各位讀者朋友們大家好啊茫陆，本次的教程其實于上一期已在B站（up主：全哥的學習生涯）上進行了視頻教學金麸，但因為偏倚風險評估在meta分析中的地位尤為重要，而在之前的文章中并未針對此有過說明簿盅，故為了方便大家閱讀和快速掌握挥下，我將上一期視頻的內(nèi)容濃縮成了本次文字版的教程。meta分析的偏倚風險評估圖挪鹏，也就是ROB圖见秽，Risk of bias，通常意義上讨盒，一篇正規(guī)meta分析一般往往會對偏倚風險或納入原始研究的質量進行評估解取，所以最初就有Cochrane的偏倚風險評估工具，用Revman做出來的圖形如圖1所示返顺，但是其缺點是無法對字體禀苦、顏色、格式等進行調整遂鹊，其遠遠不如R語言實現(xiàn)起來更容易與方便振乏。R語言完全可以重現(xiàn)ROB圖。(需要本教程原始數(shù)據(jù)及完整程序命令的可在公眾號(全哥的學習生涯)內(nèi)回復“ROB”獲取)
1. 準備工作
1.1 準備數(shù)據(jù)
首先假如我們納入的原始研究是橫斷面研究秉扑，在這里我采用美國衛(wèi)生保健質量和研究機構(AHRQ)為評估橫斷面研究質量而編制的量表（當然也可以自定義條目或者采取其它量表）慧邮，其條目共分11項调限，每一項對應YES,NO,UNCLEAR三項，也即低風險误澳，UNCLEAR和高風險耻矮，因為是為大家演示之用，所以自定義取前十條評估某meta分析的各原始研究忆谓，其原始數(shù)據(jù)如圖2所示裆装，Overall代表此原始研究整體風險情況（按評分來劃分），Weight則代表每個研究的權重倡缠，在這里可以采用森林圖上經(jīng)過倒方差法計算出來的權重值（注意區(qū)分固定效應模型與隨機效應模型）哨免，或者直接采用原始研究的樣本量作權重，圖2所示的為樣本量作為數(shù)據(jù)權重的情況昙沦。
1.2 安裝加載R包
作ROB圖最為經(jīng)典的包就是robvis包了（也可以使用dmetar包琢唾，其table參數(shù)指定為TRUE時繪制的就是圖1Revman風格的圖片），我們需要安裝和加載此包盾饮。若同時還想生成圖片的標題與副標題慧耍，需同時安裝并加載ggplot2包。
install.packages(c(“robvis”,”ggplot2”))
library(robvis)
library(ggplot2)
1.3 導入數(shù)據(jù)
setwd(dir="C:/Users/86187/Desktop") #設置工作路徑
data <- read.csv("C:/Users/Desktop/data.csv") #導入數(shù)據(jù)
2. 制作Summary圖
rob_summary(data = data,tool="ROB1",overall = TRUE,weighted = TRUE,colour=c("orange","green","skyblue"))+ggtitle(主標題,副標題)+theme(plot.title = element_text(hjust=0.5))
圖形效果如圖3所示丐谋，在上述代碼中芍碧，weighted代表是否按權重作圖，默認為TRUE号俐，可以改為FALSE泌豆；colour是對圖片顏色的定義，可以用顏色代碼表示吏饿；tool代表不同的評估方法踪危，ROB1可以自定義，其他評估方法參數(shù)的解釋如下：
ROB2:the new Cochrane risk of bias tool for randomized controlled trials;
ROBINS-I:the Risk of Bias in Non-randomized Studies-of Interventions tool;
QUADAS-2,the Quality and Applicability of Diagnostic Accuracy Studies,Version 2;
在ggtitle(主標題,副標題)中可以設置你自己研究的主副標題猪落。
theme(plot.title = element_text(hjust=0.5))表示設置主標題居中贞远。
3. 制作traffic light圖
rob_traffic_light(data = data,tool="ROB1",colour=c("orange","green","skyblue"),psize = 10)+ggtitle(主標題,副標題)+theme(plot.title = element_text(hjust=0.5))
圖形效果如圖4所示，上述代碼中笨忌，data,colour等參數(shù)功能均與上述代碼相同蓝仲；psize表示中間圓圈的大小，可以自行修改數(shù)值來調整大小官疲。
4. 導出圖片
可以保存成PDF袱结、PNG、JPEG途凫、TIFF等格式垢夹，在圖5中1處修改即可，因為默認生成的圖片會很擠维费，因此可以自行調整圖片的寬和高果元，可在圖5中2處修改尺寸即可促王，再點擊save即可保存到工作路徑。
