題目:Molecular Fingerprint for Terminal Abdominal Aortic Aneurysm Disease
DOI: 10.1161/JAHA.117.006798
數(shù)據(jù)集: GSE98278
樣本:
eAAA: 31
rAAA: 17
分析方法:
DEG: R((|log 2 fold change - [FC]| ≥1.5, adjusted P<0.05)
Ingenuity Pathway Analysis : 上游調(diào)控因子的分析
IHC/RT-PCR:驗證差異基因
文章數(shù)據(jù):
1.實驗設(shè)計及差異基因火山圖（破裂vs穩(wěn)定壳快，中等vs大）
2.標(biāo)本的病人信息
3.驗證的基因列表
4.破裂vs穩(wěn)定AAA上調(diào)井濒、下調(diào)差異基因列表
5.中等vs大AAA上調(diào)、下調(diào)差異基因列表
6.候選基因的在不同組的表達水平
7.驗證與AAA破裂和尺寸變化相關(guān)的5個基因
8.驗證與AAA size無關(guān)的候選基因表達情況
9.AAA獨有的差異基因表達情況
10.IHC驗證候選基因
11.破裂AAA中新生血管情況
12.上游調(diào)控因子分析結(jié)果
13.破裂AAA與HIF-1a密切相關(guān)
14.EndoMT過程中HIF-1a表達
