一箫踩、contigs
Contigs譯為“重疊群”腹备，指的是一組連續(xù)的重疊DNA序列。測序最初所得即為擁有重疊區(qū)的contigs回右。
二隆圆、scaffolds
Scaffolds譯為“骨架序列”，指的是被序列間隙分開的序列重疊群翔烁。將擁有重疊DNA序列的片段拼接起來構(gòu)成一個個Contig渺氧，某些Contigs因“序列間隙”而斷開，這些Contigs按序排列成Scaffolds蹬屹。而Scaffolds為物理間隙所隔斷侣背。
上面提到的“序列間隙”指的是那些測序時遺漏的序列，這些序列仍保留在尚未挑選到的克隆中慨默》纺停“物理間隙”則是構(gòu)建文庫時被丟失的DNA序列，它們可能從已知的克隆群體中永久性地消失了厦取。
每個骨架序列的標(biāo)記物被用來確定它在基因組圖譜中的位置（類似克隆重疊群的定位潮太，mapping）。例如蒜胖，如果STS在基因組圖譜中的位置是已知的消别，那么就可以通過確定骨架上含有哪種STS來對骨架進行定位抛蚤。
參考文獻
T. A. 布朗. 基因組3[M]. 第一版. 北京: 科學(xué)出版社, 2009.
