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測了一些ChIP-seq的數(shù)據(jù)，除了拿到公司的套路分析結(jié)果以外灯变，想要做一點(diǎn)自己想要的分析殴玛，但是有沒有基礎(chǔ)，上了生信技能樹的入門課添祸，然后就在網(wǎng)上各種折騰滚粟，不過始終還是小白，缺乏練習(xí)刃泌。
最大的感悟呢凡壤，就是試試才知道~哈哈y
一、解決系統(tǒng)問題
作為一個(gè)Windows 骨灰使用者蔬咬，Linux僅限于半天的了解鲤遥。
雖然深知要掌握一個(gè)技能不是一天半天能夠練就的，但是急于解決眼前的問題林艘，也不可能慢慢一步一步來了盖奈，所以先把主線找出來，然后在這個(gè)過程中也能慢慢熟悉狐援，不然總覺得缺乏動(dòng)力钢坦。
考慮了虛擬機(jī)和云服務(wù)器來解決系統(tǒng)問題，由于擔(dān)心電腦配置和技術(shù)上的問題啥酱，選擇了騰訊云服務(wù)器爹凹。
流程參考了網(wǎng)上一個(gè)博客文章，鏈接如下
https://blog.csdn.net/genecollege/article/details/93229655
配置是這樣：1核 2GB 1Mbps
操作系統(tǒng):ubuntu
PS：這個(gè)級(jí)別基本上只能做練習(xí)镶殷。
2禾酱、從本地鏈接的云服務(wù)器
使用的是Xshell軟件
文件-新建
賬號(hào)密碼輸入后成功鏈接
3.權(quán)限問題
經(jīng)常一些操作出現(xiàn)權(quán)限限制，又去網(wǎng)上找了半天绘趋，覺得比較好的解決方法如下（小白之見）：
在這個(gè)博客上找到的解決方法：https://blog.csdn.net/qq_35624030/article/details/79836347
1）輸入命令
sudo passwd
根據(jù)提示輸入兩次新密碼
2）輸入命令
su root
3）命令前的? $ 號(hào)變成 # 號(hào)
4颤陶、準(zhǔn)備工作
1) 我自己創(chuàng)建的一個(gè)文件夾，方便自己操作
命令：mkdir test
2)下載miniconda陷遮，流程都是從生信技能樹學(xué)的滓走，命令如下：
wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh
3)安裝miniconda，命令如下：
bash Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh
按提示操作帽馋，沒有出現(xiàn)新的用戶行之前都是還沒完成的搅方，
出現(xiàn)“Thank you for installing Miniconda2!”說明安裝成功了
用命令：
conda --help
檢測是否安裝成功比吭。
4）配置鏡像，命令如下：
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
5）創(chuàng)建和激活小環(huán)境
conda create -n ChIP
conda install python=2
source activate?ChIP
5姨涡、安裝需要的軟件
因?yàn)閱渭兊闹皇窍胂仍囋嘾eeptools,所以命令如下：
conda install -y?deeptools
Mark一下：后續(xù)可能還要裝其他的軟件衩藤，就是把上面的這個(gè)deeptools 換成其他軟件的名字就可以了。關(guān)鍵在與這個(gè)軟件的名字要與bioconda鏡像中的軟件名一模一樣才行绣溜。慷彤。
