生物信息從零起步

? ? ? ?初次接觸生物信息還是在09年伊磺。那時(shí)候就覺(jué)得這是個(gè)很復(fù)雜很的技能斧拍。不過(guò)還是不了解具體的研究?jī)?nèi)容。認(rèn)為做DNA关摇,RNA荒叶,蛋白序列的比對(duì)就是生物信息的功能,真的是太孤陋寡聞了输虱。
? ? ? ? 12年開(kāi)始研究生生涯些楣,最初也沒(méi)有接觸過(guò)NGS的東西,知道這個(gè)很高深宪睹,高深在哪里也不知道愁茁。知道14年初,自己的課題涉及到RNA-seq才開(kāi)始了解這個(gè)技術(shù)的真正的目的亭病。從測(cè)序原理鹅很,到測(cè)序建庫(kù),測(cè)序能得到的數(shù)據(jù)開(kāi)始慢慢學(xué)習(xí)命贴。
? ? ? ? 15年開(kāi)始道宅,從事單細(xì)胞RNA-seq的實(shí)驗(yàn),實(shí)驗(yàn)室沒(méi)有人做過(guò)這個(gè)方向胸蛛,自己慢慢研究不同單細(xì)胞方法之間的優(yōu)劣污茵,不同方法的成本,實(shí)驗(yàn)操作難度等等葬项。一開(kāi)始也只是和公司合作泞当,將單細(xì)胞文庫(kù)構(gòu)建好給公司,當(dāng)時(shí)測(cè)序加數(shù)據(jù)的初步分析(到FPKM)公司收費(fèi)要1000+民珍,面對(duì)大量的樣品襟士,發(fā)現(xiàn)分析成了最大的成本消耗。所以分析成了心病嚷量。每一個(gè)分析陋桂,其實(shí)有些真的很簡(jiǎn)單,但是自己不會(huì)操作蝶溶,只能依附于公司的進(jìn)度嗜历,這個(gè)真的很頭疼宣渗。而且公司不知道你想要的結(jié)果,會(huì)無(wú)形之中錯(cuò)過(guò)很多有用的信息梨州。
? ? ? ? 在濕實(shí)驗(yàn)的學(xué)習(xí)中痕囱,因?yàn)椴僮鲉渭?xì)胞測(cè)序。針對(duì)微量樣品的實(shí)驗(yàn)操作得心應(yīng)手暴匠。慢慢的自己去研究不同測(cè)序的建庫(kù)方式鞍恢,以最小的成本對(duì)單細(xì)胞和微量細(xì)胞進(jìn)行了RNA-seq,ATAC-seq每窖,RRBS帮掉,WGBS,HiC的建庫(kù)岛请。令人尷尬的事出現(xiàn)了旭寿,數(shù)據(jù)全部躺在了硬盤(pán)里。面對(duì)這一現(xiàn)狀崇败,需要改變盅称。

? ? ? ?目前已經(jīng)在生殖中心上班,留給自己的時(shí)間真的很少后室,再不學(xué)習(xí)真的就跟不上了缩膝。咬咬牙,配了一個(gè)小的服務(wù)器岸霹,跟著大伙兒一起前進(jìn)疾层。希望這條路上可以走的遠(yuǎn)些。

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