Deep learning–based MR‐to‐CT synthesis: The influence of varying gradient echo–based MR images as...

2020年運用分割網(wǎng)絡做的圖像生成凤类,網(wǎng)絡:3D-UNet ? 已配準的數(shù)據(jù)進行實驗

該實驗對輸入數(shù)據(jù)進行配置绵载,從中發(fā)現(xiàn)不同配置下的輸入數(shù)據(jù)對實驗產(chǎn)生的影響宦言,從而探究影響生成結果的參數(shù)蔽氨。

數(shù)據(jù):采集人和犬骨盆區(qū)域的MR和CT掃描鹉戚,使用非剛性配準進行配對垫桂。數(shù)據(jù)是配準以后且配對的师幕。數(shù)據(jù)十分難獲取。數(shù)據(jù):17個犬類+23個人類實驗數(shù)據(jù)诬滩。人類數(shù)據(jù):27個病人前列腺癌

評估標準:峰值SNR霹粥,平均絕對誤差和平均誤差來重建HU單元地圖。骰子相似系數(shù)和表面距離圖評估集合保真度疼鸟。

實驗配置:Keras 2.1.3? TensorFlow 1.7 ? GeForce GTX 1080 Ti (NVIDIA, Santa Clara, CA) GPUs.?

結果:單通道:MAE:17%后控,28%(bone);多通道:Dice相似系數(shù)和MAE統(tǒng)計學上效果更好空镜,人類:33~40HU浩淘,犬類:35~47HU

結論:研究基于梯度回波的對比作為犬和人類中基于深度學習的sCT生成模型的輸入影響。發(fā)現(xiàn)兩個參數(shù)會影響sCT生成的性能和可重復性吴攒。參數(shù)有:單個MR圖像與TE相關的水脂干擾张抄;輸入中組合的多個相關MR圖像作為通道提高模型的性能和可重復性。

Q:文章中的數(shù)據(jù)源是否給出洼怔?

A:

Q:UNet深度學習模型是什么樣的署惯?如何生成合成CT,且輸入數(shù)據(jù)是什么镣隶?

A:3D-UNet:輸入4DMR(3空間維度+一個通道維度)极谊,塊大小 (輸入配置通道數(shù)*3*3*3),網(wǎng)絡架構(3*3*3卷積層,2*2*2最大池化層)實現(xiàn)規(guī)范化和校正的線性單元激活層安岂,生成約400萬個可訓練參數(shù)轻猖,在最近鄰插值法上運用上采樣,這樣可以避免在圖像生成任務中出現(xiàn)的棋盤偽影域那。輸入數(shù)據(jù):T1‐weighted multi‐echo gradient‐echo sequenceT1加權多回波梯度回波序列咙边。模型訓練兩個數(shù)據(jù)集斷言結果對采集參數(shù)和生理變化的變化具有魯棒性。

Q:骰子相似系數(shù)是什么次员?保真度是什么样眠?

Q:單通道和多通道是什么?Dice相似系數(shù)是什么翠肘?

Q:數(shù)據(jù)如何處理的檐束?

