MethyCancer : 癌癥相關(guān)的甲基化基因數(shù)據(jù)庫

癌癥作為人類健康的頭號殺手俯邓,引起了科研工作者的官方關(guān)注甩恼。鑒于DNA甲基化修飾在腫瘤中的重要作用贡羔, MethyCancer數(shù)據(jù)庫整合了DNA甲基化數(shù)據(jù)和基因表達譜數(shù)據(jù)云稚,將癌癥與相關(guān)的基因聯(lián)系起來尸饺,

網(wǎng)址如下

http://methycancer.psych.ac.cn/

在數(shù)據(jù)庫的首頁进统,有人類染色體的標示圖助币,可以快速的查看每條染色體上相關(guān)的數(shù)據(jù)概況。

MethyCancer中的甲基化數(shù)據(jù)共有5個來源:

  1. HEP

  2. MethDB

  3. UHN

  4. Columbia University

  5. BIG

對于這5個不同來源的數(shù)據(jù)螟碎,劃分成了7種不同的類型

  1. Methylation region

  2. Methylation content

  3. Methylation pattern

  4. Methylation profile

  5. CpG Island I

  6. CpG Island II

  7. CpG Island III

具體的定義可以查看官網(wǎng)的詳細說明眉菱。通過這個數(shù)據(jù)庫,我們可以方便的檢索到癌癥相關(guān)的基因掉分。

設(shè)置好檢索條件之后俭缓,點擊search 按鈕,就可以看到如下結(jié)果:

點擊對應(yīng)的Cancer Name, 可以看到所有和該癌癥相關(guān)的基因酥郭,比如Overview of breast tumors相關(guān)的基因华坦,這些基因就可以作為該癌癥研究對應(yīng)的panel

在該數(shù)據(jù)庫中不从,還提供了一個CpG島的預(yù)測工具

輸入一段fasta序列惜姐,然后定義好其他的幾個閾值,提交就可以了椿息。

最重要的一點歹袁,這個數(shù)據(jù)庫是可以免費下載。

?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請聯(lián)系作者
  • 序言:七十年代末寝优,一起剝皮案震驚了整個濱河市条舔,隨后出現(xiàn)的幾起案子,更是在濱河造成了極大的恐慌乏矾,老刑警劉巖逞刷,帶你破解...
    沈念sama閱讀 221,635評論 6 515
  • 序言:濱河連續(xù)發(fā)生了三起死亡事件,死亡現(xiàn)場離奇詭異妻熊,居然都是意外死亡夸浅,警方通過查閱死者的電腦和手機,發(fā)現(xiàn)死者居然都...
    沈念sama閱讀 94,543評論 3 399
  • 文/潘曉璐 我一進店門扔役,熙熙樓的掌柜王于貴愁眉苦臉地迎上來帆喇,“玉大人,你說我怎么就攤上這事亿胸∨髑眨” “怎么了?”我有些...
    開封第一講書人閱讀 168,083評論 0 360
  • 文/不壞的土叔 我叫張陵,是天一觀的道長嚎货。 經(jīng)常有香客問我匀钧,道長,這世上最難降的妖魔是什么突颊? 我笑而不...
    開封第一講書人閱讀 59,640評論 1 296
  • 正文 為了忘掉前任,我火速辦了婚禮,結(jié)果婚禮上律秃,老公的妹妹穿的比我還像新娘爬橡。我一直安慰自己,他們只是感情好棒动,可當我...
    茶點故事閱讀 68,640評論 6 397
  • 文/花漫 我一把揭開白布糙申。 她就那樣靜靜地躺著,像睡著了一般船惨。 火紅的嫁衣襯著肌膚如雪柜裸。 梳的紋絲不亂的頭發(fā)上,一...
    開封第一講書人閱讀 52,262評論 1 308
  • 那天粱锐,我揣著相機與錄音疙挺,去河邊找鬼。 笑死卜范,一個胖子當著我的面吹牛衔统,可吹牛的內(nèi)容都是我干的。 我是一名探鬼主播海雪,決...
    沈念sama閱讀 40,833評論 3 421
  • 文/蒼蘭香墨 我猛地睜開眼锦爵,長吁一口氣:“原來是場噩夢啊……” “哼!你這毒婦竟也來了奥裸?” 一聲冷哼從身側(cè)響起险掀,我...
    開封第一講書人閱讀 39,736評論 0 276
  • 序言:老撾萬榮一對情侶失蹤,失蹤者是張志新(化名)和其女友劉穎湾宙,沒想到半個月后樟氢,有當?shù)厝嗽跇淞掷锇l(fā)現(xiàn)了一具尸體,經(jīng)...
    沈念sama閱讀 46,280評論 1 319
  • 正文 獨居荒郊野嶺守林人離奇死亡侠鳄,尸身上長有42處帶血的膿包…… 初始之章·張勛 以下內(nèi)容為張勛視角 年9月15日...
    茶點故事閱讀 38,369評論 3 340
  • 正文 我和宋清朗相戀三年埠啃,在試婚紗的時候發(fā)現(xiàn)自己被綠了。 大學時的朋友給我發(fā)了我未婚夫和他白月光在一起吃飯的照片伟恶。...
    茶點故事閱讀 40,503評論 1 352
  • 序言:一個原本活蹦亂跳的男人離奇死亡碴开,死狀恐怖,靈堂內(nèi)的尸體忽然破棺而出博秫,到底是詐尸還是另有隱情潦牛,我是刑警寧澤,帶...
    沈念sama閱讀 36,185評論 5 350
  • 正文 年R本政府宣布挡育,位于F島的核電站巴碗,受9級特大地震影響,放射性物質(zhì)發(fā)生泄漏即寒。R本人自食惡果不足惜橡淆,卻給世界環(huán)境...
    茶點故事閱讀 41,870評論 3 333
  • 文/蒙蒙 一召噩、第九天 我趴在偏房一處隱蔽的房頂上張望。 院中可真熱鬧明垢,春花似錦蚣常、人聲如沸市咽。這莊子的主人今日做“春日...
    開封第一講書人閱讀 32,340評論 0 24
  • 文/蒼蘭香墨 我抬頭看了看天上的太陽施绎。三九已至溯革,卻和暖如春,著一層夾襖步出監(jiān)牢的瞬間谷醉,已是汗流浹背致稀。 一陣腳步聲響...
    開封第一講書人閱讀 33,460評論 1 272
  • 我被黑心中介騙來泰國打工, 沒想到剛下飛機就差點兒被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留俱尼,地道東北人抖单。 一個月前我還...
    沈念sama閱讀 48,909評論 3 376
  • 正文 我出身青樓,卻偏偏與公主長得像遇八,于是被迫代替她去往敵國和親矛绘。 傳聞我的和親對象是個殘疾皇子,可洞房花燭夜當晚...
    茶點故事閱讀 45,512評論 2 359

推薦閱讀更多精彩內(nèi)容