2022-2-7 凌晨
我很喜歡思考問題仰坦，所以有時候顯得想的很多。我的生信學(xué)習(xí)一路走來良瞧，我積攢了數(shù)篇學(xué)習(xí)筆記陪汽、學(xué)習(xí)計劃和學(xué)習(xí)總結(jié)，臨到最近褥蚯，我想不起來學(xué)習(xí)過程中許多的細(xì)節(jié)挚冤，頭腦似乎都在琢磨今后要走的路，所以與其說今天這篇文章是總結(jié)赞庶，不如說是未來的思考和方向训挡。
定位我的方向
我學(xué)習(xí)生信將近3年，真是一點也不敢說自己是生信進(jìn)階了歧强，只敢說自己一句入門了澜薄。這個交叉學(xué)科的涉及范圍之廣泛，包容性之巨大摊册，讓我時時疑問到底我應(yīng)該往哪條路繼續(xù)肤京。在這里，我們簡單地理解生信為計算機(jī)+生物茅特。測序分析是它忘分，進(jìn)化推演是它，結(jié)構(gòu)摸索是它白修，分類回歸是它……處處皆有它妒峦，那么復(fù)雜，那么多樣熬荆。
我接下來想做的舟山，是測序數(shù)據(jù)分析+ 模型研究人體疾病。
三個專家
在我學(xué)習(xí)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的一門課程里卤恳，提到一個完整的機(jī)器學(xué)習(xí)模型或者說產(chǎn)品的故事：
總的來說累盗，就是領(lǐng)域?qū)＜叶x問題，預(yù)測結(jié)果和行為突琳；數(shù)據(jù)科學(xué)家根據(jù)問題對數(shù)據(jù)進(jìn)行梳理和分析若债，選取模型或者自訓(xùn)練模型解釋數(shù)據(jù)；AI專家對模型的精度和性能進(jìn)行研究和提升拆融。
原作者解釋蠢琳，三個專家啊终，時常身份重疊。因此我初步誕生了我的定位和方向：我想成為三個專家傲须，沒錯蓝牲，三個。
做什么
首先我們借鑒機(jī)器學(xué)習(xí)的一個重要計算方式：反向累積/反向傳遞泰讽，進(jìn)行一個梳理例衍，有了明確的目標(biāo)，就能夠推導(dǎo)接下來我該怎么辦了已卸。
1.領(lǐng)域?qū)＜?/em>
對領(lǐng)域的熟悉不是一朝一夕能夠練就的佛玄。大概和每個實驗室都有自己獨特的實驗配方和技巧一樣，領(lǐng)域的掌握不是一兩天可以說完的累澡。我正處在轉(zhuǎn)方向的關(guān)鍵時期梦抢，博士的畢業(yè)后雖然確實可以改變方向，但是隨著對領(lǐng)域的理解不斷深入愧哟，作出成果的可能性越高奥吩，也更容易出彩。
我想我博士就應(yīng)該選擇一個自己已經(jīng)有一定了解翅雏，并且真的非常感興趣圈驼、有前景的領(lǐng)域，并且堅持在這個領(lǐng)域做下去望几，我選擇人體疾病绩脆。接下來2-3個月，我會重點去了解腫瘤領(lǐng)域的基礎(chǔ)知識和前沿信息橄抹，一旦進(jìn)入腫瘤領(lǐng)域靴迫，這個全世界最聰明最優(yōu)秀的醫(yī)學(xué)工作者扎堆的地方，拼命就是一種必然楼誓。
2.數(shù)據(jù)科學(xué)家
說到這個問題玉锌，我就知道，該來的總會來的疟羹。統(tǒng)計學(xué)主守、數(shù)學(xué)必須好好學(xué)，一個優(yōu)秀的數(shù)據(jù)科學(xué)家不是單純的會跑腳本榄融，會寫程序就結(jié)束了参淫，必須了解背后的算法以及數(shù)學(xué)意義，它的理論愧杯。
3.AI專家
說實在的涎才，我大言不慚地說自己相當(dāng)三個領(lǐng)域的專家時，并不是相做一個在每個領(lǐng)域都能對所有知識如數(shù)家珍的人力九。生物我就只研究腫瘤耍铜，數(shù)據(jù)科學(xué)我就針對于測序數(shù)據(jù)和生物系統(tǒng)數(shù)據(jù)邑闺，而AI，我想針對神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)或者更小一些的范疇——RNN棕兼、GNN或者CNN陡舅。
怎么做
一年為限
| 時間段 | 任務(wù)內(nèi)容 | 目標(biāo) |
|---|---|---|
| 1-2月 | R語言基礎(chǔ)和進(jìn)階 | 達(dá)到寫包的水平 |
| 1-2月 | GNN和pytorch入門和應(yīng)用 | 熟練應(yīng)用pytorch進(jìn)行模型訓(xùn)練，入門GNN |
| 2-3月 | GNN和pytorch應(yīng)用和研究計劃 | 1.熟悉熟讀生物領(lǐng)域應(yīng)用Deep learning的文章伴挚；2.完善研究計劃 |
| 4-6月 | 第二個項目 | 1.GNN實戰(zhàn)蹭沛，完成寫作；2.備考GRE |
| 7月 | 考GRE和研究新項目 | 完成GRE考試 |
| 8月 | 新項目準(zhǔn)備 | 新項目文獻(xiàn)收集 |
| 9-12月 | 1.申請學(xué)校章鲤；2.完成第二個項目 | 申請北美和歐洲學(xué)校；完成第二個項目和投稿 |
