該數(shù)據(jù)庫致力于收集翻默、整理和提供規(guī)范化的miRNA命名信息辆童,為學術界提供方便快捷的查詢工具隧期。通過使用這個數(shù)據(jù)庫飒责,研究者能夠迅速找到所需的miRNA...
好久不見席里, 最近一直沒更新, 日更幻想破滅了庭砍, 不過還是很開心性置, 建庫成功了 建庫背景: 又逢一年畢業(yè)季拾并, 每次引文都要一篇一篇復制粘貼去Pub...
手敲一篇推文,昨天搭了個數(shù)據(jù)庫鹏浅,主要用于存放和檢索PubMed中出現(xiàn)過的數(shù)據(jù)庫~ 地址: https://haoran-chen.shinyap...
其實經(jīng)常分析TCGA數(shù)據(jù)庫時會發(fā)現(xiàn)嗅义,clinical.tsv中基本沒什么可用信息,大部分數(shù)據(jù)都是缺失的隐砸,那么芥喇,如何獲取比較全面的臨床數(shù)據(jù),有哪些...
在STRING數(shù)據(jù)庫中提交基因凰萨,獲取PPI網(wǎng)絡是比較常規(guī)的操作,包括下游使用cytoscape進行美化和hub網(wǎng)絡的提取械馆,但過程還是比較麻煩胖眷,本...
在GEO檢索時,總能見到一些奇怪命名的樣本霹崎,這或許與測序時的脫敏相關珊搀,但這也給后續(xù)數(shù)據(jù)使用時的篩選帶來不便,本期主要介紹一個數(shù)據(jù)庫尾菇,能大大提高樣...
本系列主要定期集中記錄一些實用的生信操作 1. 第一列作為行名境析,構(gòu)建數(shù)值矩陣 假如我剛讀取了一個表達譜矩陣gene_exp囚枪,第一列為基因名,其余...
我個人看法沛鸵,不一定對哈括勺,首先,GSEA和GSVA不是一回事曲掰,不能放在一起說疾捍。 GSVA主要是通過感興趣的基因集來劃分樣本,有樣本基因表達譜和一個...