NGS-文庫(kù)的構(gòu)建

NGS

DNA文庫(kù)構(gòu)建

當(dāng)我們使用二代測(cè)序技術(shù)對(duì)樣本進(jìn)行測(cè)序時(shí)郎仆,主要經(jīng)過(guò)樣本核酸提取喊括、文庫(kù)構(gòu)建、上機(jī)測(cè)序、數(shù)據(jù)分析和結(jié)果驗(yàn)證幾個(gè)步驟揖铜。其中,DNA文庫(kù)構(gòu)建是二代測(cè)序技術(shù)的基礎(chǔ)旺坠,DNA文庫(kù)構(gòu)建的本質(zhì)就是在將待測(cè)定樣本的大片段基因組DNA片段化為小片段的DNA堂淡,之后在小片段DNA分子兩端添加測(cè)序接頭,形成能上機(jī)測(cè)序有效的文庫(kù)分子的過(guò)程逊谋。具體的二代測(cè)序小片段DNA文庫(kù)構(gòu)建流程包括DNA片段化擂达、末端修復(fù)、A尾添加胶滋、接頭連接和PCR富集五步板鬓。(下圖是適用于Illumina平臺(tái)的DNA快速建庫(kù)流程)

文庫(kù)構(gòu)建流程

以下是某公司產(chǎn)品簡(jiǎn)介,主要為文庫(kù)構(gòu)建試劑盒究恤,可大致了解文庫(kù)構(gòu)建的整個(gè)環(huán)節(jié)俭令。


建庫(kù)試劑盒
其中一款試劑盒的時(shí)間安排

RNA文庫(kù)構(gòu)建

二代測(cè)序RNA文庫(kù)的構(gòu)建,根據(jù)RNA的種類主要分為mRNA文庫(kù)部宿、lncRNA文庫(kù)抄腔、small RNA文庫(kù)等。mRNA和lncRNA文庫(kù)構(gòu)建流程包括RNA富集、RNA片段化妓柜、cDNA第一鏈及第二鏈的合成箱季、末端修復(fù)、A尾添加及PCR富集棍掐。RNA富集是mRNA及l(fā)ncRNA文庫(kù)構(gòu)建前的必要步驟藏雏,這是因?yàn)閞RNA在總RNA中占比超過(guò)80%,如不進(jìn)行rRNA去除操作作煌,mRNA及l(fā)ncRNA文庫(kù)的測(cè)序數(shù)據(jù)中絕大部分為rRNA的相關(guān)數(shù)據(jù)掘殴,不利于全面深入的分析mRNA及l(fā)ncRNA的表達(dá)差異及序列變化。Small RNA文庫(kù)與mRNA及l(fā)ncRNA文庫(kù)的構(gòu)建流程是不一樣的粟誓,主要包括3'接頭連接及封閉奏寨、5'接頭連接、cDNA合成鹰服、PCR富集病瞳。基于Illumina平臺(tái)的悲酷。


RNA操作流程如圖所示:
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