?著作權歸作者所有,轉載或內(nèi)容合作請聯(lián)系作者
  • 序言:七十年代末,一起剝皮案震驚了整個濱河市束倍,隨后出現(xiàn)的幾起案子被丧,更是在濱河造成了極大的恐慌盟戏,老刑警劉巖,帶你破解...
    沈念sama閱讀 221,635評論 6 515
  • 序言:濱河連續(xù)發(fā)生了三起死亡事件甥桂,死亡現(xiàn)場離奇詭異柿究,居然都是意外死亡,警方通過查閱死者的電腦和手機黄选,發(fā)現(xiàn)死者居然都...
    沈念sama閱讀 94,543評論 3 399
  • 文/潘曉璐 我一進店門蝇摸,熙熙樓的掌柜王于貴愁眉苦臉地迎上來,“玉大人办陷,你說我怎么就攤上這事貌夕。” “怎么了民镜?”我有些...
    開封第一講書人閱讀 168,083評論 0 360
  • 文/不壞的土叔 我叫張陵啡专,是天一觀的道長。 經(jīng)常有香客問我制圈,道長们童,這世上最難降的妖魔是什么? 我笑而不...
    開封第一講書人閱讀 59,640評論 1 296
  • 正文 為了忘掉前任鲸鹦,我火速辦了婚禮慧库,結果婚禮上馋嗜,老公的妹妹穿的比我還像新娘完沪。我一直安慰自己,他們只是感情好嵌戈,可當我...
    茶點故事閱讀 68,640評論 6 397
  • 文/花漫 我一把揭開白布。 她就那樣靜靜地躺著听皿,像睡著了一般熟呛。 火紅的嫁衣襯著肌膚如雪。 梳的紋絲不亂的頭發(fā)上尉姨,一...
    開封第一講書人閱讀 52,262評論 1 308
  • 那天庵朝,我揣著相機與錄音,去河邊找鬼又厉。 笑死九府,一個胖子當著我的面吹牛,可吹牛的內(nèi)容都是我干的覆致。 我是一名探鬼主播侄旬,決...
    沈念sama閱讀 40,833評論 3 421
  • 文/蒼蘭香墨 我猛地睜開眼,長吁一口氣:“原來是場噩夢啊……” “哼煌妈!你這毒婦竟也來了儡羔?” 一聲冷哼從身側響起宣羊,我...
    開封第一講書人閱讀 39,736評論 0 276
  • 序言:老撾萬榮一對情侶失蹤,失蹤者是張志新(化名)和其女友劉穎汰蜘,沒想到半個月后仇冯,有當?shù)厝嗽跇淞掷锇l(fā)現(xiàn)了一具尸體,經(jīng)...
    沈念sama閱讀 46,280評論 1 319
  • 正文 獨居荒郊野嶺守林人離奇死亡族操,尸身上長有42處帶血的膿包…… 初始之章·張勛 以下內(nèi)容為張勛視角 年9月15日...
    茶點故事閱讀 38,369評論 3 340
  • 正文 我和宋清朗相戀三年苛坚,在試婚紗的時候發(fā)現(xiàn)自己被綠了。 大學時的朋友給我發(fā)了我未婚夫和他白月光在一起吃飯的照片色难。...
    茶點故事閱讀 40,503評論 1 352
  • 序言:一個原本活蹦亂跳的男人離奇死亡泼舱,死狀恐怖,靈堂內(nèi)的尸體忽然破棺而出莱预,到底是詐尸還是另有隱情柠掂,我是刑警寧澤,帶...
    沈念sama閱讀 36,185評論 5 350
  • 正文 年R本政府宣布依沮,位于F島的核電站涯贞,受9級特大地震影響,放射性物質(zhì)發(fā)生泄漏危喉。R本人自食惡果不足惜宋渔,卻給世界環(huán)境...
    茶點故事閱讀 41,870評論 3 333
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一處隱蔽的房頂上張望辜限。 院中可真熱鬧皇拣,春花似錦、人聲如沸薄嫡。這莊子的主人今日做“春日...
    開封第一講書人閱讀 32,340評論 0 24
  • 文/蒼蘭香墨 我抬頭看了看天上的太陽毫深。三九已至吩坝,卻和暖如春,著一層夾襖步出監(jiān)牢的瞬間哑蔫,已是汗流浹背钉寝。 一陣腳步聲響...
    開封第一講書人閱讀 33,460評論 1 272
  • 我被黑心中介騙來泰國打工, 沒想到剛下飛機就差點兒被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留闸迷,地道東北人嵌纲。 一個月前我還...
    沈念sama閱讀 48,909評論 3 376
  • 正文 我出身青樓,卻偏偏與公主長得像腥沽,于是被迫代替她去往敵國和親逮走。 傳聞我的和親對象是個殘疾皇子,可洞房花燭夜當晚...
    茶點故事閱讀 45,512評論 2 359