大病毒

病毒不是嚴(yán)格意義上的生命,只能寄生在宿主細(xì)胞內(nèi)羽德。病毒很小父叙,結(jié)構(gòu)也非常簡(jiǎn)單神郊,通常由一種核酸(DNA或RNA)和蛋白質(zhì)外殼構(gòu)成肴裙,有些病毒還含有脂質(zhì)和蛋白質(zhì)組成的包膜。有一類(lèi)被稱(chēng)為類(lèi)病毒的家伙干脆連蛋白質(zhì)都不要了涌乳,只剩下一個(gè)RNA基因組“繁衍生息”蜻懦。而朊病毒只是一類(lèi)具有異常結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì),所以科學(xué)家們一直在爭(zhēng)論是否應(yīng)該把它劃入病毒夕晓。病毒基因組所編碼的蛋白質(zhì)種類(lèi)非常有限宛乃,一般僅包括構(gòu)成病毒顆粒的結(jié)構(gòu)蛋白,負(fù)責(zé)病毒基因組復(fù)制和病毒顆粒組裝的非結(jié)構(gòu)蛋白蒸辆,而病毒復(fù)制擴(kuò)增所不可缺少的蛋白質(zhì)翻譯和物質(zhì)能量代謝等過(guò)程都需要依靠宿主細(xì)胞來(lái)完成征炼。

相比病毒而言,細(xì)胞體積要大得多躬贡,成分和結(jié)構(gòu)也更為復(fù)雜谆奥。后者同時(shí)含有DNA和RNA兩種核酸,基因組編碼信息量大拂玻,能夠自主進(jìn)行物質(zhì)能量代謝和蛋白質(zhì)合成酸些,而且具有增殖的能力或潛力。所以檐蚜,所有真核細(xì)胞和原核細(xì)胞生物都和病毒劃清了界限魄懂。科學(xué)家往往通過(guò)上述特征闯第,來(lái)區(qū)分病毒和細(xì)胞生命體市栗。但是,地球上的生命類(lèi)型是多樣的乡括,當(dāng)我們絞盡腦汁為它們劃定界限時(shí)肃廓,總會(huì)出現(xiàn)一些“不守規(guī)矩”的家伙智厌。

有一類(lèi)比較特殊的微生物叫衣原體诲泌,它的體積比典型的細(xì)菌小很多,寄生于活細(xì)胞中铣鹏,過(guò)去一度被認(rèn)為是一種病毒敷扫。但是隨著認(rèn)識(shí)的深入,科學(xué)家發(fā)現(xiàn)诚卸,衣原體生命周期雖然需要宿主細(xì)胞提供能量葵第,但其同時(shí)含有DNA和RNA兩種核酸,外被與細(xì)菌類(lèi)似的細(xì)胞壁合溺,同時(shí)還對(duì)多種抗生素敏感卒密,所以后來(lái)將其歸入廣義的細(xì)菌范疇。

到了1992年棠赛,又有一種“不守規(guī)矩”的家伙出現(xiàn)了哮奇。這也是一種寄生體膛腐,它在革蘭氏染色(細(xì)菌鑒別染色方法)時(shí)類(lèi)似于細(xì)菌,但是只含有一種類(lèi)型的核酸鼎俘,不能自主完成生命周期哲身。由于這些特征,科學(xué)家在2003年時(shí)將它歸為病毒贸伐,并正式命名為Mimivirus(mimi:mimicking microbe勘天,酷似細(xì)菌)。發(fā)現(xiàn)一種新的病毒不是新鮮事捉邢,因?yàn)楝F(xiàn)在已經(jīng)發(fā)現(xiàn)的病毒僅占了地球上病毒種類(lèi)的一小部分脯丝。然而,Mimivirus的發(fā)現(xiàn)卻徹底刷新了人們對(duì)于病毒的認(rèn)識(shí)伏伐,原因在于巾钉,這種病毒很大,超過(guò)了人們?cè)菊J(rèn)為病毒所應(yīng)該擁有的大小秘案,于是科學(xué)家們興奮地宣布砰苍,他們發(fā)現(xiàn)了世界上最大的病毒。

