Graphpad繪制ROC曲線
在生物標志物模型分析中姆蘸，還有一種常見的分析為受試者工作特征（ROC）曲線分析怨喘。如下圖所示厅贪，ROC曲線也是這類文獻中常見的分析圖灶平，結(jié)合臨床數(shù)據(jù)伺通，可以驗證某個基因或模型作為疾病診斷和預(yù)后標志物。
那么如何使用Graphpad繪制ROC曲線呢逢享？我們就以下圖為例罐监，來一步步演示吧。
1? 數(shù)據(jù)準備
繪制ROC曲線需要生存狀態(tài)瞒爬、基因表達量弓柱，將數(shù)據(jù)整理成表格。示例文件示例數(shù)據(jù).xlsx所示疮鲫。
（1）patient：患者編號吆你；（2）status：生存狀態(tài)，其中0表示存活俊犯，1表示死亡；（3）expression：基因的表達量（或模型的風(fēng)險評分）伤哺。
2? 使用Graphpad進行ROC分析
接下來燕侠，打開Graphpad，選擇Column立莉，點擊Create绢彤。
將Excel中ROC中的數(shù)據(jù)復(fù)制到Graphpad中。
點擊Analysis中的Analyze蜓耻，在Column analysis中選擇ROC Curve茫舶，點擊OK。
在Parameters:ROC Curve中選中Line of identity（是否繪制參考線刹淌，AUC=0.5）饶氏，點擊OK讥耗。
點擊Results中ROC of Data 1中的Area，其中Area under the ROC curve下的Area值就是我們需要的AUC值疹启。
3? 繪制ROC曲線
點擊Graphs中的ROC curve: ROC of Data 1古程。
雙擊坐標軸，修改相關(guān)參數(shù)喊崖。點擊Frame and Origin挣磨，在Size中選擇Square（長寬相等），同時修改Width和Height荤懂。在Frame style中選擇Plain Frame（加邊框）茁裙。
點擊X axis，取消選擇Automatically determine the range and interval节仿。修改Minimum（x軸最小值）晤锥、Maximum（x軸最大值）和Major ticks interval（坐標間隔）。點擊Left Y axis粟耻，修改相同參數(shù)查近。
雙擊繪圖區(qū)域，在Data set中選擇ROC of Data 1:ROC curve: Sensitivity%挤忙，取消選擇Show symbols（顯示關(guān)鍵點）霜威、Color（顏色）、Style（類型改成折線）册烈、Show legend（圖例）等參數(shù)戈泼；將Data set修改成ROC of Data 1:ROC curve:Indentity%，修改相同的參數(shù)赏僧。
修改x軸和y軸標題大猛，并將圖例調(diào)整到合適的位置，ROC圖就繪制完成了淀零。
結(jié)果還是非常漂亮的對不對挽绩？
