生物數(shù)據(jù)庫介紹——NCBI
NCBI（National Center for Biotechnology Information践樱，美國國家生物技術信息中心）除了維護GenBank核酸序列數(shù)據(jù)庫外将硝，還提供數(shù)據(jù)分析和檢索資源。NCBI資源包括Entrez窿给、Entrez編程組件絮供、MyNCBI硫戈、PubMed荞膘、PudMed Central罚随、PubReader、Gene羽资、the NCBI Taxonomy Browser淘菩、BLAST、Pimer-Blast屠升、COBALT潮改、RefSeq、UniGene腹暖、HomoloGene汇在、ProtEST、dbMHC微服、dbSNP趾疚、dbVar、Epigenomics以蕴、the Genetic Testing Registry糙麦、Genome和相關工具、比對查看器丛肮、跟蹤存檔赡磅、Sequence Read Archive、BioProject宝与、BioSample焚廊、ClinVar、MedGen习劫、HIV-1/人類蛋白質相互作用數(shù)據(jù)庫咆瘟、Gene Expression Omnibus、Probe诽里、Online Mendelian Inheritance in Animals袒餐、the Molecular Modeling Database、the Conserved Domain Database谤狡、the Conserved Domain Architecture Retrieval Tool灸眼、Biosystem、Protein Clusters and thePubChem suite of small molecule databases墓懂，所有這些資源可以在NCBI主頁找到焰宣。
Databases
一個提供有關基因組組裝結構，裝配名稱和其他元數(shù)據(jù)捕仔，統(tǒng)計報告以及基因組序列數(shù)據(jù)鏈接等信息的數(shù)據(jù)庫匕积。
一個有關培養(yǎng)物、動植物樣本和其他自然樣本的精選元數(shù)據(jù)集榜跌。 記錄顯示樣本狀態(tài)闸天，有關館藏的機構的信息，以及NCBI中相關數(shù)據(jù)鏈接斜做。
BioProject (formerly Genome Project)
基因組學苞氮，功能基因組學和遺傳學研究的集合以及其結果數(shù)據(jù)集的鏈接。 此資源描述項目范圍瓤逼，材料和目標笼吟，并提供一種機制來檢索由于注釋不一致，多個獨立提交以及通常存儲在不同數(shù)據(jù)庫中的各種數(shù)據(jù)類型的不同性質而經(jīng)常難以找到的數(shù)據(jù)集霸旗。
BioSample數(shù)據(jù)庫包含實驗測定中使用的生物來源材料的描述贷帮。
根據(jù)生物關系對生物醫(yī)學文獻，小分子和序列數(shù)據(jù)進行分組的數(shù)據(jù)庫诱告。
可直接搜索或從其他NCBI數(shù)據(jù)庫中的鏈接數(shù)據(jù)搜索的生物醫(yī)學書籍集合撵枢。 該系列包括生物醫(yī)學、其他科學主題書，GeneReviews等遺傳資源和NCBI幫助手冊锄禽。
儲存人類變異與觀察到的健康狀況之間關系的記錄以及支持證據(jù)的數(shù)據(jù)庫潜必。可以通過記錄上的超鏈接訪問NIH Genetic Testing Registry (GTR),MedGen,Gene,OMIM,PubMed相關信息沃但。
世界各地公開和私人支持的臨床研究的登記和結果數(shù)據(jù)庫磁滚。
Computational Resources from NCBI's Structure Group
一個由對NCBI計算生物學分會（CBB）結構組開發(fā)的資源的訪問和鏈接的集中頁面。 這些資源包括幫助研究大分子結構宵晚，保守結構域和蛋白質分類垂攘，小分子及其生物活性，以及生物途徑和系統(tǒng)的數(shù)據(jù)庫和工具淤刃。
人類和小鼠一致注釋和高質量的核心蛋白質編碼區(qū)域晒他。
Conserved Domain Database (CDD)
CDD是一種蛋白質注釋資源，由一系列經(jīng)過充分注釋的古代結構域和全長蛋白質序列比對模型組成逸贾。
