160:data cut off

今天感覺(jué)很孤獨(dú),想找個(gè)人聊天走芋,尤其是播放器播放著刀郎的“西海情歌”。

今天介紹一個(gè)概念絮识,什么是cut off绿聘,以及常用的cut off做法嗽上。

Data Cut Off最常見(jiàn)于腫瘤試驗(yàn)次舌,我們知道腫瘤試驗(yàn)耗時(shí)耗錢(qián)耗力,一項(xiàng)腫瘤試驗(yàn)可能要花費(fèi)好幾年的時(shí)間才能完成兽愤,這時(shí)候如果我想知道我的這個(gè)藥安全性和有效性怎么樣呢彼念?那么就得利用已經(jīng)錄入的數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。

cut?off?一般是達(dá)到一定數(shù)量的事件發(fā)生或者某個(gè)提前定義的里程碑達(dá)到了(比如某個(gè)組別入組人數(shù)達(dá)到要求)浅萧,cut off常用于期中分析(interim analysis),對(duì)于最終的審判結(jié)果有著舉足輕重的影響逐沙。

期中分析的結(jié)果一般不交給監(jiān)管機(jī)構(gòu),交給一個(gè)叫做SMC的機(jī)構(gòu)洼畅。

SMC:Safey Monitoring Committee?安全監(jiān)測(cè)委員會(huì)吩案。我在網(wǎng)上也沒(méi)搜到相關(guān)的具體的解釋?zhuān)业母杏X(jué)是專(zhuān)門(mén)評(píng)判藥物安全性的機(jī)構(gòu),之后來(lái)決定是否繼續(xù)進(jìn)行臨床試驗(yàn)帝簇。

一般data cut off,申辦方那邊會(huì)給個(gè)cut off date,這個(gè)大多數(shù)情況下可能是醫(yī)學(xué)提出的徘郭。當(dāng)申辦方提出data cut off需求的時(shí)候靠益,臨床試驗(yàn)還在繼續(xù)啊,數(shù)據(jù)也依然在錄入残揉,所以我們需要對(duì)超過(guò)cut off?date之后的數(shù)據(jù)進(jìn)行處理胧后。

對(duì)于交付給SMC的結(jié)果,第一我們可以直接從RAW data--TFL,這樣簡(jiǎn)潔明了抱环,省了不少事壳快;第二就是按照我們平時(shí)的標(biāo)準(zhǔn)流程,從aCRF-SDTM-ADaM-TFL,這個(gè)要看當(dāng)時(shí)項(xiàng)目進(jìn)行的具體進(jìn)度吧镇草,可能編程部門(mén)還沒(méi)開(kāi)始SDTM的編程眶痰,這時(shí)候只能從raw數(shù)據(jù)集開(kāi)始處理分析了,如果整個(gè)SDTM到TFL的程序都寫(xiě)好了梯啤,直接通過(guò)SDTM到TFL輸出需要交付給SMC的結(jié)果就好了凛驮。

至于cut off,也有兩種方式条辟,第一是直接對(duì)RAW數(shù)據(jù)集按照cut off date進(jìn)行處理黔夭,第二是在寫(xiě)SDTM的時(shí)候?qū)DTM數(shù)據(jù)集進(jìn)行cut?off。至于采取哪種方式羽嫡,聽(tīng)LSP的或者具體情況具體分析本姥。

這邊順便講一個(gè)對(duì)SDTM進(jìn)行cut off的不便之處,就是比如收集死亡信息杭棵,我們一般會(huì)記錄到DM domain和DD domain婚惫,如果要對(duì)SDTM進(jìn)行cut off,那么你就要同時(shí)改這兩個(gè)domain魂爪,但是你如果對(duì)RAW數(shù)據(jù)集進(jìn)行了處理先舷,直接跑程序就可以了。而且在SDTM處理的時(shí)候滓侍,因?yàn)榭赡馨╟ut off date之后的數(shù)據(jù)蒋川,所以你得先都讀進(jìn)SAS在進(jìn)行處理,無(wú)形中增加了工作量撩笆。

至于有了cut off date之后怎么cut off捺球?這時(shí)候你就需要跟申辦方郵件溝通好cut off rules,這個(gè)一般是統(tǒng)計(jì)師和醫(yī)學(xué)共同商量決定的夕冲。(在剛?cè)胄械臅r(shí)候氮兵,我一直以為數(shù)據(jù)只要我們SAS程序員和統(tǒng)計(jì)師處理好,寫(xiě)好報(bào)告就可以交給監(jiān)管機(jī)構(gòu)了歹鱼,但是不知道還有一個(gè)“醫(yī)學(xué)部”這么重要的部門(mén))泣栈。

所以cut off?rules是根據(jù)具體項(xiàng)目進(jìn)行cut 的,不要按照我這篇文章的rules進(jìn)行cut,我的文章只是一個(gè)參考(以對(duì)RAW數(shù)據(jù)集進(jìn)行處理為例)

對(duì)于受試者水平的數(shù)據(jù)南片,如果在cut off?date之后的篙悯,直接刪除就好了,所以DM一般也不會(huì)有這個(gè)人的記錄铃绒。

對(duì)于AE數(shù)據(jù)鸽照,如果是AESTDTC>=cut off date,一般也是刪除這條記錄;如果是在之前颠悬,但是AEENDTC結(jié)束日期在之后的矮燎,一般是把AEONGO改成“是”;

然后還有一些缺失日期或者部分日期的AE數(shù)據(jù)赔癌,對(duì)于缺失日期的數(shù)據(jù)一般都保留(去向統(tǒng)計(jì)師確認(rèn))诞外,畢竟不能丟失一些關(guān)鍵數(shù)據(jù)(有點(diǎn)寧可錯(cuò)殺一千,不放過(guò)一個(gè)的感覺(jué))灾票;然后部分日期的峡谊,如果可以明確判斷在之后的,直接刪除就好了刊苍,比如cut off date是2022-10-31既们,然后一條AE記錄開(kāi)始日期是2022-11,那么刪除;如果是2022-10正什,這個(gè)一般也是保留(去向統(tǒng)計(jì)師確認(rèn))

還有一個(gè)需要確認(rèn)的東西是:一般AE會(huì)記錄一個(gè)初始CTCAE等級(jí)啥纸,然后開(kāi)始日期在cut off?date之前,然后還會(huì)有一個(gè)最高CTCAE等級(jí)婴氮,但是在cut off?date之后斯棒,怎么處理?這個(gè)去問(wèn)統(tǒng)計(jì)師主经,可能不同的公司處理方法不一樣荣暮,有的可能是直接將日期和最高CTCAE等級(jí)置空,有的可能是保留下來(lái)罩驻,即使達(dá)到最高CTCAE等級(jí)的日期在cut off date之后穗酥。

除了看安全性,還有一個(gè)就是療效性鉴腻,所以醫(yī)學(xué)可能會(huì)建議只納入給藥的受試者迷扇,然后腫瘤評(píng)估數(shù)據(jù)百揭,可能來(lái)自好多個(gè)數(shù)據(jù)集爽哎,尤其是對(duì)總體療效是PD的和非PD的,PD可能取當(dāng)前訪視對(duì)應(yīng)的最早的影像學(xué)掃描日期器一,非PD就取當(dāng)前訪視對(duì)應(yīng)的最晚的影像學(xué)掃描日期课锌,如果提前處理了,可能會(huì)影響日期判斷,所以建議是先不處理渺贤,等輸出結(jié)果后雏胃,再對(duì)照RAW數(shù)據(jù)集和rules進(jìn)行綜合判斷,所以LSP需要費(fèi)心一點(diǎn)志鞍。

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