Linux軟件安裝
安裝Miniconda
Miniconda相當(dāng)于蘋果手機(jī)的apple store，可以直接安裝90%以上的軟件娶吞。
安裝步驟
- 查看服務(wù)器是多少位的 打開(kāi)Xshell，輸入uname -a雄妥，即可查看服務(wù)器位數(shù)
- 谷歌搜索miniconda 清華栏赴，根據(jù)自己服務(wù)器安裝最新版本镊辕。
- 安裝方式：（1）進(jìn)入biosoft （昨天新建的目錄），如果沒(méi)有直接新建一個(gè)菌瘪，mkdir biosoft腮敌；（2）進(jìn)入biosoft目錄，命令 cd biosoft俏扩；（3）wget 下載鏈接糜工，如 wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh；（4）完成后安裝录淡，命令 bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh捌木，根據(jù)程序顯示按 enter or yes；（5）安裝完成后激活嫉戚，激活命令 source ~/.bashrc 刨裆，然后輸入conda澈圈，激活成功后即可使用。
從Miniconda下載軟件
- 添加鏡像網(wǎng)站 復(fù)制粘貼以下代碼崔拥，回車
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes - conda search fastqc 搜索fastqc軟件
- conda install fastqc -y 安裝fastqc軟件
- conda remove fastqc -y 表示刪除fastqc軟件
