植物基因組測(cè)序二十年:成就與挑戰(zhàn)

在過(guò)去的20年里检疫，已經(jīng)公布了1000多個(gè)植物基因組的序列厘熟，代表了788個(gè)不同的物種嘲恍，具有高度的多樣性息堂。采用新型支架策略的長(zhǎng)讀測(cè)序進(jìn)一步徹底改變了基因組測(cè)序嚷狞，使得隨著基因組復(fù)雜性和大小的增加，可以獲得更多的植物物種染色體規(guī)模的裝配荣堰。第一批擬南芥和水稻基因組論文的引文樹顯示了植物基因組學(xué)的重大發(fā)展和植物基因組使植物生物學(xué)所有學(xué)科在過(guò)去20年的復(fù)興床未。構(gòu)建接近完整的基因組、組裝復(fù)雜基因組和構(gòu)建參考泛基因組是未來(lái)植物基因組測(cè)序中最具挑戰(zhàn)性的部分振坚。2000年12月薇搁，第一個(gè)植物參考基因組——擬南芥全基因組序列的公布，標(biāo)志著植物基因組時(shí)代的開始渡八。在過(guò)去的20年里啃洋，已有數(shù)百種植物產(chǎn)生了參考基因組，包括非維管植物和開花植物屎鳍。釋放這些植物基因組極大地促進(jìn)了植物生物學(xué)各學(xué)科的研究宏娄。重要的是，主要作物及其祖先已經(jīng)產(chǎn)生了多個(gè)參考水平的基因組逮壁，從而創(chuàng)造了泛基因組孵坚，并探索了現(xiàn)代作物育種可以采用的馴化歷史和自然變異。本文綜述了植物基因組測(cè)序的進(jìn)展窥淆，以及對(duì)更復(fù)雜的植物基因組進(jìn)行測(cè)序和生成泛基因組所面臨的挑戰(zhàn)卖宠。
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