寫在前面
很久很久以前,TBtools推出了熱圖工具局荚。在后續(xù)用戶的使用過程中超凳,我們發(fā)現(xiàn),有時候我們可能像一次展示上百個基因耀态。這樣會使得整個圖片顯得很長轮傍,以至于一張A4紙可能都完全放不下,如下
對于這種情況首装,在之前的推文创夜,我也已經(jīng)提過,直的不行仙逻,那么就掰彎嘛驰吓。TBtools使用的是我早前開發(fā)的繪圖引擎JIGplot,所以幾乎所有圖形都是可以掰彎的系奉,熱圖也不例外檬贰,如下:
掰彎的熱圖提出來之后,有幾個朋友使用了也最終發(fā)表于學(xué)術(shù)期刊缺亮,但在此同時翁涤,有較多用戶總是遇到不知道如何掰彎這個問題。
這幾天,我們課題組在做暑期培訓(xùn)迷雪,同樣的限书,參與討論的不少朋友也是掰不彎虫蝶,可能大家都太直了吧章咧。
TBtools熱圖增加自動掰彎功能!
是的能真,我一直并沒有去增加這個自動掰彎的功能赁严。其中一個主要的原因是,我覺得似乎并沒有必要粉铐,畢竟似乎這種熱圖不一定很多人會喜歡疼约。但事實似乎不是如此。這個掰彎熱圖給我?guī)砀嗟挠脩魡栴}蝙泼,這并不是我想看到的程剥。既然,你們掰不彎汤踏,那么我就提供一個快捷方式织鲸,讓大家隨時可以掰彎。
首先溪胶,繪制出普通的熱圖搂擦,參考以前公眾號的推文即可
點擊可得
點擊Show Control Dialog,即打開控制參數(shù)哗脖,點擊Auto Polar瀑踢,隨后,按照自己的需求調(diào)整對應(yīng)的參數(shù)即可才避。
我們當(dāng)然是可以聚類橱夭,不過,暫時只支持對行的聚類
當(dāng)然桑逝,我們會進行行標(biāo)準化棘劣,進行顏色變換,調(diào)整Legends的擺放方式
輕輕松松肢娘,你可以得到很久以前呈础,對外擺出的孔雀熱圖
寫在最后
OK,暑期培訓(xùn)橱健,我負責(zé)的區(qū)塊已經(jīng)講演完畢而钞。要開始趕課題啦。
最后拘荡,祝大家科研順利臼节。