Kuang 1999 標(biāo)記分離 distortion

  1. Kuang H, Richardson T, Carson S, Wilcox P, Bongarten B. Genetic analysis of inbreeding depression in plus tree 850.55 of Pinus radiata D. Don. I. Genetic map with distorted markers. Theor. Appl. Genet. 1999;98:697–703.

使用S-1種子的大配子體構(gòu)建了輻射松+樹850.55的遺傳圖譜。該圖包含19個(gè)連鎖群扛禽,有168個(gè)RAPD和4個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記∩枰祝總圖譜長(zhǎng)度為1116.7cM(Kosambi函數(shù)),估計(jì)覆蓋56%的基因組茧彤。在172個(gè)標(biāo)記中狮鸭,59個(gè)(34%)從兆配子體中預(yù)期的1:1比率扭曲(P <0.05)饰剥。我們顯示忠荞,如果失真是由單個(gè)生存力基因或抽樣誤差引起的蒋歌,自交種子的megagametophytes重組頻率的估計(jì)不會(huì)受到影響


介紹
輻射松(Pinus radiata D.Don)是世界上更經(jīng)濟(jì)上重要的林木樹種之一委煤,特別是在南半球堂油,育種項(xiàng)目已經(jīng)持續(xù)了近50年(Balocchi 1997)。這些計(jì)劃提供了用于建立商業(yè)種植園的大量種子碧绞,通常是通過種植高價(jià)值的樹種府框。輻射松與大多數(shù)其他針葉樹一樣,在自交上顯示出近親繁殖抑制讥邻,表現(xiàn)為生長(zhǎng)速率和種子集減少(Williams和Savolainen 1996綜述)迫靖。在幾個(gè)樹種中,在后代中發(fā)現(xiàn)了遺傳標(biāo)記的分離畸變(Fowler 1964计维,1965; Cheliak 1987; Hedrick和Muona 1990)袜香。植物中分離畸變的原因尚不清楚,但被認(rèn)為與染色體丟失等因素有關(guān)(Kasha和Kao鲫惶,1970),遺傳分離機(jī)制(Zamir和Tadmor 1986)或存活基因(Hedrick和Muona 1990; Beavis和Grant 1991; Lin等人1992; Liedl和Anderson 1993; Bradshaw和Stettler 1994; Cheng等人1996; Xu等人1997)实抡。關(guān)于生存力基因欠母,選擇可以是配子水平(Lin等人1992; Liedl和Anderson 1993; Yanagihara等人1995; Cheng等人1996; Xu等人1997)或合子水平(Hedrick和Muona 1990; Bradshaw和Stettler 1994)。非生物因素如評(píng)分誤差(Deve xy et al吆寨。 1994; Plomion et al赏淌。 1995)或抽樣誤差(Plomion等人1995; Echt和Nelson 1996)也可能導(dǎo)致偏析失真。 DNA標(biāo)記系統(tǒng)的可用性促進(jìn)了中等密度連鎖圖的發(fā)展啄清,因此增強(qiáng)了檢測(cè)分離失真的能力六水。已經(jīng)有許多關(guān)于植物中包括林木的連鎖實(shí)驗(yàn)的分離失真的報(bào)道(例如Helentjaris等人1986; McCouch等人1988; Nelson等人1993; Pillen等人1993; Bradshaw和Stettler 1994 ; Cheng等人1996; Xu等人1997)。在針葉樹中辣卒,針葉樹種子的單倍體大配子體的使用提供了構(gòu)建單個(gè)樹的遺傳圖譜的有效方法(Tulsieram等人1992; Nelson等人1993,1994; Binelli和Bucci 1994; Plomion等人1995 ; Echt和Nelson 1997)掷贾,并用于檢測(cè)母體的分離畸變。該映射策略類似于具有未知連鎖相的回交的策略(Nelson等人荣茫,1993)想帅。然而,尚未確定由于活力基因和使用大配子體的連鎖分析的抽樣誤差而導(dǎo)致的畸變的選擇啡莉。在回交群體中港准,兩個(gè)標(biāo)記之間的重組頻率的經(jīng)典估計(jì)等于重組體的比例旨剥,到最大似然估計(jì)(MLE)。如果單個(gè)存活力基因(合子選擇)與兩個(gè)標(biāo)記物連鎖浅缸,重組頻率的估計(jì)與當(dāng)沒有活力干擾時(shí)相同(Bailey 1961)轨帜。這個(gè)結(jié)果還沒有擴(kuò)展到使用針葉樹粉虱。在本文中衩椒,我們證明阵谚,在標(biāo)準(zhǔn)假設(shè)下,當(dāng)基因型數(shù)據(jù)從巨型母細(xì)胞獲得時(shí)烟具,即使存在分離失真梢什,常規(guī)重組的最大似然估計(jì)也是無(wú)偏的。此外朝聋,我們描述了一個(gè)高價(jià)值輻射松樹嗡午,850.055,從人工自花授粉產(chǎn)生的種子的巨型母細(xì)胞基因型構(gòu)建的連鎖圖冀痕。這里荔睹,經(jīng)常發(fā)現(xiàn)與預(yù)期的孟德爾比的偏差。

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