Linux安裝軟件
下載miniconda,安裝 搜索 卸載軟件都在這里
查看是否有bzip2
bzip2
bzip2
我用阿里云沒有需要自行下載bzip2
輸入命令
yum install -y bzip2
安裝成功
百度官網(wǎng)下載miniconda
python 64-bit
python 64-bit
依次輸入命令
cd biosoft
wget 復(fù)制下載鏈接
下載成功
下載成功后開始安裝miniconda
輸入命令bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
進(jìn)行安裝
安裝成功
安裝成功后開始激活
#source ~/.bashrc
#conda
滿屏信息說明成功
添加國內(nèi)鏡像代碼粘貼復(fù)制即可
安裝完成后開始初步使用
conda list
查看所有軟件列表
conda search fastqc
搜索軟件fastqc
conda install fastqc -y
安裝軟件
conda remove fastqc -y
卸載軟件
conda 環(huán)境
這個對于以后要做數(shù)據(jù)分析的話 感覺是必備的
需要先看看conda有哪些環(huán)境然后建立新環(huán)境
conda info --envs
conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y
創(chuàng)建完畢再次查看conda info --envs
conda環(huán)境創(chuàng)建成功
激活新conda環(huán)境
source activate rna-seq
卸載某個軟件
conda remove -n rna-seq fastqc -y
卸載整個環(huán)境
conda remove -n rna-seq --all
目前還不知道怎么退出新建環(huán)境狀態(tài) 是直接關(guān)閉終端嗎嫂粟?
答:輸入代碼source deactivate rna-seq
失活環(huán)境即可退出
大致學(xué)習(xí)內(nèi)容
今天的學(xué)習(xí)感受到linux的強(qiáng)大读虏,责静,而且真的需要反復(fù)練習(xí)才能記住阿,盖桥,太容易忘了灾螃,,