蛋白質(zhì)質(zhì)子化

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ProteinPrepare模塊

PlayMolecule ProteinPrepare: A Web Application for Protein Preparation for Molecular Dynamics Simulations

?Amino Acid Residue Additions (see dat/PATCHES.xml)

???? ASH??????? :?? Neutral ASP

???? CYX??????? :?? SS-bonded CYS

???? CYM??????? :?? Negative CYS

???? GLH??????? :?? Neutral GLU

???? HIP??????? :?? Positive HIS

???? HID??????? :?? Neutral HIS, proton HD1 present

???? HIE??????? :?? Neutral HIS, proton HE2 present

???? LYN??????? :?? Neutral LYS

???? TYM??????? :?? Negative TYR

Start terminus GLU-1: NH3+

End terminus SER-215: COO-

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