作物種質(zhì)的多樣性調(diào)查對(duì)于深入了解植物結(jié)構(gòu)和谷物產(chǎn)量提高的基因組基礎(chǔ)非常重要昭娩，這在小麥中仍然知之甚少。在這里植康，我們對(duì)過(guò)去 100 年收集的 287...

多倍體必須正確地分離同源染色體冶忱。我們認(rèn)為，這一過(guò)程不僅是由序列相似性決定的，而且還受到強(qiáng)大的遺傳控制莉恼，這可能在不同的世系之間有所不同。我們還強(qiáng)調(diào)...

長(zhǎng)讀從頭基因組組裝繼續(xù)快速發(fā)展速那。然而俐银，缺乏有效的工具來(lái)準(zhǔn)確評(píng)估裝配結(jié)果，特別是結(jié)構(gòu)誤差端仰。我們提出Inspector捶惜，一個(gè)無(wú)參考的長(zhǎng)讀從頭組裝評(píng)估...

在過(guò)去的20年里，已經(jīng)公布了1000多個(gè)植物基因組的序列荔烧，代表了788個(gè)不同的物種吱七，具有高度的多樣性。采用新型支架策略的長(zhǎng)讀測(cè)序進(jìn)一步徹底改變了...

轉(zhuǎn)座子 (TE) 擴(kuò)增已被認(rèn)為是介導(dǎo)基因組大小擴(kuò)展和進(jìn)化的驅(qū)動(dòng)力鹤竭，但在植物中塑造 3D 基因組結(jié)構(gòu)的后果在很大程度上仍然未知踊餐。在這里，我們使用牛...

對(duì)衍生生境的適應(yīng)往往是由長(zhǎng)期遺傳變異(SGV)引起的臀稚。遺傳變異在祖先群體中的維持通常歸因于凈化選擇和跨生境雜交產(chǎn)生的基因流之間的長(zhǎng)期拮抗吝岭。基于多...

經(jīng)常會(huì)遇到對(duì)文件的排序，這里記錄一下如何先按照染色體號(hào)排序窜管，然后按照坐標(biāo)位置排序 這里散劫，先按照第一列進(jìn)行排序，然后第二列按照數(shù)字大小從小到大排序...

出現(xiàn)這個(gè)問(wèn)題是硬盤只能讀幕帆，不能寫(xiě)了获搏。解決思路是，先把硬盤unmount蜓肆，再mount上颜凯。不是簡(jiǎn)簡(jiǎn)單單的unmount再mount就可以的。在un...

這篇文獻(xiàn)可能不是很好理解仗扬，現(xiàn)在還沒(méi)有讀完症概。文獻(xiàn)已經(jīng)存在noteexpress上。 在這篇文章中發(fā)現(xiàn)了兩個(gè)比較好使的工具早芭，記錄一下彼城。 1. [AG...