如何設(shè)計CHIP的引物

已有高通量的結(jié)果烛愧，如何根據(jù)chip-seq或者cut tag結(jié)果設(shè)計引物

測序可以知道蛋白結(jié)合DNA的位點（DNA序列的起始位置）

1.首先通過UCSC獲得特點位置的DNA序列

選擇hg38的基因組

輸入序列位置

即可獲得DNA序列

2.通過DNA序列設(shè)計引物

BLAST: Basic Local Alignment Search Tool (nih.gov)

選擇primer-blast

粘貼序列到PCR TEMPLATE崖堤，MAX選擇250，C,G比例調(diào)節(jié)一下疹启，其他按照正常設(shè)計引物來，get primer

利用UCSC-blast檢測。選擇in-silico pcr

選擇TARGET，可選編碼區(qū)和非編碼區(qū)节值。

得到blast結(jié)果

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