Single cell RNA-seq analysis workshop
該系列課程由瑞典國家生物信息學基礎設施(NBIS) 負責設置甥材，為瑞典Phd學生天吓，博士后鲫凶，研究人員和瑞典學術界的其他工作人員開設的全國性研討會许布。
本課程將通過演講和實戰(zhàn)練習涵蓋了單細胞轉錄組（scRNA-seq）數(shù)據(jù)分析的基本步驟替废。涵蓋的主題包括：
- An overview of the current scRNAseq technologies（當前常用scRNA-seq技術概述）
- Basic overview of pipelines for processing raw reads into expression values（原始測序數(shù)據(jù)比對轉換為基因表達矩陣的分析流程概述）
- Quality control of scRNAseq data（scRNA-seq數(shù)據(jù)的質量控制）
- Dimensionality reduction and clustering techniques（數(shù)據(jù)降維和聚類分析技術）
- Data normalization（數(shù)據(jù)歸一化處理）
- Differential gene expression for scRNAseq data（scRNA-seq數(shù)據(jù)的差異基因表達分析）
- Celltype prediction（細胞類型預測）
- Trajectory analysis（細胞軌跡擬時分析）
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Comparison of different analysis pipelines such as Seurat, Scran and Scanpy（不同分析工具流程的比較箍铭，如Seurat，Scran和Scanpy）
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NBIS系列單細胞轉錄組數(shù)據(jù)分析實戰(zhàn)（一）：數(shù)據(jù)質控
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NBIS系列單細胞轉錄組數(shù)據(jù)分析實戰(zhàn)（二）：數(shù)據(jù)降維可視化
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NBIS系列單細胞轉錄組數(shù)據(jù)分析實戰(zhàn)（三）：多樣本數(shù)據(jù)整合
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NBIS系列單細胞轉錄組數(shù)據(jù)分析實戰(zhàn)（四）：細胞聚類分析
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NBIS系列單細胞轉錄組數(shù)據(jù)分析實戰(zhàn)（五）：基因差異表達分析
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NBIS系列單細胞轉錄組數(shù)據(jù)分析實戰(zhàn)（六）：細胞類型注釋
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NBIS系列單細胞轉錄組數(shù)據(jù)分析實戰(zhàn)（七）：空間轉錄組分析
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NBIS系列單細胞轉錄組數(shù)據(jù)分析實戰(zhàn)（八）：擬時序細胞軌跡推斷
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