這種病毒大到什么程度呢阱高? 我們回顧一下病毒的發(fā)現(xiàn)來(lái)說(shuō)這個(gè)問(wèn)題赚导。

100多年前,孟德?tīng)杽倓偡N出他那劃時(shí)代的豌豆赤惊,一種會(huì)導(dǎo)致煙草這一經(jīng)濟(jì)作物減產(chǎn)的花葉病引起了人們的關(guān)注吼旧。1892年,俄國(guó)科學(xué)家伊凡諾夫斯基把患有花葉病的煙草葉子搗碎成汁未舟,并用使用一種濾器來(lái)過(guò)濾圈暗,卻發(fā)現(xiàn)過(guò)濾液仍能導(dǎo)致另外的植株生病。他使用的濾器孔徑大約為0.2-0.4微米裕膀,而典型的細(xì)菌直徑大約在0.5微米到5微米之間员串,這種孔徑的濾器可以過(guò)濾掉幾乎所有的細(xì)菌,所以他認(rèn)為這種感染性物質(zhì)可能是細(xì)菌分泌的毒素昼扛。隨著研究的深入寸齐,科學(xué)家發(fā)現(xiàn)這是一種具有傳染性的可溶性分子,并可在宿主細(xì)胞內(nèi)擴(kuò)增〕常現(xiàn)在我們知道渺鹦,這種可溶性分子就是病毒,它的直徑通常小于0.2微米蛹含,可以自由的通過(guò)細(xì)菌濾器毅厚,所以在相當(dāng)長(zhǎng)一段時(shí)間里,病毒也被稱(chēng)為濾過(guò)性病毒浦箱,還有人利用這種方法來(lái)判斷一種微生物是不是病毒吸耿。

Mimivirus的直徑大約在0.4-0.5微米窜护,它的直徑比脊髓灰質(zhì)炎病毒(直徑約為0.02-0.03微米)大幾十倍鸦难,幾乎不能通過(guò)細(xì)菌濾器乳规,所以這種寄生物放在過(guò)去集漾,肯定是不會(huì)被歸入病毒范疇的。Mimivirus的大小不僅體現(xiàn)在體積上板乙,它的基因組含有近120萬(wàn)個(gè)堿基對(duì)是偷,相比之下,脊髓灰質(zhì)炎病毒僅含有約7500個(gè)堿基對(duì)募逞〉懊科學(xué)家對(duì)其基因組序列分析后發(fā)現(xiàn),這種病毒大約編碼1000多個(gè)基因放接,是一般病毒的幾十倍到上百倍刺啦,而且其中相當(dāng)一部分從來(lái)沒(méi)有在已知的病毒中發(fā)現(xiàn)過(guò)。更讓科學(xué)家驚訝的是纠脾,這種病毒竟然自己編碼了涉及基因組DNA修復(fù)和蛋白質(zhì)翻譯功能的部分基因玛瘸,而這些功能一直以來(lái)都被認(rèn)為僅存在于細(xì)胞生命體中。不過(guò)苟蹈,由于Mimivirus不編碼核糖體相關(guān)蛋白糊渊,所以它仍然需要借助宿主細(xì)胞的翻譯系統(tǒng)才能完成自己蛋白質(zhì)的翻譯慧脱。

2008年,科學(xué)家們又發(fā)現(xiàn)了一種大病毒菱鸥,命名為Mamavirus (其實(shí)起這個(gè)名字是為了和Mimivirus相呼應(yīng),連來(lái)就是媽媽咪咪病毒)氮采。這種病毒的大小和基因組長(zhǎng)度與Mimivirus差不多殷绍,它的宿主也是阿米巴原蟲(chóng)。這些發(fā)現(xiàn)扳抽,使得科學(xué)家們對(duì)于這類(lèi)巨型病毒(giant virus)的研究越來(lái)越感興趣。



2011年,一種更大的病毒在智利海岸被分離出來(lái)拢军,這種病毒被命名為Megavirus chilensis楞陷,個(gè)頭比Mimivirus大6.5%,基因數(shù)量也多了10%茉唉。于是科學(xué)家們又一次興奮地宣布固蛾,他們發(fā)現(xiàn)了世界上最大的病毒。

然而艾凯,這個(gè)記錄僅保持了兩年就被刷新了。2013年7月蜡感,同為發(fā)現(xiàn)Megavirus chilensis的研究小組又宣布他們發(fā)現(xiàn)了兩種更大的病毒恃泪,分別是從智利Tunquen河口的表層沉積物層中采集到的Pandoravirus salinus(潘多拉病毒郑兴,salinus:咸的)贝乎,和從澳大利亞墨爾本附近的一個(gè)淺層淡水池塘分離到的Pandoravirus dulcis(潘多拉病毒,dulcis:甜的)览效,這兩種病毒的宿主也是阿米巴原蟲(chóng)。



