文章一作Junyue Cao表示：“根據(jù)這些數(shù)據(jù)课兄，我們可以直接生成人類(lèi)組織中所有主要細(xì)胞類(lèi)型的目錄啄清，包括這些細(xì)胞類(lèi)型在組織中的基因表達(dá)如何變化晋修“赡耄”研究人員利用sci-RNA-seq3的技術(shù)，在15種類(lèi)型的胎兒組織中分析了基因表達(dá)飞蚓。這項(xiàng)技術(shù)用三個(gè)DNA“條形碼”的獨(dú)特組合標(biāo)記每個(gè)細(xì)胞滤港，從而使研究人員無(wú)需物理分離即可跟蹤細(xì)胞。研究人員就使用計(jì)算機(jī)算法來(lái)恢復(fù)單細(xì)胞信息趴拧，按類(lèi)型和亞型對(duì)細(xì)胞進(jìn)行聚類(lèi)溅漾，并確定它們的發(fā)育軌跡≈瘢科學(xué)家們分析了超過(guò)400萬(wàn)個(gè)單細(xì)胞添履，并鑒定出77種主要細(xì)胞類(lèi)型和大約650種細(xì)胞亞型。將人噢胚胎發(fā)育圖譜與現(xiàn)有的小鼠胚胎發(fā)育圖譜進(jìn)行了比較脑又。
染色質(zhì)可及性圖譜染色體可將DNA緊密包裝在細(xì)胞核中暮胧，染色質(zhì)可以對(duì)讀取DNA中編碼的遺傳指令進(jìn)行分子機(jī)器開(kāi)放和封閉的指令，了解打開(kāi)和關(guān)閉的DNA區(qū)域可以告訴科學(xué)家們細(xì)胞如何選擇打開(kāi)和關(guān)閉基因的问麸。通訊作者Darren Cusanovich說(shuō)：“研究染色質(zhì)可以發(fā)現(xiàn)細(xì)胞的調(diào)節(jié)性‘語(yǔ)法’要求往衷。開(kāi)放或可訪(fǎng)問(wèn)的DNA富含某些“詞語(yǔ)”，這些詞語(yǔ)反過(guò)來(lái)又是細(xì)胞確定其需要某些基因的基礎(chǔ)严卖∠幔”為了描述單個(gè)細(xì)胞中DNA的可及性，科學(xué)家們開(kāi)發(fā)了sci-ATAC-seq3的新方法哮笆。像sci-RNA-seq3一樣来颤，這一方法也在每個(gè)細(xì)胞中使用三種不同的DNA“條形碼”來(lái)標(biāo)記和跟蹤單個(gè)細(xì)胞。sci-ATAC-seq3并不是識(shí)別所有當(dāng)前表達(dá)的序列稠肘，而是捕獲并打開(kāi)了染色質(zhì)位點(diǎn)福铅。在這項(xiàng)研究中，科學(xué)家在15個(gè)胎兒組織的約100萬(wàn)個(gè)位置上生成了近80萬(wàn)個(gè)單細(xì)胞染色質(zhì)可及性概況项阴。他們解析了哪些蛋白質(zhì)可能與每個(gè)細(xì)胞中的可及DNA位點(diǎn)相互作用滑黔，以及這些相互作用如何影響細(xì)胞類(lèi)型。
