報錯處理——object ‘CsparseMatrix_validate‘ not found

在使用Seurat進行單細胞分析時,使用FindNeighbors函數(shù)功能時扳还,出現(xiàn)下面的報錯

Error in validityMethod(as(object, superClass)) :    object 'CsparseMatrix_validate' not found

這是Matrix這個包有問題,需要更新Rtools,并重新裝載Matrix這個包购岗,具體可執(zhí)行下面的方法

install.packages('installr')
library(installr)
install.Rtools()
install.packages('Matrix')
library(Matrix)

然后退出R重新運行就可以正常使用Seurat中FindNeighbors函數(shù)功能

參考文章
object ‘CsparseMatrix_validate‘ not found
https://github.com/satijalab/seurat/issues/6746

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