Database of Genomic Structural Variation (dbVar)
dbVar數(shù)據(jù)庫儲存了大規(guī)囊敲ⅲ基因組變異相關的信息，包括大插入耕陷，缺失掂名，易位和倒位。 除了分類突變之外哟沫，dbVar還存儲已定義突變與表型信息的關聯(lián)饺蔑。
Database of Genotypes and Phenotypes (dbGaP)
儲存基因型和表型相互作用研究結果和描述的數(shù)據(jù)庫，這些研究包括全基因組關聯(lián)（GWAS）嗜诀、醫(yī)學重測序猾警、分子診斷，以及基因型與非臨床性狀之間的關聯(lián)隆敢。
Database of Short Genetic Variations (dbSNP)
數(shù)據(jù)庫包含單核苷酸突變发皿、微衛(wèi)星和小規(guī)模插入和缺失信息。
NIH基因序列數(shù)據(jù)庫拂蝎，是所有公開可用DNA序列的注釋集合穴墅。NCBI的GenBank數(shù)據(jù)庫和日本DNA數(shù)據(jù)庫（DDBJ），歐洲分子生物學實驗室（EMBL）每天交換數(shù)據(jù)温自，保證數(shù)據(jù)實時跟新玄货。 GenBank由幾個部分組成，大部分序列可以通過Nucleotide數(shù)據(jù)庫訪問悼泌。 例外的是EST和GSS分區(qū)松捉，分別通過Nucleotide? EST和Nucleotide GSS數(shù)據(jù)庫訪問。
一個可搜索的基因數(shù)據(jù)庫馆里，專注于已經(jīng)完全測序的基因組隘世，并且有一個活躍的研究團體來提供基因特異性數(shù)據(jù)可柿。基因信息包括命名法丙者、染色體定位复斥、基因產(chǎn)物及其屬性（例如，蛋白質相互作用）蔓钟、相關標記永票、表型卵贱、相互作用滥沫、引文鏈接、序列键俱、突變詳情兰绣、圖譜、表達報告编振、同源物缀辩、蛋白結構域內(nèi)容和外部數(shù)據(jù)庫鏈接。
Gene Expression Omnibus (GEO) Database
公共功能基因組數(shù)據(jù)庫踪央，支持符合MIAME標準的數(shù)據(jù)提交臀玄。接受基于芯片和測序數(shù)據(jù)，并提供工具以幫助用戶查詢和下載實驗數(shù)據(jù)并研究基因表達譜畅蹂。
Gene Expression Omnibus (GEO) Datasets
存儲從Gene Expression Omnibus（GEO）數(shù)據(jù)庫組裝的基因表達和分子豐度數(shù)據(jù)集健无。數(shù)據(jù)集每個記錄包含其他資源，包括集群工具和差異表達式查詢液斜。
Gene Expression Omnibus (GEO) Profiles
存儲從Gene Expression Omnibus（GEO）數(shù)據(jù)庫組裝的單個基因表達和分子豐度配置文件累贤。 基于基因注釋或預先計算的輪廓特征搜索感興趣的特定配置。
NCBI Bookshelf上專家撰寫的同行評審疾病描述集少漆，將基因檢測應用于具有特定遺傳病癥的患者和家屬的診斷臼膏，管理和遺傳咨詢。
選定遺傳疾病的信息摘要示损，討論潛在的突變和臨床特征渗磅，以及相關數(shù)據(jù)庫和組織的鏈接。
Genetic Testing Registry (GTR)
基因測試和實驗室記錄检访，包括測量的詳細信息夺溢，如測量和分析以及臨床有效性。 GTR也是遺傳條件信息的紐帶烛谊，并提供與各種資源的特定背景相關的鏈接风响，包括實踐指南，已發(fā)表的文獻和遺傳數(shù)據(jù)/信息丹禀。 GTR的最初范圍包括孟德爾疾病的單基因測試状勤，以及陣列鞋怀，小組和藥物遺傳學測試。
包含來自1000多種生物的全基因組的序列和比對數(shù)據(jù)持搜。 基因組代表完全測序的生物和正在進行測序的生物密似， 三個主要領域（細菌，古細菌和真核生物）葫盼，以及許多病毒残腌，噬菌體，類病毒贫导，質粒和細胞器抛猫。
Genome Reference Consortium (GRC)