潘多拉病毒的發(fā)現(xiàn)禁筏,再一次刷新了人們對(duì)于病毒的認(rèn)識(shí)衡招,它的長(zhǎng)徑可以達(dá)到1微米,甚至超過(guò)了一些細(xì)菌(金黃色葡萄球菌直徑在0.5-1.0微米)始腾,已經(jīng)可以輕松的在普通光學(xué)顯微鏡下看到。其中咸的潘多拉病毒基因組長(zhǎng)度達(dá)到247萬(wàn)個(gè)堿基對(duì)(大腸桿菌基因組長(zhǎng)度大約為400多萬(wàn)個(gè)堿基對(duì))浪箭,編碼了2500多個(gè)基因,大約為人類(lèi)基因組編碼數(shù)量的十分之一匹表。

經(jīng)過(guò)初步分析宣鄙,潘多拉病毒基因組中有約93%的基因功能未知,而且在目前已知的生命體中找不到相似的基因冻晤。在可知的信息中,科學(xué)家發(fā)現(xiàn)潘多拉病毒也編碼了一些蛋白質(zhì)翻譯系統(tǒng)中的組分设江,但仍然不能自己完成蛋白質(zhì)合成。另外叉存,依然沒(méi)有找到負(fù)責(zé)糖代謝的酶和構(gòu)成細(xì)胞骨架的蛋白,而這些蛋白質(zhì)在細(xì)胞生命體物質(zhì)能量代謝和分裂增殖中發(fā)揮了重要的功能歼捏。同時(shí),科學(xué)家在潘多拉病毒的基因組中發(fā)現(xiàn)了大量的內(nèi)含子挠铲,這進(jìn)一步增加了其基因組的復(fù)雜性寂诱。由于對(duì)這種病毒知之甚少拂苹,還很難對(duì)它的起源和進(jìn)化進(jìn)行研究痰洒,也正是由于有太多的未知,對(duì)于這種病毒的研究就像打開(kāi)了潘多拉魔盒脯宿,里面會(huì)有更多的驚奇等待著科學(xué)家們?nèi)グl(fā)現(xiàn)。

潘多拉病毒的發(fā)現(xiàn)著實(shí)又讓科學(xué)家們興奮了一次连霉,這項(xiàng)研究發(fā)表在著名的《科學(xué)》雜志上嗡靡,同樣,他們又一次向世界宣布讨彼,這是目前發(fā)現(xiàn)的世界上最大的病毒。誰(shuí)也不知道未來(lái)還會(huì)不會(huì)有更大的病毒被發(fā)現(xiàn)哩至,不過(guò),大病毒的發(fā)現(xiàn)菩貌,打破了人們對(duì)于病毒的經(jīng)典認(rèn)識(shí)袁辈,促使科學(xué)家們重新思考病毒的定義以及生命和非生命界限的劃分。




有科學(xué)家認(rèn)為大病毒可能來(lái)源于某些單細(xì)胞生物體晚缩,它們?cè)谶M(jìn)化過(guò)程中丟失了一些基因,便成為了行寄生生活的病毒冈敛。由于大病毒的特殊性,也有科學(xué)家建議將它們單獨(dú)劃為一域抓谴,并加入以往分為細(xì)菌寞缝,古生菌和真核生物的三域系統(tǒng)。然而荆陆,目前,這些巨型的寄生微生物仍被歸入病毒范疇帜消,是因?yàn)樵谝欢ǔ潭壬吓ㄌ澹鼈內(nèi)匀环辖?jīng)典病毒的特征,比如只含有一種核酸命浴,不能自主進(jìn)行能量代謝,無(wú)法自我分裂增殖媳溺,只在宿主細(xì)胞中顯示出生命特性跪腹。也正是因?yàn)椤安皇匾?guī)矩”,大病毒的發(fā)現(xiàn)進(jìn)一步拉近了生命與非生命之間的距離冲茸,也為生命起源和進(jìn)化的研究提供了重要的信息。

值得欣慰的是轴术,現(xiàn)在發(fā)現(xiàn)的大病毒對(duì)人類(lèi)并沒(méi)有什么威脅,僅有極少數(shù)報(bào)道說(shuō)Mimivirus可能會(huì)引起人類(lèi)肺炎盖袭。最后,推薦 Giant Virus Site (www.giantvirus.org)給大家作為學(xué)習(xí)資料弟塞,這個(gè)網(wǎng)站上收集了近年來(lái)人們對(duì)于巨型病毒的認(rèn)識(shí)拙已,同時(shí)還列出了基因組最大的100多種病毒的信息(http://www.giantvirus.org/top.html)。


參考文獻(xiàn):

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ArslanD. et al, Distant Mimivirus relative with a larger genome highlights thefundamental features of Megaviridae. PNAS 2011; 108: 17486-17491

NadègePhilippe et al. Pandoraviruses: Amoeba Viruses with Genomes Up to 2.5 MbReaching That of Parasitic Eukaryotes. Science 2013; 341: 281-286

(本文已發(fā)表于《飛碟探索》)

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