在GEO檢索時(shí)佩脊，總能見到一些奇怪命名的樣本戈毒，這或許與測(cè)序時(shí)的脫敏相關(guān)袜刷，但這也給后續(xù)數(shù)據(jù)使用時(shí)的篩選帶來不便，本期主要介紹一個(gè)數(shù)據(jù)庫愕宋，能大大提高樣本篩選時(shí)的效率
1. 擬解決的問題
1.1 樣本名稱不明確
在GEO數(shù)據(jù)庫挖掘中玻靡，會(huì)遇到以上這樣的情況，樣本名是一個(gè)代碼中贝，如果要看每個(gè)樣本具體的處理情況囤捻，就需要單個(gè)點(diǎn)擊每個(gè)GSM樣本來查看，非常費(fèi)勁
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1.2 樣本量大
300多個(gè)樣本雄妥，一個(gè)個(gè)看也特別麻煩
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2. 數(shù)據(jù)庫介紹
數(shù)據(jù)庫地址
https://haoran-chen.shinyapps.io/GEO_Sample_DataBase/
功能
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使用方法及功能
- 輸入GSE id最蕾，點(diǎn)擊Search
- 右側(cè)出現(xiàn)所有樣本的詳細(xì)信息
- 可以實(shí)現(xiàn)篩選依溯、排序功能
- 篩選結(jié)束后可下載
3. 小結(jié)
大道至簡，小小數(shù)據(jù)庫實(shí)現(xiàn)單一的功能瘟则，在枯燥的科研中提升一點(diǎn)點(diǎn)效率黎炉，有需要的話可以使用，如果有建議或意見醋拧，還請(qǐng)聯(lián)系指正慷嗜！
感謝觀看，如果有用還請(qǐng)點(diǎn)贊丹壕，關(guān)注
