Kuang 1999標(biāo)記 檢測近交衰退基因

  1. Kuang H, Richardson TE, Carson SD, Bongarten BC. Genetic analysis of inbreeding depression in plus tree 850.55 of Pinus radiata D. Don. II. Genetics of viability genes. Theor. Appl. Genet. 1999;99:140–6.

大多數(shù)針葉類物種表現(xiàn)出嚴(yán)重的近交衰退。自交個(gè)體通常具有降低的存活力缩多,減少的活力和形態(tài)學(xué)缺陷咧欣。 輻射松優(yōu)株850.55自交后filled種子的數(shù)量是其異交數(shù)量的48%铅歼,自交幼苗的26.1%在早期死亡蛔翅。研究了172個(gè)標(biāo)記(覆蓋56%的基因組)在輻射松優(yōu)樹850.55的自交后代中的分離乘盖∧派模基于標(biāo)記的分離比娃豹,鑒定與近交繁殖對(duì)生存力相關(guān)的基因(P(0.05)焚虱。使用期望/條件最大化(ECM)算法,我們估計(jì)生活力基因的位置懂版,優(yōu)勢程度和選擇系數(shù)鹃栽。發(fā)現(xiàn)了9個(gè)估計(jì)生活力基因,其中7個(gè)是顯性的躯畴,一個(gè)是部分顯性的(優(yōu)勢度為“0.4”)民鼓,另一個(gè)基因是超顯性的或偽上超顯性的,其中兩個(gè)純合子的選擇系數(shù)分別為0.4和0.42蓬抄。在顯示優(yōu)勢或部分優(yōu)勢的基因中丰嘉,7個(gè)是亞致死的,選擇范圍從0.55到0.79;一個(gè)基因(SDPr)嚷缭,負(fù)責(zé)幼苗死亡在發(fā)芽后的第一個(gè)月內(nèi)饮亏,是致命的。


介紹
大多數(shù)針葉樹種,如其他異交種克滴,表現(xiàn)出近交衰退(Williams和Savolainen 1996綜述)。近交衰退可以以許多方式表現(xiàn)优床。在種子中劝赔,樹種可能具有減少的種子產(chǎn)量,種子可以具有較低的發(fā)芽率胆敞,并且幼苗可以具有較高的異常百分比着帽,較低的存活率和減少的生長。filled種子的產(chǎn)量降低是其中的最一致和嚴(yán)重的結(jié)果之一(Bingham和Squillace 1955; Snyder 1968; Sorensen 1971; Sorensen和Miles 1974; Fowler和Park 1983; Gri $ n和Lindgren 1985)移层。通常認(rèn)為純合的致死或亞致死等位基因負(fù)責(zé)在自交(Orr-Ewing 1957; Sarvas 1962; Hagman和Mikkola 1963; Mergen等人1965)時(shí)產(chǎn)生空種子仍翰,但直接證據(jù)是罕見的(Fowler 1964,1965; Hedrick和Muona 1990)观话。根據(jù)近親近交衰退對(duì)生存力(種子生產(chǎn)予借,在大多數(shù)情況下)的程度,已經(jīng)估計(jì)許多針葉樹種的致死當(dāng)量數(shù)(Williams和Savolainen 1996)频蛔。然而許多涉及的基因是未知的灵迫。致死當(dāng)量的數(shù)目是僅當(dāng)隱性純合子完全致死時(shí)所涉及的基因數(shù)目的近似估計(jì)。另一方面晦溪,許多更多的基因可能正在操作瀑粥。通過分子標(biāo)記,可以鑒定完全致死和亞致死等位基因三圆,并且可以研究它們的遺傳性質(zhì)狞换。在自然選擇后,家系中有害的基因型應(yīng)該以比Men- delian比例預(yù)期的更低的頻率存在舟肉。緊密連鎖的分子標(biāo)記物也應(yīng)該顯示失真的孟德爾比修噪。標(biāo)記的分離失調(diào)提供了關(guān)于連鎖的有害等位基因的位置和遺傳效應(yīng)的信息。 Hedrick和Muona(1990)使用最大可能方法對(duì)自交系中一個(gè)同工酶標(biāo)記(#umorescent esterasase)的分離數(shù)據(jù)鑒定蘇格蘭松中的有害等位基因路媚。最近開發(fā)了更復(fù)雜的利用兩個(gè)共同顯性標(biāo)記的分離數(shù)據(jù)的方法割按。 Cheng et al。 (1996)使用期望/條件最大化(ECM)方法來研究水稻的生存力基因磷籍。輻射松(Pinus radiata)已成為其中之一
最經(jīng)濟(jì)上重要的樹種在世界上适荣。 Plus樹850.55已被證明是所有輻射松選擇中生長速率最好的。不幸的是院领,輻射松像大多數(shù)針葉樹一樣弛矛,表現(xiàn)出顯著的近親近交衰退(Wilcox 1983; Gri $ n和Lindgren 1985),預(yù)計(jì)這將表現(xiàn)為輪回選擇繼續(xù)比然。每個(gè)錐體的種子數(shù)在sel“ng plus tree 850.55之后是異交的48%; S中的種子數(shù)量是S的48%(Gri $ n和Lindgren 1985)丈氓。在這里提出的研究中,基于隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA(RAPD)和微衛(wèi)星標(biāo)記的分離數(shù)據(jù),研究了輻射蟲基因組+樹850.55基因組中的有害等位基因万俗,支配性程度和相應(yīng)的活力基因的選擇系數(shù)湾笛。

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