定義
基因組選擇的最基本思路:在基因組中存在大量遺傳標記(SNP),影響性狀的所有基因都至少與一個標記緊密連鎖觅玻。因此通過對所有標記效應(yīng)的估計培漏,實現(xiàn)對全基因組所有基因效應(yīng)的估計。利用估計的標記效應(yīng)計算個體育種值牌柄,即基因組育種值(gEBV),然后根據(jù)gEBV的大小(或結(jié)合系譜蹋宦、后裔信息)進行選擇咒锻。
流程:
- 1.建立參考群體
a.選擇具有可靠育種值的驗證公牛或母牛
b.用SNP芯片測定每個個體的SNP基因型 - 2.利用估計SNP效應(yīng)的統(tǒng)計分析系統(tǒng)獲得一套SNP效應(yīng)估計值
- 3.建立估計gEBV的統(tǒng)計分析系統(tǒng)蒿辙,預(yù)測候選個體的gEBV用于選種。
在選擇群體中進行基因組選擇的基本過程:
1.測定候選個體的SNP基因型
2.計算個體gEBV
3.依據(jù)gEBV結(jié)合其它信息進行遺傳評定和排序
全基因組選擇的優(yōu)勢
- 1.能夠捕獲所有的遺傳變異
- 2.建立參考群估計出一套SNP效應(yīng)值后俺叭,對于候選個體不依賴表型信息泰偿、
- 3.選擇準確性更高(70%~90%)
- 4.可以早期選擇(縮短世代間隔)
- 5.可準確評定一些難于測定或新定義的性狀
- 6.降低育種成本
- 7.大幅度提高育種進展(20%~50%)甜奄。