基因組參考聯(lián)盟（GRC）負責人和小鼠參考基因組，成員包括華盛頓大學的基因組中心孩灯，Wellcome Trust Sanger研究所闺金，歐洲生物信息學研究所（EBI）和國家生物技術信息中心（NCBI）。 GRC致力于糾正錯誤代表的位點并完善剩余的裝配間隙峰档。 此外败匹，GRC尋求為復雜或結構變異的基因組位點提供替代組裝。 在GRC網(wǎng)站（http://www.genomereference.org）上讥巡，公眾可以查看目前正在審查的基因組區(qū)域掀亩，報告基因組相關問題并聯(lián)系GRC。
HIV-1, Human Protein Interaction Database
已知HIV-1蛋白與人宿主蛋白相互作用的數(shù)據(jù)庫欢顷。 它提供了已發(fā)表的蛋白質相互作用報告的注釋書目槽棍，并附有相應PubMed記錄和序列數(shù)據(jù)的鏈接。
描述在GenBank和RefSeq中注釋的編碼區(qū)中鑒定的蛋白質吱涉，以及SwissProt和PDB蛋白質序列的綜合記錄集合刹泄。 該資源允許研究人員獲得更有針對性的搜索結果并快速識別感興趣的蛋白質。
來自NIAID流感基因組測序項目和GenBank的數(shù)據(jù)集合怎爵，它提供了流感序列分析特石，注釋和GenBank提交工具。 該資源還包含其他流感序列資源的鏈接鳖链，以及有關流感病毒的出版物和一般信息姆蘸。
NLM目錄數(shù)據(jù)庫的子數(shù)據(jù)庫，提供NCBI數(shù)據(jù)庫記錄中引用的期刊信息芙委，包括PubMed摘要逞敷。支持期刊標題，MEDLINE或ISO縮寫灌侣，ISSN或NLM目錄ID搜索此數(shù)據(jù)庫推捐。
MeSH（醫(yī)學主題詞）是美國國家醫(yī)學圖書館用于索引MEDLINE / PubMed文章的受控詞匯表。MeSH術語提供了一種一致的方法來檢索可能對相同概念使用不同術語的信息侧啼。
醫(yī)學遺傳學信息門戶牛柒，MedGen包含來自多個來源的術語列表堪簿，并將它們組織成概念分組和層次分組。還提供了NIH Genetic Testing Registry (GTR),ClinVar,Gene,OMIM,PubMed和其它來源中的相關鏈接信息皮壁。
NCBI C++工具包綜合手冊椭更，包括其設計和開發(fā)框架，C++庫參考蛾魄，軟件示例和演示虑瀑，常見問題解答和發(fā)行說明。該手冊可在線搜索滴须，可以下載為一系列PDF文檔舌狗。
提供教程和培訓材料的鏈接，包括PowerPoint幻燈片和打印講義描馅。
作為NCBI手冊的一部分把夸，本詞匯表包含NCBI工具和首字母縮寫詞而线，生物信息學術語和數(shù)據(jù)表示格式的描述铭污。
有關NCBI數(shù)據(jù)庫和軟件的文章集合。膀篮，專為新手用戶設計嘹狞，每篇文章都提供了資源及其設計的一般概述，以及搜索和使用可用分析工具的提示誓竿。所有文章都可以在線搜索并以PDF格式下載;該手冊可以通過NCBI Bookshelf訪問磅网。
通過NCBI Bookshelf訪問，幫助手冊包含許多NCBI資源的文檔筷屡，包括PubMed涧偷，PubMed Central，Entrez系統(tǒng)毙死，Gene燎潮，SNP和LinkOut。所有章節(jié)均可以PDF格式下載扼倘。
NCBI Pathogen Detection Project
一個關于收集和分析源自食品确封，環(huán)境和患者分離物的細菌病原體基因組序列的項目。目前再菊，自動化分析集群并識別主要由公共衛(wèi)生實驗室提供的序列爪喘，以協(xié)助調查食源性疾病爆發(fā)并發(fā)現(xiàn)潛在的食物污染源。
National Library of Medicine (NLM) Catalog
圖書館館藏中所有期刊纠拔，書籍秉剑，視聽，計算機軟件稠诲，電子資源和其他資料的書目數(shù)據(jù)侦鹏。
來自多個來源的核苷酸序列的集合候址，包括GenBank，RefSeq种柑，第三方注釋（TPA）數(shù)據(jù)庫和PDB岗仑。
Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM)
