在使用Seurat進行單細胞分析時,使用FindNeighbors函數(shù)功能時扳还,出現(xiàn)下面的報錯
Error in validityMethod(as(object, superClass)) : object 'CsparseMatrix_validate' not found
這是Matrix
這個包有問題,需要更新Rtools,并重新裝載Matrix
這個包购岗,具體可執(zhí)行下面的方法
install.packages('installr')
library(installr)
install.Rtools()
install.packages('Matrix')
library(Matrix)
然后退出R重新運行就可以正常使用Seurat中FindNeighbors函數(shù)功能
參考文章
object ‘CsparseMatrix_validate‘ not found
https://github.com/satijalab/seurat/issues/6746