immunedeconv踩坑記錄

immunedeconv包號稱可以利用多種算法進(jìn)行免疫細(xì)胞比例計(jì)算，包括quantiseq碟刺、timer、cibersort岖瑰、cibersort_abs、mcp_counter砂代、xcell蹋订、epic、abis刻伊、consensus_tme露戒、estimate這些算法。但是在實(shí)際使用中會碰到各種難題捶箱，首先是安裝就麻煩智什，具體見免疫細(xì)胞估算R包immunedeconv安裝，現(xiàn)在就具體幾種算法遇到的問題一一記錄讼呢。

1. mcp_counter

mcp_counter

網(wǎng)上搜索了下撩鹿，說是DNS源污染的問題。
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