人類基因和遺傳疾病的數(shù)據(jù)庫。NCBI維護當前內(nèi)容并繼續(xù)支持其與其他NCBI數(shù)據(jù)庫的搜索和集成聚请。但是荠雕，OMIM現(xiàn)在在omim.org上有一個新主頁，用戶可以直接訪問該站點進行全面顯示驶赏。
來自比較研究的相關DNA序列的數(shù)據(jù)庫：系統(tǒng)發(fā)育炸卑，種群，環(huán)境以及在較小程度上的突變煤傍。數(shù)據(jù)庫中的每個記錄都是一組DNA序列盖文。例如，群體集提供有關生物體內(nèi)遺傳變異的信息蚯姆，而系統(tǒng)發(fā)育集可以包含從幾個相關生物獲得的單個基因的序列及其比對五续。
用于各種生物醫(yī)學研究應用的核酸試劑數(shù)據(jù)庫，有關試劑比例龄恋、探針有效性和序列相似性等信息疙驾。
相關蛋白質序列（簇）的集合，由完整的原核和細胞器質粒和基因組編碼的參考序列蛋白組成郭毕。 該數(shù)據(jù)庫提供對注釋信息它碎，出版物，域显押，結構扳肛，外部鏈接和分析工具的輕松訪問。
包含來自各種來源的蛋白質序列記錄的數(shù)據(jù)庫乘碑，包括GenPept拇泛，RefSeq怀吻，Swiss-Prot筝家，PIR瑰钮，PRF和PDB。
由沉積的生物活性數(shù)據(jù)和用于篩選PubChem物質數(shù)據(jù)庫中包含的化學物質的生物活性測定的描述組成轿衔，包括篩選程序特有的條件和讀數(shù)（生物活性水平）的描述沉迹。
包含可以使用名稱，同義詞或關鍵詞搜索的害驹，經(jīng)過驗證的唯一化學結構（小分子）鞭呕。如果不同的研究者提供相同的結構，則復合記錄可以鏈接到多個PubChem物質記錄宛官。這些化合物記錄反映了用于描述PubChem物質中物質的經(jīng)過驗證的化學描述信息葫松。
PubChem物質記錄包含提交人提交給PubChem的物質信息瓦糕，這包括提交的任何化學結構信息，以及化學名稱腋么，評論和提交人網(wǎng)站的鏈接咕娄。
MEDLINE和其他生命科學期刊的生物醫(yī)學文獻引文和摘要數(shù)據(jù)庫。
全文生物醫(yī)學和生命科學期刊文獻珊擂，包括臨床醫(yī)學和公共衛(wèi)生圣勒。
人類基因特異性參考基因組序列的集合。
由NCBI產(chǎn)生的主持的摧扇，非冗余的基因組DNA圣贸，轉錄物（RNA）和蛋白質序列的集合。
專門用于支持逆轉錄病毒研究的資源數(shù)據(jù)庫
SARS冠狀病毒（CoV）的數(shù)據(jù)摘要扛稽，包括與最新序列數(shù)據(jù)和出版物的鏈接吁峻，與其他SARS相關資源的鏈接，以及來自各種分離株的基因組序列的預先計算的比對在张。
序列讀取存檔（SRA）存儲來自下一代測序平臺的測序數(shù)據(jù)用含，包括Roche 454GSSystem?，Illumina GenomeAnalyzer?瞧掺，Life Technologies ABSOLiDSystem?耕餐，HelicosBiosciencesHeliscope?凡傅，CompleteGenomics?和PacificBiosciencesSMRT?
Structure (Molecular Modeling Database)
包含源自蛋白質數(shù)據(jù)庫的大分子3D結構辟狈，以及用于可視化和比較分析的工具。
包含NCBI數(shù)據(jù)庫中具有分子數(shù)據(jù)的160,000多種生物的名稱和系統(tǒng)發(fā)育譜系夏跷。
Third Party Annotation (TPA) Database
包含從GenBank中現(xiàn)有主序列數(shù)據(jù)構建的序列的數(shù)據(jù)庫哼转。
用于各種大規(guī)模測序項目的單次讀取的DNA序列色譜圖（跡線），堿基調用和質量估計的存儲庫槽华。
廣泛的資源壹蔓，包括病毒生物學的簡述、Entrez Genome中病毒基因組序列的鏈接猫态，以及有關病毒參考序列的信息佣蓉、數(shù)千個病毒基因組的參考序列的集合。
將流感病毒資源擴展到其他生物體亲雪，提供下載所選病毒序列集的界面勇凭，分析工具，包括病毒特異性BLAST頁面和基因組注釋管道义辕。
Tools
一個交互式圖形查看器虾标，允許用戶研究由1000 Genomes Project生成的突變、基因型和支持證據(jù)（例如灌砖，比對的序列read數(shù)）璧函。
