孟德爾隨機化分析（MR）典型實例：大胸女生與不愛運動之間的關(guān)系
孟德爾隨機化是利用基因型數(shù)據(jù)來研究兩個表型之間是否有因果關(guān)系。
可以使用GSMR包來進行MR分析。
基于TWAS的孟德爾隨機化分析工具 PMR 論文 PMR github
PMR是用于轉(zhuǎn)錄組關(guān)聯(lián)研究（TWAS）中兩個樣本MR分析的有效統(tǒng)計推斷的R包
TWAS的前景和現(xiàn)狀 2019.03 NG
TWAS 2019.03 NG
全轉(zhuǎn)錄組分析實戰(zhàn)代碼
TWAS是基于GWAS的結(jié)果，但是因為轉(zhuǎn)錄組中基因表達部位的特異性喇勋，可能會造成假陽性姨蝴。例如：本來是在葉片中發(fā)揮作用的基因肩杈，但是轉(zhuǎn)錄組測的部位卻是花藥财松，就會有偏差。
使用孟德爾隨機化包TwoSampleR的報錯問題匯總：
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Error in r$status_code : $ operator is invalid for atomic vectors遇到這個報錯是因為沒有加載ieugwasr這個包纪挎。
library("ieugwasr")加載之后即可。
2.運行bmi2014_exp_dat <- extract_instruments(outcomes = 'ieu-a-2')報錯如下：
Server code: 502; Server is possibly experiencing traffic, trying again...這個報錯跟匆，是無法訪問在線服務(wù)器异袄。首先打開 http://gwas-api.mrcieu.ac.uk/這個鏈接，如果不能訪問玛臂，就是這個網(wǎng)站的服務(wù)器的問題烤蜕。
使用ieugwasr::tophits("ukb-a-114")這個命令可以看到完整的報錯信息。
