荒郊野嶺守林人離奇死亡,尸身上長有42處帶血的膿包…… 初始之章·張勛 以下內(nèi)容為張勛視角 年9月15日...
    茶點(diǎn)故事閱讀 35,925評論 2 323
  • 正文 我和宋清朗相戀三年欧宜,在試婚紗的時(shí)候發(fā)現(xiàn)自己被綠了坐榆。 大學(xué)時(shí)的朋友給我發(fā)了我未婚夫和他白月光在一起吃飯的照片。...
    茶點(diǎn)故事閱讀 38,018評論 1 333
  • 序言:一個(gè)原本活蹦亂跳的男人離奇死亡冗茸,死狀恐怖席镀,靈堂內(nèi)的尸體忽然破棺而出,到底是詐尸還是另有隱情蚀狰,我是刑警寧澤愉昆,帶...
    沈念sama閱讀 33,685評論 4 322
  • 正文 年R本政府宣布,位于F島的核電站麻蹋,受9級特大地震影響跛溉,放射性物質(zhì)發(fā)生泄漏扮授。R本人自食惡果不足惜芳室,卻給世界環(huán)境...
    茶點(diǎn)故事閱讀 39,234評論 3 307
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一處隱蔽的房頂上張望刹勃。 院中可真熱鬧堪侯,春花似錦、人聲如沸荔仁。這莊子的主人今日做“春日...
    開封第一講書人閱讀 30,240評論 0 19
  • 文/蒼蘭香墨 我抬頭看了看天上的太陽乏梁。三九已至次洼,卻和暖如春,著一層夾襖步出監(jiān)牢的瞬間遇骑,已是汗流浹背卖毁。 一陣腳步聲響...
    開封第一講書人閱讀 31,464評論 1 261
  • 我被黑心中介騙來泰國打工, 沒想到剛下飛機(jī)就差點(diǎn)兒被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留落萎,地道東北人亥啦。 一個(gè)月前我還...
    沈念sama閱讀 45,467評論 2 352
  • 正文 我出身青樓炭剪,卻偏偏與公主長得像,于是被迫代替她去往敵國和親翔脱。 傳聞我的和親對象是個(gè)殘疾皇子奴拦,可洞房花燭夜當(dāng)晚...
    茶點(diǎn)故事閱讀 42,762評論 2 345

推薦閱讀更多精彩內(nèi)容

  • 1.Conda簡介 Anaconda包括Python本身以及多個(gè)第三方開源項(xiàng)目的二進(jìn)制文件,是一個(gè)軟件包届吁。它的...
    小喬愛科研閱讀 520評論 0 0
  • 轉(zhuǎn)自:賣萌哥[http://www.reibang.com/u/77fc519c6fa2] 2021-04-27...
    木子_vajra閱讀 4,414評論 0 5
  • 參考的是:生信技能樹conda管理生信軟件一文就夠略有改動(dòng)粱坤,主要包括:下載,安裝瓷产,鏡像設(shè)置,小環(huán)境的創(chuàng)建枚驻,激活濒旦,退...
    天涯清水閱讀 63,608評論 3 21
  • 軟件管理Miniconda 最方便快捷的軟件下載器,相當(dāng)于App store再登,一鍵安裝尔邓。日常生信使用小而精的Min...
    卅衣閱讀 367評論 0 0
  • 剛剛嘗試用conda管理自己用的一些生信軟件,這里記錄常用的一些命令 linux系統(tǒng)上下載并安裝conda: wg...
    阿糖胞苷_SYSU閱讀 5,695評論 1 4