整體思路
與前面的測(cè)序文章相同桂塞，忘記了可以向前翻凹蜂「笪＃可以說(shuō)唯一的區(qū)別就是在于變異有很大不同玛痊。只要將癌細(xì)胞的變異理解，模仿擂煞，在簡(jiǎn)單修改之前的代碼基本就算可以了。
癌細(xì)胞的變異
普通細(xì)胞有原癌基因和抑癌基因菱父，在抑癌基因被破壞時(shí)，就產(chǎn)生了癌細(xì)胞浙宜，但正常的SNP和Indel是很難破壞基因的，除非是大量的SNP蛹磺、Indel或者另外一種變異fusion。
介紹下fusion
fusion中文翻譯為基因融合萤捆，然后fusion分為兩種人工的和自然的。癌癥的導(dǎo)致當(dāng)然是由于自然的fusion俗或。自然fusion有主要指染色體變異市怎。
染色體易位
易位是指一條染色體的某一片段移接到另一條非同源染色體上辛慰，從而引起變異的現(xiàn)象区匠。如果兩條非同源染色體之間相互交換片段，叫做相互易位驰弄，這種易位比較常見(jiàn)。
染色體倒位
指某染色體的內(nèi)部區(qū)段發(fā)生180°的倒轉(zhuǎn)速客，而使該區(qū)段的原來(lái)基因順序發(fā)生顛倒的現(xiàn)象。
染色體缺失
缺失是指染色體上某一區(qū)段及其帶有的基因一起丟失溺职，從而引起變異的現(xiàn)象岔擂。
染色體重復(fù)
染色體上增加了相同的某個(gè)區(qū)段而引起變異的現(xiàn)象，叫做重復(fù)乱灵。
與SNP和Indel的不同
SNP和Indel都是堿基對(duì)的變異塑崖，算是量變阔蛉，而fusion則是質(zhì)的變化弃舒。SNP與Indel的變異十分普遍但是危害小，fusion發(fā)生概率小但是危害大聋呢。
測(cè)序流程
參考之前的模擬Illumina測(cè)序的思路就行。
