一尉辑、bzip和Miniconda的下載和安裝
- bzip的下載和安裝
bzip2
- 騰訊云已經(jīng)裝備有bzip锯茄，無需安裝;
- 如果需要安裝的話，需要以下命令行
yum install -y bzip2 /////y參數(shù)表示是否自動(dòng)安裝
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Miniconda的下載和安裝
Miniconda是conda的精簡版本呀洲，繼承了大部分的的生信軟件。
- 確認(rèn)服務(wù)器版本分尸，在官網(wǎng)找到對應(yīng)的版本，鼠標(biāo)右鍵復(fù)制地址歹嘹，為在linux下安裝做準(zhǔn)備。
- wget是linux的下載命令孔庭，相當(dāng)于windows的另存為尺上，后面接空格和安裝地址就可以材蛛，用鼠標(biāo)右鍵點(diǎn)一下，出來剛才復(fù)制的地址怎抛，如下所示
wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
- 下載完需要安裝卑吭，網(wǎng)絡(luò)查了bash的釋義，難以消化马绝，此處bash就是安裝上述下載文件到本地豆赏。
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
- 回車到license接受yes，安裝目錄回車富稻，添加環(huán)境變量yes掷邦，安裝成功。
- 大坑椭赋，激活的命令的第一個(gè)字符一定要打?qū)ΩЦ冢駝t死的很慘。
source ~/.bashrc
conda
- 關(guān)于添加路徑or通道哪怔，因?yàn)闆]加在后續(xù)查找軟件時(shí)顯示失敗宣蔚，除了按照教程上添加通道外，還有如下簡潔命令认境，不知區(qū)別在哪
conda config --add channels bioconda
二胚委、Miniconda的使用
- 查看當(dāng)前軟件列表
conda list
- 搜索特定軟件
conda search software_name
- 安裝特定軟件
conda install -y software_name
- 卸載特定軟件
conda remove software_name -y
