linux 如何使用qsub命令投遞集群任務(wù) 2022-06-06

  • 投遞任務(wù)
exp:qsub -cwd -l vf=70g,num_proc=2 -q stt.q -P N0059 -binding linear:2 $filename
-cwd 使用當(dāng)前的目錄作為工作環(huán)境,所生成的所有文件默認(rèn)保存到投遞任務(wù)的當(dāng)前環(huán)境下裸准;
     否則默認(rèn)保存到home目錄下
-l vf=70g,num_proc=2 請(qǐng)求資源列表沟突,請(qǐng)求分配70g的內(nèi)存阻塑,和2個(gè)cpu資源
-q stt.q 將作業(yè)綁定到指定的隊(duì)列
-p N0059 根據(jù)分組號(hào)定義任務(wù)的優(yōu)先級(jí)措伐,不同的分組得到的優(yōu)先級(jí)不同
-bind liner:2 將作業(yè)綁定到處理器的內(nèi)核民晒,cpu核數(shù)尾序,與進(jìn)程數(shù)目有關(guān)悯许?
-pe smp 4 指定任務(wù)需要4個(gè)線程亥啦,與線程數(shù)目有關(guān)翩肌?
-e 定義標(biāo)準(zhǔn)錯(cuò)誤輸出的文件名
-o 定義標(biāo)準(zhǔn)輸出的文件名
  • 將參數(shù)寫(xiě)在shell腳本中
#!/bin/bash
#$ -cwd
#$ -l vf=70g,num_proc=2
#$ -q stt.q
#$ -p N0059
......
然后直接qsub *.sh即可
  • 查詢?nèi)蝿?wù)
qstat -f 查看所有的任務(wù)
qstat -u user 查看指定用戶的任務(wù)
qstat -r 查看正在運(yùn)行的任務(wù)
qstat -q 列出所有的隊(duì)列
qstat -a 查看所有的任務(wù)
  • 刪除任務(wù)
qdel -u user 刪除指定用戶的所有任務(wù)
  • 任務(wù)狀態(tài)
qw 等待
Eqw 出錯(cuò),一般是沒(méi)有給文件權(quán)限
r 正在運(yùn)行
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