1.一代測序技術
第一代DNA測序技術桑格爾-雙脫氧鏈終止法是最為經(jīng)典的一代測序技術瓢宦,人類基因組計劃(HGP)主要基于第一代測序技術。HGP完成后殖妇,進入后基因組時代刁笙,成本高、通量低的傳統(tǒng)測序技術不能滿足深度測序和重復測序等大規(guī)模基因組測序的要求疲吸。
2.二代測序技術
Roche公司的454技術座每、illumina公司的Solexa/Hiseq技術和ABI公司的SOLID技術標志第二代測序技術誕生。其中Roche公司的454測序系統(tǒng)是第二代測序技術中第一個商業(yè)化運營的測序平臺摘悴。其中Illumina市場規(guī)模占到75%以上峭梳,主打Hiseq。
3.三代測序技術
第三代測序技術以PacBio公司的SMRT和Oxford Nanopore Technologies 的納米孔單分子測序技術為標志蹂喻,不需要經(jīng)過PCR擴增葱椭,超長讀長,可達二代測序的100倍以上口四,實現(xiàn)了對每一條DNA分子的單獨測序孵运。錯誤率比二代要高,達到10-15%蔓彩。
4.全轉(zhuǎn)錄組測序流程
(1)樣品采集:新鮮樣本治笨,避免RNA酶污染
(2)RNA抽提質(zhì)檢:多種檢測方法,確保RNA質(zhì)量
(3)illumina平臺測序
(4)生信分析+數(shù)據(jù)挖掘