該工具允許用戶通過比較它們的結構和化學性質傀蚌，預測由突變引起的蛋白質序列變化，查看常見的取代蘸吓，以及瀏覽保守結構域中給定殘基的功能來探索氨基酸的特征善炫。
將跟蹤存檔中找到的原始序列信息與公開可用的序列存儲庫（GenBank / EMBL / DDBJ）中的裝配信息相鏈接。Assembly Viewer允許用戶查看多序列比對以及實際序列色譜圖库继。
對選定的完整真核和原核基因組中的相似序列進行BLAST搜索销部。
對RefSeqGene/LRG集中的基因組序列進行BLAST搜索。
此頁面鏈接到許多與BLAST相關的教程和指南制跟，包括BLAST算法的選擇指南舅桩，BLAST輸出格式的說明，獨立BLAST參數(shù)的說明雨膨，在本地機器上設置獨立BLAST的說明以及使用BLAST URL API擂涛。
Basic Local Alignment Search Tool (BLAST)
找到生物序列之間的局部相似性區(qū)域，該程序將核苷酸或蛋白質序列與序列數(shù)據(jù)庫進行比較聊记，并計算匹配的統(tǒng)計顯著性撒妈。 BLAST可用于推斷序列之間的功能和進化關系，以及幫助鑒定基因家族的成員排监。
允許你提交Nucleotide狰右、Protein或其他Entrez數(shù)據(jù)庫中的GI、登錄號或其他唯一標識符的文件舆床，從許多Entrez數(shù)據(jù)庫中檢索記錄棋蚌。
一個用于分類蛋白質序列和調查其進化關系的應用程序。CDTree可以導入挨队，分析和更新現(xiàn)有的保守域（CDD）記錄和層次結構谷暮，還允許用戶創(chuàng)建自己的記錄和層次結構。CDTree與Entrez CDD和Cn3D緊密集成盛垦，允許用戶創(chuàng)建和更新蛋白質域對齊湿弦。
COBALT是一種蛋白質多序列比對工具，使用RPS-BLAST腾夯，BLASTP和PHI-BLAST找到從保守結構域數(shù)據(jù)庫颊埃，蛋白質基序數(shù)據(jù)庫和序列相似性衍生的成對約束的集合。
用于從NCBI的Entrez檢索服務查看三維結構的獨立應用程序蝶俱。
作為NCBI Bookshelf的一部分班利，Coffee Break結合了近期生物醫(yī)學發(fā)現(xiàn)的報告和NCBI工具的使用。每份報告都包含互動教程跷乐，展示NCBI生物信息學工具如何用作研究過程的一部分肥败。
Conserved Domain Architecture Retrieval Tool (CDART)
顯示構成給定蛋白質序列的功能域。它列出了具有相似結構域結構的蛋白質，并且可以檢索含有特定結構域組合的蛋白質馒稍。
Conserved Domain Search Service (CD Search)
鑒定蛋白質序列中存在的保守結構域皿哨。
在常規(guī)Web查詢界面之外提供對NCBI Entrez系統(tǒng)內(nèi)數(shù)據(jù)訪問的工具。
允許用戶使用在線表單構建E-utility分析流程纽谒，然后生成Perl腳本以執(zhí)行分析流程的工具证膨。
Gene Expression Omnibus (GEO) BLAST
用于將查詢序列（核苷酸或蛋白質）與包含在GEO數(shù)據(jù)庫中的微陣列或SAGE平臺上的GenBank序列對齊的工具。
在表和分類樹中顯示分類法數(shù)據(jù)庫中生物的遺傳密碼鼓黔。
該工具將核苷酸或蛋白質序列與基因組序列數(shù)據(jù)庫進行比較央勒，并使用基本局部比對搜索工具（BLAST）算法計算匹配的統(tǒng)計顯著性。
Genome Data Viewer (GDV)? ? ? ? ?
用于真核RefSeq基因組裝配的交互式導航的基因組瀏覽器澳化，其具有對基因崔步，表達，變異和其他注釋的全面檢查缎谷。（RefSeq數(shù)據(jù)庫井濒，即RefSeq參考序列數(shù)據(jù)庫，美國國家生物信息技術中心（NCBI）提供的具有生物意義上的非冗余non-redundent的基因和蛋白質序列列林。）
Genome Decoration Page? ? ? ? ?
一種可幫助生成關于基因組組裝注釋和序列名稱的期刊質量數(shù)字工具瑞你。
Genome Remapping Service? ? ? ? ?
