FastQC下載及安裝
FastQC是一個java軟件，下載后可以直接使用撵渡，免安裝編譯融柬，但需要先配置java環(huán)境。
一趋距、Java環(huán)境配置
首先粒氧，確定java是否已經(jīng)配置好。
java -version
not found节腐，但虛擬機提示可輸入以下命令進行下載外盯。
sudo apt install default-jre
sudo apt install openjdk-11-jre-headless
sudo apt install openjdk-8-jre-headless
sudo apt install openjdk-9-jre-headless
再次java -version，java配置成功翼雀。
二饱苟、FastQC的下載安裝
網(wǎng)頁下載或本地上傳（直接利用遠程控制軟件將fastqc壓縮包傳到虛擬機上）。
1狼渊、建立fastqc文件夾
mkdir ~/Biosofts/fastqc
2箱熬、解壓
unzip ~/Biosofts/fastqc_v0.11.7.zip -d ~/Biosofts/
3、通過路徑查看
~/Biosofts/FastQC/fastqc -h
!!! 發(fā)現(xiàn)沒有執(zhí)行權(quán)限狈邑！
為了獲得執(zhí)行權(quán)限城须，借助chmod指令修改文件權(quán)限，如下米苹。
chmod 777 /home/gxx/Biosofts/FastQC/fastqc
其中糕伐，777是111，111蘸嘶，111良瞧，即獲得可讀可寫可執(zhí)行權(quán)限。
4训唱、加入環(huán)境變量
環(huán)境變量加入后褥蚯，就不用再輸入路徑了。
echo 'export PATH=~/Biosofts/FastQC:$PATH' >>~/.bashrc
source ~/.bashrc
5况增、查看
fastqc -h
結(jié)果如下（局部）：
