寫在前面：看了標(biāo)題進(jìn)來(lái)的老鐵永脓，這里不可能在一篇文章里寫好66個(gè)pipeline 給你，實(shí)際上我就是給你推薦一個(gè)網(wǎng)站鞋仍。
閑著亂看的時(shí)候發(fā)現(xiàn)在bioinformatics 上發(fā)表了一篇文章SequencEnG: an Interactive Knowledge Base of Sequencing Techniques常摧，再一看Abstract，寫道
Next-generation sequencing (NGS) techniques are revolutionizing biomedical research by providing powerful methods for generating genomic and epigenomic profiles. The rapid progress is posing an acute challenge to students and researchers to stay acquainted with the numerous available methods. We have developed an interactive online educational resource called SequencEnG (acronym for Sequencing Techniques Engine for Genomics) to provide a tree-structured knowledge base of 66 different sequencing techniques and step-by-step NGS data analysis pipelines comparing popular tools
艾瑪威创，原來(lái)現(xiàn)在已經(jīng)有至少66種不同測(cè)序技術(shù)了落午？ 掰著手指想了想，知道的做過(guò)的撐死也超不過(guò)一雙手啊那婉。這66種測(cè)序技術(shù)都是啥板甘，于是點(diǎn)開了這篇文章的網(wǎng)站想探探路。嗯详炬，果然很多沒(méi)聽說(shuō)過(guò):)
這個(gè)項(xiàng)目是來(lái)自NIH "Knowledge Engine for Genomics" 下的一個(gè)子項(xiàng)目盐类，主頁(yè)是這樣式兒的。
提供了一個(gè)樹狀測(cè)序列表和分析流程的選擇欄呛谜，兩者之前可以相互跳轉(zhuǎn)在跳。這個(gè)樹狀測(cè)序列表是這樣式兒的。
從大的分支來(lái)說(shuō)包括DNA, RNA 和 Epigenetics 三部分隐岛，每部分又延伸出若干分支猫妙。隨便找到一個(gè)子類進(jìn)去看看，譬如 ATAC-seq?
首先會(huì)給一個(gè)關(guān)于該技術(shù)的簡(jiǎn)單介紹和流程圖聚凹，是這樣式兒和這樣式兒的：
點(diǎn)一下pipeline(如果有)割坠，就可以去看分析流程了齐帚，一個(gè)總體分析流程：
接下來(lái)點(diǎn)擊一個(gè)具體的分析步驟，會(huì)給一個(gè)可以分析該部分內(nèi)容的工具列表彼哼，比如我們點(diǎn)擊Peak calling对妄，下面的截圖是表格一部分。
嗯敢朱，差不多了剪菱，接下來(lái)你可以自己去試試。順便提一下拴签，這個(gè)網(wǎng)站還有一些其它的小功能也可以留意孝常。