NCBI的重映射工具允許用戶映射注釋數(shù)據(jù)并將特征的位置從一個基因組版本轉換為另一個，或通過堿基分析將RefSeqGene序列轉換為RefSeqGene序列希痴。
用于查看和分析序列數(shù)據(jù)的集成應用程序者甲。
一種允許第三方直接從PubMed和其他Entrez數(shù)據(jù)庫記錄鏈接到Entrez系統(tǒng)之外的相關Web可訪問資源服務。
Map Viewer（被genome data viewer取代了）
為生物的子集提供比對和組裝序列的特殊瀏覽功能砌创。
Multiple Sequence Alignment Viewer
一種交互式Web應用程序虏缸，使用戶能夠可視化由數(shù)據(jù)庫搜索結果或其他軟件應用程序創(chuàng)建的多個對齊。
提供有關新的和更新的資源以及NCBI研究和開發(fā)項目的信息纺铭。
NCBI用于生成分子生物學便攜式模塊化軟件的一套軟件和數(shù)據(jù)交換規(guī)范寇钉。
一個公共領域質量保證軟件包，有助于根據(jù)實驗室特定的協(xié)議評估多重短串聯(lián)重復（STR）DNA譜舶赔。
Open Reading Frame Finder (ORF Finder)
一種圖形分析工具，用于查找用戶序列中或已存在于數(shù)據(jù)庫中的序列中的所有開放閱讀框谦秧。
允許用戶從CDD記錄或位置特異性迭代（PSI）-BLAST蛋白質搜索中顯示竟纳，排序，子集和下載位置特異性評分矩陣（PSSM）疚鲤。
Phenotype-Genotype Integrator (PheGenI)
支持通過表型锥累，染色體位置，基因和SNP標識符查詢?nèi)祟惐硇?基因型關系集歇。
Primer-BLAST工具使用Primer3設計序列模板的PCR引物桶略。然后通過針對用戶指定數(shù)據(jù)庫的BLAST搜索自動分析潛在產(chǎn)品，以檢查對目標的特異性。
用于計算蛋白質與基因組核苷酸序列的比對的實用程序际歼。
PubChem Power User Gateway (PUG)? ? ? ? ?
PUG通過編程接口提供對PubChem服務的訪問惶翻。
PubChem Standardization Service
PubChem術語中的標準化是以與貢獻者原始結構創(chuàng)建PubChem化合物記錄相同的方式處理化學結構。
PubChem Structure Search? ? ? ? ?
PubChem結構搜索允許通過化學結構或化學結構模式查詢PubChem化合物數(shù)據(jù)庫鹅心。
專門的PubMed搜索表吕粗，面向臨床醫(yī)生和醫(yī)療服務研究人員。該頁面簡化了臨床研究類別的搜索旭愧，查找系統(tǒng)評價和搜索醫(yī)學遺傳學文獻颅筋。
PubMed搜索和鏈接的一系列Web和Flash教程，使用MeSH和其他PubMed服務在MyNCBI中保存搜索输枯。
相關結構工具允許用戶從分子建模數(shù)據(jù)庫（MMDB）中查找與查詢蛋白質序列相似的3D結構议泵。
SNP Database Specialized Search Tools
有多種工具可用于搜索SNP數(shù)據(jù)庫，允許使用BLAST通過基因型桃熄，方法肢簿，群體，提交者蜻拨，標記和序列相似性進行搜索池充。
Sequence Cytogenetic Conversion Service
一種在線工具，可轉換人類缎讼，大鼠收夸，小鼠和果蠅基因組裝配的序列和細胞遺傳學坐標。
提供核苷酸或蛋白質序列的可配置圖形顯示以及已在該序列上注釋的特征血崭。
用于計算cDNA到基因組序列比對的實用程序卧惜。
支持使用部分分類名稱，通用名稱夹纫，通配符和語音相似的名稱搜索分類樹咽瓷。
為選定的一組生物生成分類樹。用戶可以上傳分類標識或名稱的文件舰讹，也可以直接輸入名稱或ID茅姜。
顯示給定排名和包含日期的數(shù)據(jù)庫中的分類節(jié)點數(shù)。
顯示一組分類節(jié)點或ID的當前狀態(tài)月匣。
用于創(chuàng)建和顯示系統(tǒng)發(fā)育樹數(shù)據(jù)的工具钻洒。Tree Viewer可以分析您自己的序列數(shù)據(jù)，將可打印的矢量圖像生成為PDF锄开，并且可以嵌入到網(wǎng)頁中素标。
用于搜索和查看dbSNP，dbVar和ClinVar數(shù)據(jù)庫中列出的基因組變異的基因組瀏覽器萍悴。
一種用于快速鑒定可能是載體來源的核酸序列區(qū)段的系統(tǒng)头遭。
Vector Alignment Search Tool (VAST)
一種識別相似蛋白質三維結構的計算機算法寓免。
該工具有助于識別病毒序列的基因型。
